OPN5


OPN5
Gタンパク質共役受容体136またはニューロプシンとしても知られるオプシン-5は、ヒトではOPN5遺伝子によってコードされるタンパク質です。オプシン-5 は、G タンパク質共役受容体のオプシンサブファミリーのメンバーです。 紫外 (UV) 光に敏感な光受容体タンパク質です。OPN5 遺伝子はマウスとヒトのゲノムで発見され、その mRNA 発現は神経組織でも発見されました。ニューロプシンは 0 °C で双安定であり、哺乳類および鳥類の組織においてUV 感受性のヘテロ三量体G タンパク質Gi を介した経路を活性化します。 OPN5 識別子
エイリアス
OPN5、GPR136、GRP136、PGR12、TMEM13、オプシン5
外部 ID
OMIM : 609042 MGI : 2662912 ホモ遺伝子: 72341 GeneCards : OPN5
遺伝子の位置 (ヒト) Chr. 染色体 6 (人間)
バンド 6p12.3 始める
47,781,982 bp
終わり
47,832,780 bp
遺伝子位置 (マウス) Chr. 染色体 17 (マウス)
バンド
17|17 B3
始める
42,867,674 bp
終わり
42,922,286 bp
RNA発現パターン
ブジー
人間
マウス(オルソログ)
トップ表現
左心室
肺の下葉
ブロッドマンエリア9
前頭前皮質
上前頭回
視床下部
右子宮管 被殻 細胞
人間の筋骨格系
なし
より多くの参照発現データ
バイオGPS
なし
遺伝子オントロジー
分子機能
11-cis レチナール結合
Gタンパク質共役受容体活性
光受容体の活動
信号変換器活動
Gタンパク質共役光受容体活性
細胞成分
膜の不可欠なコンポーネント 膜 光受容体外節
原形質膜の不可欠な成分
生物学的プロセス
シグナル伝達
視覚
刺激への反応
Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路
光伝達
可視光の検出
光刺激に対する細胞応答
ソース:アミーゴ/ QuickGO
オルソログ 種族 人間
ねずみ
エントレズ221391 353344
アンサンブルENSG00000124818 ENSMUSG00000043972
ユニプロットQ6U736 Q6VZZ7
RefSeq (mRNA)NM_001030051 NM_181744 NM_181753
RefSeq (タンパク質)NP_859528 NP_861418
場所 (UCSC)
Chr 6: 47.78 – 47.83 Mb
Chr 17: 42.87 – 42.92 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/
マウスの表示/編集

コンテンツ
1 関数
2 光化学
3 種の分布
4 系統学
5 参考文献
6 参考文献

関数
ヒトニューロプシンは、目、脳、精巣、および脊髄で発現しています。ニューロプシンは、ペロプシン(RRH) およびレチナール G タンパク質共役受容体(RGR)を含む哺乳類オプシン遺伝子の 7 つのエクソン サブファミリーに属します。ニューロプシンには、選択的スプライシングによって作成されたさまざまなアイソフォームが

光化学
11-cis-レチナールで再構成すると、マウスとヒトのニューロプシンは 380 nm で最大に吸収されます。光が当たると、これらのニューロプシンは青色を吸収する光生成物 (470 nm) に変換され、暗闇でも安定します。光生成物は、オレンジ色の光 (> 520 nm) で照らされると、UV 吸収型に変換されます。

種の分布
ニューロプシンは、棘皮動物、 環形動物、節足動物、腕足動物、クマムシ、軟体動物から知られており、ほとんどは有頭動物から知られています。有頭動物は、哺乳類と人間を含む分類群です。しかし、ニューロプシンオルソログは、ヒト、マウス (ハツカネズミ)、ニワトリ (ガルスガルスドメスティックス)、 ニホンウズラ( Coturnix japonica )、ヨーロッパの脆い星Amphiura filiformis (ヒトデに関連)、クマムシ( Hypsibius dujardini )、およびXenopus laevisのオタマジャクシ。
公的に入手可能な遺伝子配列データベースの検索により、 Bilateriaの主要な分岐である前口動物と後口口動物の両方で推定上のニューロプシン オーソログが見つかりました。原口動物の中で、推定上のニューロプシンは、軟体動物のフクロウのカサガイ ( Lottia gigantea ) (巻貝の一種) と太平洋のカキ( Crassostrea gigas )、ミジンコ( Daphnia pulex ) (節足動物)、および環形動物で発見されています。Capitella テレタ。

系統学
ニューロプシンは、テトラオプシンの 3 つのサブグループの 1 つです (RGR/Go またはグループ 4 オプシンとしても知られています)。他のグループは、クロモプシンとゴーオプシンです。テトラオプシンは、動物オプシンの 5 つの主要なグループの 1 つであり、タイプ 2 オプシンとしても知られています)。他のグループは、繊毛オプシン (c-オプシン、シロプシン)、ラブドメリック オプシン (r-オプシン、ラボプシン)、ゼノプシン、およびネソプシンです。これらのサブクレードのうち 4 つはBilateriaで発生します(ネソプシンを除くすべて)。 しかし、二国間のクレードは、刺胞動物由来のオプシンを持たない傍系統分類群を構成する。
ニューロプシンと他のオプシンとの系統関係
Phylogenetic
オプシンの系統学的再構築。アウトグループには、他のGタンパク質共役受容体が含まれています。フレームは、次の画像で展開されているテトラオプシンを強調しています。
Phylogenetic reconstruction of the tetraopsins. The outgroup contains other G protein-coupled receptors including the other opsins. The frame highlights the neuropsins, which are expanded in the next image.
テトラオプシンの系統再構成。アウトグループには、他のオプシンを含む他のGタンパク質共役受容体が含まれています。フレームは、次の画像で展開されているニューロプシンを強調しています。
上記の系統発生では、各クレードには、オプシンおよび他の G タンパク質共役受容体からの配列が含まれています。シーケンスの数と 2 つの円グラフがクレードの横に表示されます。最初の円グラフは、牛のロドプシンの 296 番目の配列に対応する配列内の特定のアミノ酸の割合を示しています。アミノ酸は色分けされています。色は、リジン(K) は赤、グルタミン酸(E) は紫、その他のアミノ酸は濃い灰色と中間の灰色、その位置にデータがない配列は薄い灰色です。2番目の円グラフは、各クレードの分類群の組成を示し、緑は有頭動物、濃い緑は頭索動物、中緑は棘皮動物、淡いピンクは環形動物、濃い青は節足動物、水色は軟体動物、紫は刺胞動物を表します。クレードへの分岐には円グラフがあり、分岐のサポート値を示します。値は右から左へ SH-aLRT/aBayes/UFBoot です。SH-aLRT ≥ 80%、aBayes ≥ 0.95、および UFBoot ≥ 95% の場合、ブランチはサポートされていると見なされます。サポート値がしきい値を超えている場合、円グラフは黒、それ以外の場合は灰色になります。

参考文献
^ c次の場所にジャンプ: GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000124818 – Ensembl、2017 年 5 月
^ c次の場所にジャンプ: GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000043972 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「ヒト PubMed リファレンス:」 . 国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」 . 国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 次の場所にジャンプ:
Tarttelin EE、Bellingham J、Hankins MW、Foster RG、Lucas RJ 。「ニューロプシン (Opn5): 哺乳類の神経組織で同定された新規オプシン」 . FEBSレター。554 (3): 410–6. ドイ:10.1016/S0014-5793(03)01212-2 . PMID  14623103。S2CID  9577067 .
^ Fredriksson R、Höglund PJ、Gloriam DE、Lagerström MC、Schiöth HB 。「進化的に保存された7つのヒトロドプシンGタンパク質共役受容体は、近親者を欠いています」. FEBSレター。554 (3): 381–8. ドイ:10.1016/S0014-5793(03)01196-7 . PMID  14623098。S2CID  11563502 .
^次の場所にジャンプ:a b 「Entrez 遺伝子: OPN5 オプシン 5」 .
^次の場所にジャンプ:a b 小島大輔・森 進・鳥居正人・和田亜希・森下亮・深田優 (2011). 「ヒトおよびマウスにおけるUV感受性光受容体タンパク質OPN5」 . プロスワン。6 (10): e26388。Bibcode : 2011PLoSO…626388K . ドイ: 10.1371/journal.pone.0026388 . PMC  3197025 . PMID  22043319。
^次の場所にジャンプ:a b 山下 隆,大内 宏,友成 俊,池田 浩一,酒井 健,七田 裕(2010 年 12 月).「Opn5 は、G タンパク質の Gi サブタイプと結合する UV 感受性双安定色素です」 . アメリカ合衆国の国立科学アカデミーの議事録。107 (51): 22084–22089. ビブコード: 2010PNAS..10722084Y . ドイ: 10.1073/pnas.1012498107 . PMC  3009823 . PMID  21135214。
^次の場所にジャンプ:a b Delroisse J, Ullrich-Lüter E, Ortega-Martinez O, Dupont S, Arnone MI, Mallefet J, Flammang P (2014). 「目に見えない不自然な脆い星における高いオプシンの多様性」 . BMCゲノミクス。15 (1): 1035. doi : 10.1186/1471-2164-15-1035 . PMC  4289182 . PMID  25429842。
^次の場所にジャンプ:a b c d Gühmann M、Porter ML、Bok MJ 。「グルオプシン: 網膜結合リジンを持たないオプシン」 . 細胞。11 (15): 2441. doi : 10.3390/cells11152441 . PMC  9368030 . PMID  35954284。
CC BY icon.svg
資料は、クリエイティブ コモンズ 表示 4.0 国際ライセンスの下で利用可能なこのソースからコピーおよび翻案されました。
^ 友成S、右田K、高木明、野地S、大内H。「発生中のニワトリ網膜におけるオプシン5関連遺伝子の発現パターン」。発達ダイナミクス。237 (7): 1910–22。ドイ: 10.1002/dvdy.21611 . PMID  18570255。S2CID  42113764 .
^ 中根 陽一、池上 K、小野 H、山本 N、吉田 S、蛭凪 K、海老原 S、久保 Y、吉村 T . 「哺乳類の神経組織オプシン (Opsin 5) は、鳥類の深部脳光受容体です」 . アメリカ合衆国の国立科学アカデミーの議事録。107 (34): 15264–8. ビブコード: 2010PNAS..10715264N . ドイ: 10.1073/pnas.1006393107 . PMC  2930557 . PMID  20679218 .
^次の場所にジャンプ:a b Hering L、Mayer G 。「クマムシHypsibius dujardiniのオプシンレパートリーの分析は、汎節足動物におけるオプシン遺伝子の進化への洞察を提供します」 . ゲノム生物学と進化。6 (9): 2380–91. ドイ: 10.1093/gbe/evu193 . PMC  4202329 . PMID  25193307。
^ Currie SP、Doherty GH、Sillar KT 。「脳深部の光受容は、アフリカツメガエルのオタマジャクシの運動出力に輝度検出を関連付ける」 . アメリカ合衆国の国立科学アカデミーの議事録。113 (21): 6053–6058. ビブコード: 2016PNAS..113.6053C . ドイ: 10.1073/pnas.1515516113 . PMC  4889350 . PMID  27166423。
^次の場所にジャンプ:a b Ramirez MD、Pairett AN、Pankey MS、Serb JM、Speiser DI、Swafford AJ、Oakley TH (2016 年 10 月 26 日)。「ほとんどの二国間動物の最後の共通祖先は、少なくとも 9 つのオプシンを持っていた」 . ゲノム生物学と進化: evw248. ドイ: 10.1093/gbe/evw248 . PMID  27797948。
^ Porter ML、Blasic JR、Bok MJ、Cameron EG、Pringle T、Cronin TW、Robinson PR 。「オプシンの進化に新たな光を当てる」 . 議事録。生物科学。279 (1726): 3–14. ドイ: 10.1098/rspb.2011.1819 . PMC  3223661 . PMID  22012981 .
^ Liegertová M, Pergner J, Kozmiková I, Fabian P, Pombinho AR, Strnad H, et al. 。「立方動物のゲノムは、オプシンの機能的多様化と光受容体の進化を解明する」 . 科学レポート。5 : 11885. Bibcode : 2015NatSR…511885L . ドイ: 10.1038/srep11885 . PMC  5155618 . PMID  26154478。

参考文献
寺北亜 (2005)。「オプシン」 . ゲノム生物学。6 (3): 213. doi : 10.1186/gb-2005-6-3-213 . PMC  1088937 . PMID  15774036。
Vassilatis DK、Hohmann JG、Zeng H、Li F、Ranchalis JE、Mortrud MT、Brown A、Rodriguez SS、Weller JR、Wright AC、Bergmann JE、Gaitanaris GA 。「ヒトとマウスのGタンパク質共役受容体レパートリー」 . アメリカ合衆国の国立科学アカデミーの議事録。100 (8): 4903–8. ビブコード: 2003PNAS..100.4903V . ドイ: 10.1073/pnas.0230374100 . PMC  153653 . PMID  12679517。
には、パブリック ドメインにある米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。 · Stub icon
  この膜貫通受容体を拡大することで、を助けることができます。”