LARP1
La関連タンパク質1(LARP1)は、ヒトではLARP1遺伝子によってコードされる150kDaのタンパク質です。 LARP1は、哺乳類のラパマイシン複合体1(mTORC1)シグナル伝達経路の新しい標的であり、主にタンパク質合成の調節を通じて細胞の成長と増殖を調節する、癌でしばしば過剰に活性化される回路です。 LARP1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索:PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
4ZC4、5C0V _ _
識別子
エイリアス
LARP1、LARP、Laリボ核タンパク質ドメインファミリーメンバー1、Laリボ核タンパク質1、翻訳調節因子、Lar1、Lhp1
外部ID
OMIM:612059 MGI:1890165 HomoloGene:9089 GeneCards:LARP1
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 5番染色体(ヒト)
バンド 5q33.2 始める
154,682,986 bp
終わり
154,817,605 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 11番染色体(マウス)
バンド
11 | 11 B1.3
始める
57,899,890 bp
終わり
57,952,860 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
上前庭神経核
脊髄神経節
中側頭回
三叉神経節
幽門
ブロードマンの脳地図23
腎髄質
ポン
舌の上面
乳首
その他の参照式データ BioGPS その他の参照式データ
遺伝子オントロジー
分子機能
RNAキャップ結合
翻訳アクティベーターアクティビティ
翻訳開始因子結合
GO:0001948タンパク質結合
真核生物開始因子4E結合
mRNA3′-UTR結合
mRNA5′-UTR結合
RNA結合
カドヘリン結合
RNA7-メチルグアノシンキャップ結合
リボソーム小サブユニット結合
細胞成分
細胞質
TORC1コンプレックス 膜 ポリソーム
細胞質ストレス顆粒
ポリソームリボソーム
生物学的プロセス
翻訳開始
マクロオートファジーの正の調節
ウイルスゲノム複製の正の調節
細胞集団の増殖
TORシグナリング
タンパク質生合成
翻訳の積極的な規制
翻訳の負の規制
TORC1シグナリング
mRNAの安定化
ラパマイシンに対する細胞応答
アミノ酸飢餓への反応
翻訳の規制
翻訳開始の負の調節
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez23367 73158 Ensembl ENSG00000155506 ENSMUSG00000037331 UniProt Q6PKG0 Q6ZQ58
RefSeq(mRNA)
NM_015315 NM_033551 NM_001367713 NM_001367714 NM_001367715
NM_001367716 NM_001367717 NM_001367718 NM_001367719 NM_028451 RefSeq(タンパク質)
NP_056130 NP_001354642 NP_001354643 NP_001354644 NP_001354645
NP_001354646 NP_001354647 NP_001354648 NP_291029 NP_082727 場所(UCSC)
Chr 5:154.68 – 154.82 Mb
Chr 11:57.9 – 57.95 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/編集
関数
LARP1は、LARPタンパク質の7メンバーファミリーの中で最大のものです(その他は、LARP1B、LARP3(別名、本物のLaまたはSSB)、LARP4A、LARP4B、LARP6、およびLARP7です)。ヒトLARPを含むすべてのLARPタンパク質には、2つの保存領域が含まれています。最初の保存領域はLaタンパク質(Laモチーフと呼ばれます。SSBを参照)と相同性を共有しますが、2番目の保存領域(LAモチーフと呼ばれる)はLARPタンパク質に制限されます。LARP1と1Bには、C末端内に保存された「DM15領域」も含まれています。この領域は独特であり、RNA結合に必要であることが示されています。マウスLarp1は、後根神経節と脊髄、および上皮間葉相互作用を特徴とする発達中の臓器で発現します。ヒトLARP1は、正常な非胚性細胞に低レベルで存在しますが、上皮癌(卵巣癌、結腸直腸癌、前立腺癌、非小細胞肺癌、肝細胞癌、子宮頸癌など)で高度に発現しています。 いくつかの研究では、高レベルのLARP1タンパク質が癌患者の予後不良と相関していることが示されています。
LARP1は、末端オリゴピリミジンモチーフ(TOP mRNA )に結合して翻訳を調節し、mRNAの5’キャップと直接相互作用することができます。 他の遺伝子の3’末端およびコード領域(CDS)と相互作用することも示されています。 LARP1タンパク質は、RNAの貯蔵と分解で機能するストレス顆粒およびP-body と共局在します。LARP1はP-bodyで機能し、保存されたRas – MAPKmRNAの存在量を減衰させることが示唆されています。LARP1ホモログのクラスターは、主要な発達調節因子の発現を制御するように機能する可能性が
いくつかの研究は、LARP1の欠損がポリソームへのTOPmRNAの動員に選択的に影響を与えることを示しています。一部の癌細胞では、LARP1の欠損により増殖が抑制され、アポトーシス細胞死が活性化されます。 TOP mRNAによってコードされるタンパク質の量の減少がLARP1サイレンシング細胞で報告されていますが、一部の研究者は、これはLARP1欠損細胞のTOPmRNA転写産物の数の減少によって簡単に説明できると信じています。
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ヒト5番染色体上の遺伝子に関するこ
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