KDM4D
リジン特異的デメチラーゼ4Dは、ヒトではKDM4D遺伝子によってコードされる酵素です。 KDM4Dは、α-ケトグルタル酸依存性ヒドロキシラーゼスーパーファミリーに属しています。 KDM4D 利用可能な構造 PDB オーソログ検索:PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
3DXT、3DXU、4D6Q、4D6R、4D6S、4HON、4HOO、5FP9、5F5A、5FP8、5FPA、5FPB、5FP4、5F5C _ _ _ _ _ _
識別子
エイリアス
KDM4D、JMJD2D、リジンデメチラーゼ4D
外部ID
OMIM:609766 MGI:3606484 HomoloGene:69244 GeneCards:KDM4D
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 11番染色体(ヒト)
バンド 11q21 始める
94,973,709 bp
終わり
94,999,519 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 9番染色体(マウス)
バンド
9 | 9 A1- A2
始める
14,373,844 bp
終わり
14,411,778 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
精子
二次卵母細胞
ランゲルハンス島
子宮内膜の間質細胞
神経節の卓越性
前頭前皮質
卵管
左副腎
横紋筋組織
脚の筋肉
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
オキシドレダクターゼ活性
ジオキシゲナーゼ活性
金属イオン結合
ヒストンデメチラーゼ活性
ヒストンH3-メチル-リジン-9デメチラーゼ活性
GO:00001078、GO:0001214、GO:0001206 DNA結合転写リプレッサー活性、RNAポリメラーゼII特異的
クロマチン結合
損傷したDNA結合
クロマチンDNA結合
メチル化ヒストン結合
細胞成分
血液微粒子 核 核質
二本鎖切断のサイト
ペリセントリックヘテロクロマチン
ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体
生物学的プロセス
タンパク質リン酸化の調節
電離放射線に対する細胞応答
転写の調節、DNAテンプレート
クロマチン結合の正の調節
相同組換えによる二本鎖切断修復
転写、DNAテンプレート
非相同末端結合による二本鎖切断修復の正の調節
ヒストンH3-K9脱メチル化
RNAポリメラーゼIIによる転写の負の調節
クロマチン構成
DNA損傷刺激に対する細胞応答
ヒストンH3-K9トリメチル化の負の調節
クロマチンリモデリング
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez55693 244694 Ensembl ENSG00000186280 ENSMUSG00000053914 UniProt Q6B0I6 Q3U2K5
RefSeq(mRNA)NM_018039 NM_173433
RefSeq(タンパク質)NP_060509 NP_775609
場所(UCSC)
Chr 11:94.97 – 95 Mb
Chr 9:14.37 – 14.41 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/
2017年、この遺伝子のメッセンジャーRNAは、体細胞核移植実験で使用され、胚後ドナー材料から最初の2つのクローン霊長類が生成されました。 同様の実験が、2018年にウシ種のクローニング効率を高めるために実施されました。
ウィキニュースには関連ニュースがあります:
上海で生まれた健康なクローンサル
参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000186280 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38:Ensemblリリース89:ENSMUSG00000053914 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 加藤M、加藤M。「インシリコでのJMJD2ファミリー遺伝子の同定と特性評価」。腫瘍学の国際ジャーナル。24(6):1623–8。土井:10.3892/ijo.25.3.759。PMID15138608。_ ^ 「EntrezGene:2Dを含むJMJD2Djumonjiドメイン」。
^ Liu Z、Cai Y、Wang Y、Nie Y、Zhang C、Xu Y、Zhang X、Lu Y、Wang Z、Poo M、Sun Q。「体細胞核移植によるアカゲザルのクローニング」。セル。172(4):881–887.e7。土井:10.1016/j.cell.2018.01.020。PMID29395327。_ ^ スタインR(2018年1月24日)。「中国の科学者は、羊のドリーを作成した方法を使用してサルのクローンを作成します」。NationalPublicRadio 。
^ Liu X、Wang Y、Gao Y、Su J、Zhang J、Xing X、Zhou C、Yao K、An Q、Zhang Y。「H3K9デメチラーゼKDM4Eは、ウシ胚発生のエピジェネティックな調節因子であり、核の再プログラミングの欠陥因子です」。開発。145(4):dev158261。土井:10.1242/dev.158261。PMID29453221。_
参考文献
シンS、ヤンクネヒトR。「ヒストンデメチラーゼJMJD2AおよびJMJD2Dによるアンドロゲン受容体の活性化」。生化学的および生物物理学的研究コミュニケーション。359(3):742–6。土井:10.1016/j.bbrc.2007.05.179。PMID17555712 。_
Whetstine JR、Nottke A、Lan F、Huarte M、Smolikov S、Chen Z、Spooner E、Li E、Zhang G、Colaiacovo M、Shi Y。「ヒストンデメチラーゼのJMJD2ファミリーによるヒストンリジントリメチル化の逆転」。セル。125(3):467–81。土井:10.1016/j.cell.2006.03.028。PMID16603238 。_ S2CID14461740 。_
Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB(1996年9月)。「正規化と減算:遺伝子発見を容易にする2つのアプローチ」。ゲノム研究。6(9):791–806。土井:10.1101/gr.6.9.791。PMID8889548 。_
ポータル:
生物学
人間の11番染色体上の遺伝子に関するこ”