ModBase
ModBaseは、 380 万を超える固有のタンパク質配列のモデルを含む、注釈付きの比較タンパク質構造モデルのデータベースです。モデルは、 MODELLERプログラムに依存する比較モデリングパイプラインModPipeによって作成されます。
ModBase
コンテンツ
説明
比較タンパク質構造モデルのデータベース
コンタクト
リサーチセンター
カリフォルニア大学サンフランシスコ校
ラボ
生物工学・治療科学科
著者
ウルスラ・ピーパー、エスワー・ナラヤナン、ベン・ウェッブ、アンドレイ・サリ
一次引用
パイパー＆アル。（2011)
発売日 1998年 アクセス
Webサイト
http://salilab.org/modbase
ダウンロードURL
ftp://salilab.org/databases/modbase
Web サービスURL
http://salilab.org/modweb
ModBase は、UCSF の Andrej Sali の研究室で開発されています。ModBase モデルは、 Protein Model Portalからもアクセスできます。
こちらもご覧ください
相同性モデリング
参考文献
^ ピーパー、ウルスラ。Webb ベンジャミン M; バーカン デビッド T; Schneidman-Duhovny Dina; シュレシンガー・アヴナー。ブラバーグ・ハンネス; ヤン・チェン; Meng Elaine C; ペッターセン エリック F; 黄コンラッド C; Datta Ruchira S; サンパスクマール・パルタサラティ。Madhusudhan Mallur S; シェーランダー・キンメン; フェリン トーマス E; バーリー・スティーブン・K; サリ アンドレイ 。「ModBase、注釈付き比較タンパク質構造モデルのデータベース、および関連リソース」 . 核酸解像度。イングランド。39 (データベースの問題): D465-74. ドイ: 10.1093/nar/gkq1091 . PMC 3013688 . PMID 21097780。
外部リンク
http://salilab.org/modbase
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