NhaA_family
Na + /H +アンチポーター A (NhaA) ファミリー( TC# 2.A.33 ) には、多くの細菌のナトリウム-プロトンアンチポーター(SPAP) タンパク質が含まれています。これらは、pH 依存性が高い方法でNa +に対する H +の交換を触媒する内在性膜タンパク質です。相同体は、多くの細菌や古細菌から配列決定されています。原核生物は複数のパラログを持っています。NhaA ファミリーに属するタンパク質の代表的なリストは、Transporter Classification Databaseに
Na + /H +アンチポーター 1
識別子
シンボル Na_H_antiport_1 プファム PF06965 インタープロPR004670 TCDB .A.36 OPM スーパーファミリー 106 OPM タンパク質 1zcd 利用可能なタンパク質構造:
プファム
構造物/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造概要 PDB 1zcd A: 4-380、4CZ8
コンテンツ
1 構造
2 関数
3 こちらもご覧ください
4 参考文献
5 参考文献
構造
NhaA ファミリーのタンパク質は、長さが 300 ～ 700 のアミノアシル残基です。大腸菌のNhaAはホメオダイマーであり、各サブユニットは 12 個の傾斜した膜貫通 α-ヘリックス (TMS) の束で構成されています。
NhaA の分子動力学シミュレーションにより、アンチポーター機能の原子レベルで詳細なモデルの提案が可能になりました。 3 つの保存されたアスパラギン酸残基が、この提案されたメカニズムの鍵となります。Asp 164 (D164) は Na +結合部位であり、D163 はこの結合部位の細胞質またはペリプラズムへの交互の接近性を制御し、D133 は pH 調節に重要です。
関数
Na + -H +アンチポーターは、細胞質膜および多くの細胞内膜を横切ってNa +を H +に交換する内在性膜タンパク質です。それらは、細胞の生存に不可欠なプロセスである Na +、pH、および体積の恒常性に不可欠です。 大腸菌のタンパク質は、外部の pH がアルカリ性である場合に内部の pH を調節する機能を果たしていると考えられ、このタンパク質は pH センサーとして効果的に機能します。また、H +勾配を使用して、細胞からNa +を追い出します。その活性は pH に大きく依存します。
NhaA によって触媒される一般化された輸送反応は次のとおりです。
Na + (イン) + 2H + (アウト) ⇌ Na + (アウト) + 2H + (イン)。
こちらもご覧ください
ナトリウム陽子アンチポーター
アンティポーター
トランスポーター分類データベース
参考文献
^ Williams KA、Geldmacher-Kaufer U、Padan E、Schuldiner S、Kühlbrandt W (1999 年 7月）。「大腸菌の二次輸送体である NhaA の投影構造を 4.0 A の解像度で」 . EMBOジャーナル。18 (13): 3558–63. ドイ: 10.1093/emboj/18.13.3558 . PMC 1171434 . PMID 10393172。
^ ウィリアムズ KA 。「イオン共役輸送タンパク質NhaAの三次元構造」。自然。403 (6765): 112–5. ビブコード: 2000Natur.403..112W . ドイ：10.1038/47534。PMID 10638764。S2CID 427512 . ^ a b次の場所にジャンプ:
フンテ C、スクレパンティ E、ベンチュリ M、リモン A、パダン E、ミシェル H 。「Na + / H +アンチポーターの構造と、pHによる作用と調節のメカニズムへの洞察」。自然。435 (7046): 1197–202. ビブコード: 2005Natur.435.1197H . ドイ: 10.1038/nature03692 . PMID 15988517。S2CID 4372674 .
^ Olkhova E、Hunte C、Screpanti E、Padan E、Michel H 。「機能的意味を持つ大腸菌の NhaA Na+/H+ アンチポーターのマルチコンフォメーション連続静電解析」 . アメリカ合衆国の国立科学アカデミーの議事録。103 (8): 2629–34. ビブコード: 2006PNAS..103.2629O . ドイ: 10.1073/pnas.0510914103 . PMC 1413810 . PMID 16477015。
^ Screpanti E、Padan E、Rimon A、Michel H、Hunte C 。「Na+/H+ アンチポーター NhaA のネイティブ構造における構造決定における重要なステップ」. 分子生物学のジャーナル。362 (2): 192–202. ドイ: 10.1016/j.jmb.2006.07.019 . PMID 16919297。
^ c次の場所にジャンプ:
Arkin IT、Xu H、Jensen MØ、Arbely E、Bennett ER、Bowers KJ、Chow E、Dror RO、Eastwood MP、Flitman-Tene R、Gregersen BA、Klepeis JL、Kolossváry I、Shan Y、Shaw DE . 「Na+/H+ アンチポーティングのメカニズム」。科学。317 (5839): 799–803. Bibcode : 2007Sci…317..799A . ドイ: 10.1126/science.1142824 . PMID 17690293。S2CID 30745070 . ^ a b次の場所にジャンプ:
Gerchman Y、Olami Y、Rimon A、Taglicht D、Schuldiner S、Padan E (1993 年 2月）。「ヒスチジン 226 は、大腸菌の Na+/H+ アンチポーターである NhaA の pH センサーの一部です」 . アメリカ合衆国の国立科学アカデミーの議事録。90 (4): 1212–6. ビブコード: 1993PNAS…90.1212G . ドイ: 10.1073/pnas.90.4.1212 . PMC 45842 . PMID 8381959。
^ a b次の場所にジャンプ:
パダン E 。「NhaA Na+-H+ アンチポーターにおける構造と機能の間の啓発的な出会い」. 生化学科学の動向。33 (9): 435–43. ドイ: 10.1016/j.tibs.2008.06.007 . PMID 18707888。
^ Radchenko MV、Waditee R、押見 S、福原 M、高部 T、中村 T 。「大腸菌における腸炎ビブリオ K+/H+ アンチポーター遺伝子のクローニング、機能発現、および一次特性評価」 . 分子微生物学。59 (2): 651–63. ドイ: 10.1111/j.1365-2958.2005.04966.x . PMID 16390457。S2CID 22001614 .
^ Diab M、Rimon A、Tzubery T、Padan E 。「NhaA Na(+)/H(+) アンチポーターのヘリックス VIII は、ペリプラズム カチオン通路とアンチポーターの pH 調節に参加します」. 分子生物学のジャーナル。413 (3): 604–14. ドイ: 10.1016/j.jmb.2011.08.046 . PMID 21907722。
^ 「2.A.33 NhaA Na+:H+アンチポーター (NhaA) ファミリー」 . トランスポーター分類データベース. 2016 年3 月14 日閲覧。
参考文献
Appel M、Hizlan D、Vinothkumar KR、Ziegler C、Kühlbrandt W 。「pH 活性化およびイオン移行状態における、大腸菌由来の Na/H 交換体である NhaA のコンフォメーション」。分子生物学のジャーナル。386 (2): 351–65. ドイ: 10.1016/j.jmb.2008.12.042 . PMID 19135453。
Herz K、Rimon A、Olkhova E、Kozachkov L、Padan E 。「NhaA Na+/H+ アンチポーターの膜貫通セグメント II は陽イオン通路を覆い、Asp65 はアンチポーターの pH 活性化に重要です」 . 生物化学ジャーナル。285 (3): 2211–20。ドイ: 10.1074/jbc.M109.047134 . PMC 2804377 . PMID 19923224。
Karpel R、Olami Y、Taglicht D、Schuldiner S、Padan E (1988 年 7月）。「大腸菌における Na+/H+ アンチポーター活性に影響を与える遺伝子 ant の配列決定」 . 生物化学ジャーナル。263 (21): 10408–14. ドイ：10.1016/S0021-9258(19)81531-4 . PMID 2839489。
Padan E、Venturi M、Gerchman Y、Dover N 。「Na(+)/H(+) アンチポーター」 . Biochimica et Biophysica Acta。1505 (1): 144–57. ドイ: 10.1016/s0005-2728(00)00284-x . PMID 11248196。
Padan E、Danieli T、Keren Y、Alkoby D、Masrati G、Haliloglu T、Ben-Tal N、Rimon A 。「10個のヘリックスを使用するNhaAアンチポーター機能と、さらに2個のヘリックスがアセンブリ/安定性に寄与する」 . アメリカ合衆国の国立科学アカデミーの議事録。112 (41): E5575-82。ビブコード: 2015PNAS..112E5575P . ドイ: 10.1073/pnas.1510964112 . PMC 4611637 . PMID 26417087。
Schushan M、Rimon A、Haliloglu T、Forrest LR、Padan E、Ben-Tal N 。「NhaA アンチポーターのペリプラズムに面した状態のモデル構造は、pH によって引き起こされるコンフォメーション変化の分子基盤を示唆しています」 . 生物化学ジャーナル。287 (22): 18249–61. ドイ: 10.1074/jbc.M111.336446 . PMC 3365733 . PMID 22431724。
ポータル:
生物学
この編集時点で、は「2.A.33 The NhaA Na+:H+Antiporter (NhaA) Family」のコンテンツを使用しており、 Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License の下で再利用を許可する方法でライセンスされていますが、GFDLの下ではありません。関連するすべての条件に従う必要が”