PATRIC
その他の用法については「パトリック 」をご覧
PATRIC (Pathosystems Resource Integration Center) は、バイオインフォマティクス リソース センターのバクテリア バイオインフォマティクスの Web サイトです。病原菌に関する各種データ（トランスクリプトーム、プロテオミクス、構造、生化学）データベースと解析ツールを統合した情報システムです。これは、さまざまな病原体情報の統合を通じて、細菌感染症に関する生物医学研究コミュニティの作業をサポートするように設計されています。
コンテンツ
1 説明
2 PATRIC データベースに含まれる細菌
3 サイバーインフラ事業部とVBIについて
4 こちらもご覧ください
5 参考文献
6 外部リンク
説明
PATRIC は、バージニア工科大学のサイバーインフラストラクチャ部門のプロジェクトであり、国立衛生研究所 ( NIH ) の構成要素である国立アレルギー感染症研究所 ( NIAID ) から資金提供を受けています。PATRIC は、利用可能な細菌の系統データ、プロテオミクス、および多数の情報源から特定の病原体に関連するその他のさまざまな実験データを一元化します。 PATRIC プラットフォームは、包括的な比較ゲノミクスインターフェイスを提供します。
PATRIC データベースに含まれる細菌
バチルス
バルトネラ
ボレリア
ブルセラ
バークホルデリア
カンピロバクター
クラミドフィラ
クロストリジウム
コクシエラ
エールリヒア
エシェリキア
フランシセラ
ヘリコバクター
リステリア
マイコバクテリア
リケッチア
サルモネラ
シゲラ
ブドウ球菌
ビブリオ
エルシニア
その他の細菌
サイバーインフラ事業部とVBIについて
VBI のサイバーインフラストラクチャ部門は、感染症研究における科学的発見を可能にする方法、インフラストラクチャ、およびリソースを開発しています。このグループは、サイバーインフラストラクチャの原則を適用して、データ、計算インフラストラクチャ、および人々を統合します。CyberInfrastructure Division は、さまざまな感染症システムからキュレーションされた多様な分子および文献データの公開リソースを開発し、それらをサポートするために必要なプロセス、システム、およびデータベースを実装しました。また、独自の手法やデータを応用して研究を行い、独自の新たな発見を行っています。
バージニア工科大学のバージニア バイオインフォマティクス研究所 (VBI) は、植物、人間、その他の動物における宿主、病原体、環境の相互作用の「三角形の病気」を理解することを中心とした研究プラットフォームを持っています。
こちらもご覧ください 病原菌 感染症
抗菌薬耐性データベース
参考文献
^ Gillespie JJ、Wattam AR、Cammer SA 他。。「PATRIC: ヒトの病原性種に焦点を当てた包括的なバクテリア バイオインフォマティクス リソース」 . 感染症と免疫。79 (11): 4286–98. ドイ: 10.1128/IAI.00207-11 . PMC 3257917 . PMID 21896772。
^ Sobral B、Chunhong Mao、Maulik Shukla、Dan Sullivan、Chengdong Zhang （2013 年 1 月 3 日)。「インフォマティクス主導の感染症研究」。フレッド A、ガンボア H、フィリペ J (編)。生物医学工学システムと技術。スプリンガー・ベルリン。pp. 3–11。ISBN 9783642297526. 2022年3月5日閲覧。 CS1 メンテナンス: 日付と年 (リンク)
外部リンク
公式ウェブサイト
バイオインフォマティクスリソースセンターBRC の目標と活動を説明する NIAID のページ
5 つの BRC のPathogen Portal Hub サイト。クロスBRC概要情報を提供