LAGLIDADG_RNA_motifs
LAGLIDADG RNAモチーフは、バイオインフォマティクスによって発見された保存されたRNA構造です。これらのRNAモチーフは、LAGLIDADG品種のエンドヌクレアーゼをコードする遺伝子に関連しています。グループIイントロンは、LAGLIDADGエンドヌクレアーゼを使用する自己複製要素に存在することがよくありますが、既知のLAGLIDADG RNAモチーフは小さすぎて構造的に単純であるため、自己複製イントロンとして機能しません。 LAGLIDADG-2 LAGLIDADG-2RNAの
コンセンサス
二次構造と配列保存 識別子
シンボルAGLIDADG-2 Rfam F03094
その他のデータ
RNAタイプ
遺伝子; sRNA
それで SO：0001263 PDB構造 PDBe LAGLIDADG-1モチーフRNAは、真菌 Trametes cingulataだけでなく、おそらく他の真菌に由来する多くのメタゲノム配列で予測されます。LAGLIDADG-2モチーフRNAはHalobacteriaに見られます。LAGLIDADG-1 RNAがシス調節エレメントとして機能するのか、それともトランスで機能するのかはあいまいです。
参考文献
^ Weinberg Z、LünseCE、Corbino KA、Ames TD、Nelson JW、Roth A、Perkins KR、Sherlock ME、Breaker RR。「遺伝子間領域の特定のサブセットの比較分析による224の候補構造化RNAの検出」。NucleicAcidsRes。45（18）：10811–10823。土井：10.1093 / nar/gkx699。PMC5737381 。_ PMID28977401 。_