NACHT_domain
NACHTドメインは、進化的に保存されたタンパク質ドメインです。このNTPaseドメインは、 MHC転写に関与するタンパク質だけでなく、アポトーシス タンパク質にも見られます。その名前は、それを含むいくつかのタンパク質を反映しています: NAIP (NLP ファミリーアポトーシス阻害タンパク質)、CIITA (つまり、C2TA またはMHC クラス II転写活性化因子)、HET-E ( Podospora anserina由来の不和合遺伝子座タンパク質)、およびTEP1 (つまり、TP1 またはテロメラーゼ関連タンパク質)。
NACHTドメイン
識別子
シンボル
ナハト
プファム PF05729 インタープロ IPR007111 プロサイト PS50837 利用可能なタンパク質構造:
プファム
構造物/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造概要
NACHT ドメインには、300 ～ 400個のアミノ酸が含まれています。これは、動物、真菌、および細菌のタンパク質に見られる、予測されるヌクレオシド-トリホスファターゼ(NTPase) ドメインです。これは、 CARD ドメイン( InterPro : IPR001315 )、 pyrinドメイン( InterPro : IPR004020 )、HEAT リピート ドメイン( InterPro : IPR004155 )、WD40 リピート( InterPro : IPR001680 )、ロイシンなどの他のドメインと関連付けられています。-リッチ リピート(LRR) またはBIR リピート( InterPro : IPR001370 )。
NACHT ドメインは、ATP/GTPase 特異的 P ループ、Mg 2+結合部位 (それぞれWalker A および B モチーフ)、および 5 つのより特異的なモチーフを含む 7 つの異なる保存モチーフで構成されています。NACHT ドメインのユニークな特徴には、ウォーカー B モチーフの Mg 2+配位アスパラギン酸の直接 C 末端にある「小さな」残基 (グリシン、アラニン、またはセリン) の普及が含まれます。 NTPase。2 番目の酸性残基は通常、NACHT 含有タンパク質の 2 位置下流に見られます。さらに、遠位モチーフ VII には、他の NTPase ファミリーには見られない極性残基、芳香族残基、疎水性残基の保存パターンが含まれています。
例
このドメインを含むヒトタンパク質には以下が含まれます：
チータ NAIP NLRC3、NLRC4、NLRC5
NLRP1、NLRP2、NLRP3、NLRP4、NLRP5、NLRP6、NLRP7、NLRP8、NLRP9、NLRP10、NLRP11、NLRP12、NLRP13、NLRP14、NLRX1NOD1、NOD2 NWD1
TEP1
参考文献
^ Koonin EV、Aravind L 。「NACHT ファミリー – アポトーシスと MHC 転写活性化に関与する予測された NTPase の新しいグループ」. 生化学科学の動向。25 (5): 223–4. ドイ：10.1016/S0968-0004(00)01577-2 . PMID 10782090。
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