NADH_peroxidase
酵素学では、NADH ペルオキシダーゼ( EC 1.11.1.1 ) は化学反応を触媒する酵素です。
NADHペルオキシダーゼ
Enterococcus faecalis 由来の NADH ペルオキシダーゼの構造。PDBから適応: 2NPX .
識別子
EC番号
1.11.1.1
CAS番号
9032-24-0
データベース
インテンツ
IntEnz ビュー
ブレンダ
ブレンダエントリー ExPASy NiceZyme ビュー KEGG KEGGエントリー
メタサイク
代謝経路
プリアム
プロフィール
PDB構造
RCSB PDB PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー
アミGO / QuickGO索 PMC
記事 PubMed 記事 NCBI タンパク質
NADH + H + + H 2 O 2 ⇌ { rightleftharpoons }
NAD + + 2 H 2 O
NADH ペルオキシダーゼの推定機能は、H 2 O 2が必須の細胞成分に損傷を与える前に、グリセロール代謝またはスーパーオキシドの不均化中に、例えばグリセロール-3-リン酸オキシダーゼによって細胞内で生成された H 2 O 2を不活性化することです。
この酵素の 3つの基質はNADH、H +、およびH 2 O 2であり、その 2 つの生成物はNAD +およびH 2 Oです。それは 1 つの補因子FADを使用しますが、別個の FADH 2中間体は観察され
この酵素は、酸化還元酵素のファミリーに属し、具体的には受容体として過酸化物に作用するもの (ペルオキシダーゼ) です。この酵素クラスの体系的な名前は、 NADH:過酸化水素酸化還元酵素です。一般的に使用される他の名前には、DPNH ペルオキシダーゼ、NAD ペルオキシダーゼ、ジホスホピリジン ヌクレオチド ペルオキシダーゼ、 NADH-ペルオキシダーゼ、ニコチンアミド アデニン ジヌクレオチド ペルオキシダーゼ、およびNADH2 ペルオキシダーゼが含まれます。
コンテンツ
1 構造
2 反応機構
3 生体機能
4 参考文献
構造
NADH ペルオキシダーゼの結晶構造は、補欠分子族 FAD のコンフォメーションと同様に、鎖の折り畳みと位置に関してグルタチオン レダクターゼに似ています。
NADH ペルオキシダーゼの His10 は、FAD 結合部位内の R1 ヘリックスの N 末端付近に位置しています。 Cys42-SO 3 H の酸素原子の 1 つは、His10イミダゾールと Cys42 N 末端の両方に水素結合しています。His10 は、異常な Cys42-SOH レドックス センターを安定化するために部分的に機能します。 Arg303 は、Cys42-SO 3 H も安定化します。Glu-14 は、スルフェン酸の酸化状態を維持するために重要な、溶媒へのアクセスを制限するタイトな二量体界面の形成に関与します。
PDB 2NPX から適応した、NADH ペルオキシダーゼにおける NADH、FAD、およびシステイン 42 のアラインメント
NADHペルオキシダーゼの活性部位機能に不可欠な4つの残基、PDB 2NPXから適応
反応機構
Enterococcus faecalis由来の NADH ペルオキシダーゼは、Cys42 チオール/スルフェン酸 (-SH/-SOH) 酸化還元対を過酸化物結合のヘテロリティック切断に利用して、過酸化水素の水への 2 電子還元を触媒するという点で独特です。
野生型ペルオキシダーゼの速度論的メカニズムには、(1) 初期プライミング段階での E(FAD、Cys42-SOH) の EH 2 (FAD、Cys42-SH) への NADH 還元が含まれます。（２）ＥＨ２へのＮＡＤＨの迅速な結合。(3) Cys42-チオラートによるH 2 O 2の還元、E・NADHの生成。（４）結合ＮＡＤＨからの律速ヒドリド移動、ＥＨ２の再生。しかし、別個の FADH 2中間体は観察されておらず、Cys42-SOH 還元の正確な詳細は解明され
E + NADH (EH 2 ‘•NAD + )* EH 2 ‘•NAD + EH 2 + NAD + + H 2 O
EH 2 + NADH EH 2 •NADH*
EH 2 •NADH* + H 2 O 2 E•NADH + H 2 O
E•NADH + H + EH 2 •NAD + + H 2 O
EH 2 •NAD + EH 2 + NAD +
阻害剤には、Ａｇ＋、Ｃｌ－、Ｃｏ２＋、Ｃｕ２＋、Ｈｇ２＋、ＮａＮ３、Ｐｂ２＋、およびＳＯ４２－が含まれる。最適以下の H 2 O 2濃度と飽和している NADH の濃度では、NADH は酵素を不安定な中間体に変換することにより、NADH ペルオキシダーゼのペルオキシダーゼ活性を阻害します。NAD +は、不安定な中間体をもたらす平衡を逆転させることによって活性化因子として作用し、酵素を速度論的に活性な複合体に変換して H 2 O 2を還元します。
生体機能
NADH は、有酸素増殖条件下で潜在的に有毒な過酸化水素を排除し、H 2 O 2を介した酸化ストレスに対して利用可能な酵素的防御を表します。第二に、この酵素は、この生物の厳密な発酵代謝に不可欠なNAD +の再生のための追加のメカニズムを提示します。 この酵素は、外因性の H 2 O 2から保護し、細菌の病原性にも寄与する可能性が
植物におけるNADHペルオキシダーゼとオキシダーゼの実際の機能はまだ不明ですが、H 2 O 2の生成を通じて酸化ストレスの初期シグナル伝達に作用する可能性が
別の役割には、細胞壁の弛緩および再構築におけるNADHペルオキシダーゼおよびオキシダーゼによるH 2 O 2形成の調節が含まれる可能性が
参考文献
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生物学”