NoRC_associated_RNA
NoRC 関連 RNA (pRNA としても知られる) は、 NoRCクロマチン再構築複合体の一部である TIP5 と相互作用することにより、リボソーム RNA転写を調節する非コード RNAエレメントです。
NoRC 関連 RNA (pRNA) pRNAの 保存された二次構造
識別子
シンボル NoRC RNA 代替。シンボル pRNA ラファム RF01518 その他のデータ RNA型 遺伝子
ドメイン
哺乳類
PDB構造
PDBe
コンテンツ
1 機能とゲノムの文脈
2 リサーチ
3 参考文献
4 外部リンク
機能とゲノムの文脈
リボソーム RNA 遺伝子 (rDNA) は、リボソームの大部分を構成するリボソームRNA (rRNA) をコードします。これらの遺伝子は構成的に発現されず、遺伝子サイレンシングのメカニズムが導入され、リボソームが必要ない場合にrDNA遺伝子の発現を抑制します。rDNA の遺伝子サイレンシングには、rDNA プロモーターに相補的な非コード RNA (ncRNA) 分子へのクロマチンリモデリング複合体 NoRCの結合が必要です。
rDNAサイレンシングに関与するncRNAはpRNAとして知られており、プレリボソームRNA転写開始部位の上流にあるスペーサープロモーターに由来することが示されています。この ncRNA が転写されると、150 ～ 250ヌクレオチド長の RNA 分子を形成するように処理され、rDNA プロモーター領域とオーバーラップします。pRNA のコンピューター解析により、pRNA は保存されたステム ループ構造を形成し、多くの真核生物で保存されていることが示されていることが予測されました。
リサーチ
いくつかの研究は、遺伝子サイレンシングに必要なクロマチンリモデリング複合体の動員と局在化に pRNA が不可欠であることを示しています。EMSAは、多くの異なる種からの pRNA がクロマチンリモデリング複合体 NoRC の大きなサブユニットである TIP5 と相互作用することを示したため、pRNAがヘテロクロマチン形成に関与しているという考えを支持しています。 pRNA の 突然変異誘発は、二次構造を変化させた突然変異が TIP5 結合を妨げたため、RNA 二次構造が TIP5 結合に不可欠であることを示した。 TIP5 は、 pRNA の存在下でプロテアーゼ消化に対してより高い感受性を示したため、誘導適合メカニズムによって pRNA に結合します。この立体構造の変化により、TIP5 は NoRC 機能に必要な他のタンパク質と相互作用できるようになる可能性がありますが、これはさらなる研究によって確認する必要が
pRNA は NoRC 形成を刺激するだけでなく、ノックダウン研究と pRNA の突然変異誘発により、pRNA が NoRC 局在化に役割を果たしていることが示されました。pRNA のノックダウンは、NoRC が核小体から核質に転位し、pRNA レベルを回復すると、NoRC が核小体に転位したことを示しました。pRNA の変異は、配列の構造を変更すると NoRC の核小体への移行が妨げられるため、その配列と二次構造が NoRC の局在化に重要であることも示しました。これらの研究は、pRNA 配列と構造の両方がその機能にとって重要な rDNA 遺伝子プロモーターにクロマチン再構築複合体を標的とすることにより、pRNA が遺伝子サイレンシングの役割を果たしていることを確認しました。
参考文献
^ Mayer C、Schmitz KM、Li J、Grummt I、Santoro R 。「遺伝子間転写産物はrRNA遺伝子のエピジェネティックな状態を調節する」 . 分子細胞。22 (3): 351–361. ドイ: 10.1016/j.molcel.2006.03.028 . PMID 16678107。
^ a b次の場所にジャンプ:
Mayer C、Neubert M、Grummt I 。「NoRC関連RNAの構造は、クロマチンリモデリング複合体NoRCを核小体にターゲティングするために重要です」 . EMBO レポート(全文無料)。9 (8): 774–780。ドイ: 10.1038/embor.2008.109 . PMC 2515205 . PMID 18600236。
外部リンク
RfamのNoRC関連RNA、pRNAのページ