PAUP*
PAUP* ( Phylogenetic Analysis U sing Parsimony *およびその他の方法) は、David L. Swofford によって書かれた、進化ツリー (系統発生)を推測するための計算による系統発生学プログラムです。もともと、PAUP はその名前が示すように節約のみを実装していましたが、バージョン 4.0 (プログラムが PAUP* として知られるようになったとき) から、距離行列と尤度法もサポートしています。バージョン 3.0 はMacintoshコンピュータで動作し、リッチで使いやすいグラフィカル インターフェイスをサポートしていました。プログラムMacCladeと共に PAUP*は、多くの系統発生学者が選択する系統発生ソフトウェアでした。
P系統発生あ分析う歌うPアーシモニー*およびその他の方法
原作者
デビッド・L・スウォフォード
安定版リリース 4.0b10 プレビュー リリース 4.0a164 で書かれている C オペレーティング·システム
Macintosh、Windows、Unix ライク
プラットホーム
クロスプラットフォーム
タイプ
化学
ライセンス
準商用
Webサイト PAUP* バージョン 4.0 では、Windows (グラフィカル シェルとコマンド ライン) および Unix (コマンド ラインのみ) プラットフォームのサポートが追加されました。ただし、Macintosh のグラフィカル ユーザー インターフェイスは、10.14以降のMac OS Xのバージョンをサポートしていません(ただし、Mac OS のそれ以降のバージョンの GUI は計画されています)。PAUP* はGeneiousのプラグインとしても利用できます。PAUP* (* Phylogenetic Analysis Using PAUP) という自己言及的なタイトルが付けられたPAUP* は、急速な更新を受けており、現在、「種ツリー」法 SVDquartets が含まれています。 、および系統発生のための距離法。
参考文献
^ Maddison DR， Maddison WP （2001-02-08). MacClade 4: 系統発生と文字の進化の分析。ISBN 0-8789-3470-7. 2011-09-27 にオリジナルからアーカイブ。2015 年 12 月 8 日閲覧。
^ マディソン DR、スウォフォード DL、マディソン WP (1997 年 12月）。「NEXUS: 体系的な情報のための拡張可能なファイル形式」 . 系統的生物学。46 (4): 590–621. ドイ: 10.1093/sysbio/46.4.590 . PMID 11975335。
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外部リンク
公式ウェブサイト
公式テスト版サイト