NhaB_family
NhaBファミリー( TC# 2.A.34 ) は、イオン輸送体 (IT) スーパーファミリーに属します。 NhaB ファミリーに属するタンパク質の代表的なリストは、Transporter Classification Databaseに
NhaB ホモログは、通常、長さが約 500 アミノアシル残基 (aas) であり、約 12 個の膜貫通型アルファヘリカル スパナ (TMS) を持っていますが、一部のメンバーは TMS の数が異なります。NhaB ホモログは、細菌、古細菌、および真核生物の砒酸耐性ポンプのメンバーとも相同である、 Mycobacterium leprae (spP46838)からの未知の機能の 46 kDa 膜タンパク質と限られた配列類似性を持つ領域も示します( TC# 3.A.4）。グラム陰性細菌タンパク質のみが機能的に特徴付けられています。
E. coli NhaB は、オーソログのVibrio alginolyticus Na + /H +アンチポーターと 58% 同一です。後者のタンパク質は 10 個の TMS を示すと予測されていますが、 NhaB-phoA融合体の構築により、N 末端が細胞質に、C 末端がペリプラズムにある 9 個の TMS モデルの証拠が得られました。 3rd TMS の中央に位置するアスパルチル残基は、ファミリーのすべてのメンバーで保存されており、活動にとって重要です。
大腸菌の NhaB によって触媒される一般化された輸送反応は次のとおりです。
2 Na + (イン) + 3 H + (アウト) ⇌ 2 Na + (アウト) + 3 H + (イン)。
こちらもご覧ください
ナトリウム水素アンチポーター
アンティポーター
トランスポーター分類データベース
参考文献
^ Prakash、Shraddha; クーパー、ギャレット。シンギ、スーミア; Saier、ミルトン H. （2003-12-03)。「イオントランスポータースーパーファミリー」 . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – 生体膜。1618 (1): 79–92. ドイ: 10.1016/j.bbamem.2003.10.010 . ISSN 0006-3002 . PMID 14643936。
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^ 中村 拓実; 藤崎 由美; 榎本 浩; 中山 裕一 高部 徹 やまぐち のん。魚住直子 （2001-10-01). “Vibrio alginolyticus の Na(+)/H(+) アンチポーター NhaB の 3 番目の膜貫通領域からの残基アスパラギン酸 147 は、その活動に関与しています” . 細菌学のジャーナル。183 (19): 5762–5767. ドイ: 10.1128/JB.183.19.5762-5767.2001 . ISSN 0021-9193 . PMC 95471 . PMID 11544242。
ポータル:
生物学
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