nhaA -II RNA モチーフ


NhaA-II_RNA_motif

 「NhaA-II RNA モチーフ」  
nhaA -II RNA モチーフは、バイオインフォマティクスによって発見された保存されたRNA構造です。 nhaA -II モチーフはカウロバクター目で見られます。 nhaA-II nhaA-II RNAの
コンセンサス二次構造と配列保存
識別子
シンボル nhaA-II ラファム RF03038 その他のデータRNA型 スreg
それで SO:0005836 PDB構造 PDBe nhaA -II モチーフ RNAは、タンパク質をコードする遺伝子の上流に位置することから、シス調節エレメントとして機能する可能性が高い. nhaA -I RNA は通常、ナトリウムイオンとプロトンの交換体をコードする遺伝子の上流に存在します。まれに、 S-アデノシルメチオニンをドナーとして使用するメチルトランスフェラーゼの上流にも存在します。

参考文献
^ Weinberg Z、Lünse CE、Corbino KA、Ames TD、Nelson JW、Roth A、Perkins KR、Sherlock ME、Breaker RR . 「遺伝子間領域の特定のサブセットの比較分析による 224 の候補構造化 RNA の検出」 . 核酸解像度。45 (18): 10811–10823。ドイ: 10.1093/nar/gkx699 . PMC  5737381 . PMID  28977401。