NAALADL2


NAALADL2
N-アセチル化アルファ結合酸性ジペプチダーゼ様 2 (NAALADL2) は、ヒトの遺伝子NAALADL2によってコードされるタンパク質です。NAALADL2は、前立腺癌マーカー PSMA ( FOLH1 / NAALAD1 ) を含むグルタミン酸カルボキシペプチダーゼ IIファミリーと 25% ~ 26% の配列同一性と 45% の配列類似性を共有しています。 NAALADL2 遺伝子は、平均遺伝子サイズ 28 kb の約 49 倍の 1.37 Mb に及ぶ巨大な遺伝子です。 遺伝子の長さは、遺伝子の転写バリアントの数と相関しており、NAALADL2は広範なオルタナティブ スプライシングを受け、Ensembl によって定義されているように 12 のスプライス バリアントを持っています。
ナアラドル2
識別子
エイリアス
2810043G22RikEG635702Gm1021N-アセチル化アルファ結合酸性ジペプチダーゼ様 2NAALADL2
外部 ID
ホモロジーン: 45786ジーン カード:
遺伝子の位置 (ヒト) Chr. 染色体 3 (ヒト)
バンド
3|3 A3
始める
23,852,266塩基対
終わり
25,198,425塩基対
RNA発現パターン
ブギー
人間
マウス(オルソログ)
トップ表現
尿道
二次卵母細胞
網膜色素上皮
結膜円蓋
坐骨神経
前庭迷路
尿路上皮 黒質 お腹
頭蓋冠
なし
より多くの参照発現データ
バイオGPS
なし
遺伝子オントロジー
分子機能
分子機能
細胞成分 膜 膜の不可欠なコンポーネント
核質
生物学的プロセス
生物学的プロセス
細菌への応答
ソース:アミーゴ/ QuickGO
オルソログ 種族 人間
ねずみ
エントレズ 635702 なし
アンサンブル ENSMUSG00000102758 なし
ユニプロット A0A0N4SUJ3 なし
RefSeq (mRNA) NM_001326288 なし
RefSeq (タンパク質) NP_001313217 なし
場所 (UCSC)
Chr 3: 23.85 – 25.2 Mb
なし
PubMed検索
なし
ウィキデータ
人間の表示/編集

コンテンツ
1 関数
2 臨床的な意義
2.1 癌 2.2 壊れやすいサイト
3 参考文献

関数
NAALADL2 の現在の機能は不明です。NAALADL2は、N-アセチル化アルファ結合酸性ジペプチダーゼおよびトランスフェリン受容体と有意な相同性を示します。NAALADL2は、M28B メタロペプチダーゼ ファミリーとある程度の相同性を共有していますが、高度に保存され、メタロペプチダーゼ機能にとって重要な特定の重要な位置に好ましいアミノ酸を持っ

臨床的な意義
NAALADL2は、 3q26.3でコーネリア デ ランゲ関連転座 ブレークポイントによって切断されることが示されています。
NAALADL2 の rs17531088 SNPは、合計 893 KD 症例と集団および家族対照を含む 2 つの独立したコホートを含む大規模なGWASで川崎病に関連していることが示されました。


NAALADL2 は、前立腺癌に関与することが示されています。 NAALADL2 タンパク質の発現は、前立腺腫瘍の病期と関連しており、mRNA 発現のグレードと関連しており、小規模なコホートでの根治的前立腺全摘除術後の生存率の低下を予測しています。細胞株における NAALADL2 の過剰発現は、その後、細胞外マトリックス (ECM) 成分への結合を変化させ、前立腺癌細胞の浸潤能を増強しました。細胞株で NAALADL2 の発現が人為的に増加すると、細胞周期、細胞接着、上皮から間葉への移行、および細胞骨格のリモデリングに関与する遺伝子が変更されました。これらの結果は、NAALADL2 が侵攻性前立腺癌を促進するように作用する可能性があることを示唆しています。
12,518 例の前立腺がん症例のゲノムワイド関連研究 (GWAS)で、SNP が見つかりました。rs78943174、3q26.31 ( NAALADL2 ) 遺伝子座内で、高いグリーソン合計スコアに関連付けられています。共通の転写因子結合部位内で発生する SNP の 2 番目の研究では、SNP が特定されました。GATA2モチーフ内のrs10936845。この SNP は、前立腺癌患者におけるNAALADL2発現の発現を増加させ、発現の増加は生化学的再発も予測します。
前立腺がんでは、NAALADL2の体細胞コピー数の増加が限局性疾患の患者の約 16% に見られ、グリーソン グレード5 疾患の 30%、 T ステージ4 疾患の 50% に増加しています。隣接する癌遺伝子TBL1XR1と共起。 NAALADL2におけるCNA増加の頻度は、グリーソン グレード、腫瘍の病期、切除断端陽性、リンパ節に転移したがんなど、進行性前立腺がんの多くの臨床的特徴と関連しています。この遺伝子領域でのコピー数増加の頻度は、去勢抵抗性および神経内分泌前立腺がんでも増加します。 NAALADL2を取り囲む領域は、がん遺伝子が豊富です。 NAALADL2のコピー数の増加は、BCL6、ATR、および PI3K ファミリー メンバーを含む隣接する癌遺伝子と共起することがよく DNA レベルでのコピー数の増加は、450 を超える既知の癌遺伝子における mRNA 発現の変化と関連しており、この領域が侵攻性前立腺癌の進行に重要である可能性があることを示唆しています。
転移性去勢抵抗性前立腺癌 (mCRPC) の研究では、NAALADL2 のアンチセンス鎖( NAALADL2-AS2) が健康なボランティアと比較して mCRPC 患者で 2 倍以上高いことがわかりました。 NAALADL2-AS2の発現が高い患者は、発現が低い患者と比較してエンザルタミドに対する反応が改善された。
乳癌では、多細胞腫瘍スフェロイド (MTS) は、分化した細胞間結合と定義された微小環境を獲得する3D 細胞培養であり、2D単培養と比較した場合、 EPCAM、E-カドヘリン、インテグリン、シンデカンなどの多数の接着分子を特異的に発現します。 NAALADL2 は、2D 培養と比較した場合、MTS で異なって発現することが示されています。これらの結果は、細胞間相互作用における NAALADL2 の役割を支持しており、NAALADL2 が細胞-ECM 相互作用に影響を与えることを発見した前立腺癌の証拠と一致しています。
NAALADL2の SNP は、乳癌および肺癌の癌リスク GWAS でも特定されています。

壊れやすいサイト
NAALADL2をコードする遺伝子は、壊れやすく修復されやすいゲノム遺伝子座である壊れやすい部位に位置することが示されています。 がんでは、NAALADL2内に位置する脆弱部位が、すべての脆弱部位の中で5番目に大きく変化していることが最近示されている。したがって、NAALADL2 のコピー数の増加と、 GATA2、PIK3CB、ATR、SMC4、TBL1XR1、SOX2、MUC4などの周囲の癌遺伝子の増加は、この領域での切断と試みられたゲノム修復によって生じる可能性が高いことが示唆されています。 . この壊れやすい部位が壊れると、フォーク失速およびテンプレート スイッチング (FoSTeS) として知られるプロセスによって、壊れた部分を囲む領域の遺伝子の余分なコピーが複製される可能性が NAALADL2およびそれを取り囲む遺伝子の余分なコピー (コピー数の増加) は、これらの遺伝子のmRNA 発現を増加させ、成長と増殖に関与する癌関連経路のさらなる調節不全と活性化につながることが示されています。

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