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パッツ1

PATZ1
POZ、AT フック、ジンクフィンガーを含むタンパク質 1 は、ヒトではPATZ1遺伝子によってコードされるタンパク質です。
パッツ1
利用可能な構造 PDB オルソログ検索: PDBe RCSB
PDBのIDコード一覧
2EPP、2EPQ、2EPR、2EPS、2YT9
識別子
エイリアス
PATZ1、MAZR、PATZ、RIAZ、ZBTB19、ZNF278、ZSG、dJ400N23、POZ/BTB、および亜鉛フィンガー1を含むATフック
外部 ID
OMIM : 605165 MGI : 1891832 ホモ遺伝子: 8636 GeneCards : PATZ1
遺伝子の位置 (ヒト) Chr. 染色体 22 (人間)
バンド 22q12.2 始める
31,325,804 bp
終わり
31,346,346 bp
遺伝子位置 (マウス) Chr. 染色体 11 (マウス)
バンド
11|11 A1
始める
3,238,874 bp
終わり
3,259,083 bp
RNA発現パターン
ブジー
人間
マウス(オルソログ)
トップ表現
神経節隆起
甲状腺の右葉
右子宮管
甲状腺の左葉
小唾液腺
卵巣
膵臓の体
胃体
前立腺
眼底
トップ表現
胸腺
神経管
耳石器官 卵形嚢 卵黄嚢
モウラ 鏡 上前頭回
視覚野
神経節隆起
より多くの参照発現データ
バイオGPS
より多くの参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
RNA ポリメラーゼ II シス調節領域の配列特異的 DNA 結合
DNA結合
DNA 結合転写活性化活性、RNA ポリメラーゼ II 特異的
クロマチン結合
タンパク質結合
金属イオン結合
核酸結合
DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
細胞成分 核 核質
生物学的プロセス
遺伝子発現の調節
転写の正の調節、DNAテンプレート
T細胞分化
男性の生殖腺の発達
転写の負の調節、DNA テンプレート
転写調節、DNAテンプレート
RNAポリメラーゼIIによる転写
精子形成
RNAポリメラーゼIIによる転写の正の調節
転写、DNAテンプレート
ソース:アミーゴ/ QuickGO
オルソログ 種族 人間
ねずみ
エントレズ23598 56218
アンサンブルENSG00000100105 ENSMUSG00000020453
ユニプロットQ9HBE1 Q5NBY9
RefSeq (mRNA)
NM_032052 NM_014323 NM_032050 NM_032051
NM_001253690 NM_001253691 NM_019574
RefSeq (タンパク質)
NP_055138 NP_114439 NP_114440 NP_114441
NP_001240619 NP_001240620 NP_062520
場所 (UCSC)
Chr 22: 31.33 – 31.35 Mb
Chr 11: 3.24 – 3.26 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/
マウスの表示/編集

コンテンツ
1 関数
2 相互作用
3 参考文献
4 参考文献

関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質には、AT フックが含まれています。DNA 結合モチーフ。通常、他の DNA 結合構造に結合して、クロマチン モデリングおよび転写調節において重要な役割を果たします。その Poz ドメインは、タンパク質間相互作用の部位として機能すると考えられており、転写抑制に必要であり、亜鉛フィンガーは DNA 結合ドメインを構成します。コードされたタンパク質は転写因子の典型的な特徴を持っているため、遺伝子発現のリプレッサーであると仮定されています。小円形細胞肉腫では、この遺伝子は 22q の小さな反転によって EWS に融合され、その後ハイブリッドが転座すると考えられます (t(1;22)(p36.1;q12)。22 番染色体の再編成にはイントロン 8 が関与します。 EWS とこの遺伝子のエクソン 1 の結合により、このタンパク質のジンクフィンガー ドメインに融合した EWS のトランス活性化ドメインを含むキメラ配列が作成されます。

相互作用
PATZ1 は以下と相互作用することが示されています。
アンドロゲン受容体,
小眼球関連転写因子および
RNF4 .

参考文献
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参考文献
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森井恵・大槻惠子・片岡TR・五十嵐浩子・北村優子 (2002). 「マウス マスト細胞プロテアーゼ 6 遺伝子の転写のための mi 転写因子 (MITF) と myc 関連亜鉛フィンガータンパク質関連因子 (MAZR) の相互作用と協力」 . J.Biol.化学。277 (10): 8566–71. ドイ: 10.1074/jbc.M110392200 . PMID  11751862。
Collins JE、Wright CL、Edwards CA、Davis MP、Grinham JA、Cole CG、Goward ME、Aguado B、Mally M、Mokrab Y、Huckle EJ、Beare DM、Dunham I (2005)。「ヒト ORFeome をクローニングするためのゲノム注釈主導のアプローチ」 . ゲノム生物。5 (10): R84。ドイ: 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC  545604 . PMID  15461802。

ヒト22 番染色体上の遺伝子に関するはスタブです。を拡大することで、を助けることができます。 · “

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