PAX7


PAX7
ペアボックスタンパク質 Pax-7は、ヒトではPAX7遺伝子によってコードされるタンパク質です。 PAX7 識別子
エイリアス
PAX7、HUP1、PAX7B、RMS2、Pax7、ペアボックス7、MYOSCO
外部 ID
OMIM : 167410 MGI : 97491 ホモ遺伝子: 55665 GeneCards : PAX7
遺伝子の位置 (ヒト) Chr. 染色体 1 (ヒト)
バンド 1p36.13 始める
18,630,846 bp
終わり
18,748,866 bp
遺伝子位置 (マウス) Chr. 染色体 4 (マウス)
バンド
4 D3|4 70.83cm
始める
139,464,373 bp
終わり
139,560,839 bp
RNA発現パターン
ブジー
人間
マウス(オルソログ)
トップ表現
腓腹筋
前頭前皮質
骨格筋組織
ブロッドマンエリア9
帯状回
上前頭回
黒質
視床下部
適切な海馬
扁桃体
トップ表現 上丘 体節
背側被蓋核
尿道
前胸部
主気管支
脳下垂体
横鼻隆起 舌 外眼筋
より多くの参照発現データ
バイオGPS
より多くの参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
配列特異的DNA結合
DNA結合
DNA結合転写因子活性
RNAポリメラーゼIIの一般的な転写開始因子活性
DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
細胞成分 核 生物学的プロセス
筋芽細胞増殖の正の調節
細胞運命決定の調節
クロマチンリモデリング
転写調節、DNAテンプレート
脊髄関連ニューロン分化
ヒストンメチル化の正の調節
解剖学的構造形態形成
筋肉器官の発達
アポトーシス過程の負の調節
転写、DNAテンプレート
胚の骨格系の発達
多細胞生物の発生
軟骨の発達
骨格筋組織の再生
筋肉組織の形態形成
遺伝子発現の調節
ニューロン運命コミットメント
骨格筋サテライト細胞のコミットメント
背側/腹側神経管のパターニング
タンパク質結合の調節
骨格筋組織の発達
RNAポリメラーゼIIによる転写の正の調節
RNAポリメラーゼIIによる転写
DNA結合の調節
ソース:アミーゴ/ QuickGO
オルソログ 種族 人間
ねずみ
エントレズ5081 18509
アンサンブルENSG00000009709 ENSMUSG00000028736
ユニプロットP23759 P47239
RefSeq (mRNA)
NM_013945 NM_001135254 NM_002584 NM_011039 RefSeq (タンパク質)
NP_001128726 NP_002575 NP_039236 NP_035169 場所 (UCSC)
チャンネル 1: 18.63 ~ 18.75 Mb
Chr 4: 139.46 – 139.56 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

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マウスの表示/編集

コンテンツ
1 関数
2 臨床的な意義
3 こちらもご覧ください
4 参考文献
5 参考文献
6 外部リンク

関数
Pax-7 は神経堤の発達と原腸陥入に関与し、 Slug、Sox9、Sox10、HNK-1などの神経堤マーカーの発現における重要な因子です。 PAX7 は、上顎骨の口蓋棚、メッケル軟骨、中脳、鼻腔、鼻上皮、鼻嚢および橋で発現します。
Pax7 は、筋前駆細胞の増殖の調節を通じて筋形成に関与する転写因子です。PAX3とのヘテロ二量体としてDNAに結合できます。PAXBP1とも相互作用します。この相互作用は、PAX7をWDR5含有ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体に類似性によって結び付けます。DAXX とも対話します。
PAX7 は、精原幹細胞のまれなサブセット、特に A単一精原細胞のサブセットのマーカーとして機能します。これらの PAX7 +精原細胞は成人の精巣ではまれですが、新生児でははるかに多く、新生児の精巣の生殖細胞の 28% を占めています。 PAX7 + 筋サテライト細胞とは異なり、PAX7 +精原細胞は急速に増殖し、静止し PAX7 +精原細胞は、精子形成のすべての段階を生じさせ、運動精子を生成することができます。しかし、PAX7 +精原細胞を持たないマウスは生殖能力に欠陥を示さないため、PAX7 は精子形成には必要ありません。
PAX7 は、精子形成の回復にも機能する可能性が他の精原細胞とは異なり、PAX7 +精原細胞は放射線や化学療法に耐性が生き残った PAX7 +精原細胞は、これらの治療後に数が増加し、生き残れなかった他の形態の精原細胞に分化することができます。さらに、PAX7 を欠くマウスは、対照マウスと比較して、ブスルファンへの曝露後の精子形成の回復が遅れました。

臨床的な意義
Pax タンパク質は、胎児の発育と癌の増殖中に重要な役割を果たします。ペアボックス遺伝子7の特定の機能は不明ですが、この遺伝子とフォークヘッドドメインファミリーメンバーとの融合が肺胞横紋筋肉腫と関連しているため、腫瘍抑制に関与すると推測されています。この遺伝子の選択的スプライシングにより、2 つの既知の産物が生成されていますが、バリアントの生物学的重要性は不明です。動物実験では、突然変異マウスは上顎と鼻の奇形を持っていることが示されています。

こちらもご覧ください
パックス遺伝子

参考文献
^次の場所にジャンプ:a b c GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000009709-Ensembl、2017 年 5 月
^次の場所にジャンプ:a b c GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028736-Ensembl、2017 年 5 月
^ 「ヒト PubMed リファレンス:」 . 国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」 . 国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Stapleton P、Weith A、Urbánek P、Kozmik Z、Busslinger M (1993 年 4月)。「7つのPAX遺伝子の染色体局在化と新規ファミリーメンバーPAX-9のクローニング」. 自然遺伝学。3 (4): 292–8. ドイ: 10.1038/ng0493-292 . PMID  7981748。S2CID  21338655 .
^ Pilz AJ、Povey S、Gruss P、Abbott CM (1993 年 3月)。「マウスペアボックス含有遺伝子のヒト同族体のマッピング」。哺乳類のゲノム。4 (2): 78–82。ドイ:10.1007/BF00290430。PMID  8431641。S2CID  30845070 .
^次の場所にジャンプ:a b 「Entrez 遺伝子: PAX7 ペアボックス遺伝子 7」 .
^ Basch ML、Bronner-Fraser M、García-Castro MI 。「神経堤の仕様は、原腸形成中に発生し、Pax7 を必要とします」 . 自然。441 (7090): 218–22. ビブコード: 2006Natur.441..218B . ドイ: 10.1038/nature04684 . PMID  16688176。S2CID  4418753 .
^ 「PAX7 – ペアボックスタンパク質 Pax-7 – ホモサピエンス (ヒト) – PAX7 遺伝子 & タンパク質」 .
^次の場所にジャンプ:a b c d e f g h Aloisio、ジーナ M。中田裕司; Saatcioglu、ハティツェ D.; ペーニャ、クリストファー G.; ベイカー、マイケル D.; ターナワ、エドワード D.; Mukherjee、ジシュヌ。マンジュナス、ヘマ。Bugde、Abhijit (2014 年 9 月 2 日)。「PAX7 発現は成体精巣の生殖系列幹細胞を定義する」 . 臨床調査のジャーナル。124 (9): 3929–3944。ドイ: 10.1172/JCI75943 . ISSN  0021-9738 . PMC  4153705 . PMID  25133429。
^ Kumar、T. Rajendra (2014 年 10 月 1 日)。「男性生殖細胞系幹細胞マーカーの探索: PAX7 の ID が取得されました」 . 臨床調査のジャーナル。124 (10): 4219–4222。ドイ: 10.1172/JCI77926 . ISSN  0021-9738 . PMC  4191048 . PMID  25157826。
^ Mansouri A、Stoykova A、Torres M、Gruss P (1996 年 3月)。「Pax7-/-変異マウスにおける頭部神経堤誘導体の形成不全」。開発。122 (3): 831–8. 土井: 10.1242/dev.122.3.831。hdl : 11858/00-001M-0000-0013-01BC-0 . PMID  8631261。

参考文献
Blake J、Ziman MR 。「異常なPAX3およびPAX7発現。胎児性横紋筋肉腫および皮膚悪性黒色腫の転移能との関連性?」. 組織学および組織病理学。18 (2): 529–39. PMID  12647804。
Burri M、Tromvoukis Y、Bopp D、Frigerio G、Noll M (1989 年 4月)。「後生動物における対になったドメインの保存と、3 つの単離されたヒト遺伝子におけるその構造」 . EMBOジャーナル。8 (4): 1183–90. ドイ: 10.1002/j.1460-2075.1989.tb03490.x . PMC  400932 . PMID  2501086。
Schäfer BW、Czerny T、Bernasconi M、Genini M、Busslinger M (1994 年 11月)。「正常および腫瘍性筋細胞で発現するヒト PAX-7 cDNA の分子クローニングと特徴付け」 . 核酸研究。22 (22): 4574–82. ドイ: 10.1093/nar/22.22.4574 . PMC  308503 . PMID  7527137。
Shapiro DN、Sublett JE、Li B、Valentine MB、Morris SW、Noll M (1993 年 9月)。「ペアボックスを含む遺伝子のメンバーであるPAX7の遺伝子は、ヒト染色体アーム1p36に局在しています」. ゲノミクス。17 (3): 767–9. doi : 10.1006/geno.1993.1404 . PMID  7902328。
Cross SH、Charlton JA、Nan X、Bird AP (1994 年 3月)。「メチル化 DNA 結合カラムを使用した CpG アイランドの精製」。自然遺伝学。6 (3): 236–44. ドイ: 10.1038/ng0394-236 . PMID  8012384。S2CID  12847618 .
シェーファー BW、マッテイ MG (1993 年 7月)。「ヒト ペア ドメイン遺伝子 PAX7 (Hup1) は、染色体 1p35-1p36.2 にマッピングされます」. ゲノミクス。17 (1): 249–51. doi : 10.1006/geno.1993.1315 . PMID  8104868。
Barr FG、Nauta LE、Davis RJ、Schäfer BW、Nycum LM、Biegel JA (1996 年 1月)。「肺胞横紋筋肉腫における PAX3-FKHR および PAX7-FKHR 融合遺伝子の in vivo 増幅」 (PDF) . ヒト分子遺伝学。5 (1): 15–21. ドイ: 10.1093/hmg/5.1.15 . PMID  8789435。
Vorobyov E、Mertsalov I、Dockhorn-Dworniczak B、Dworniczak B、Horst J (1997 年 10月)。「ヒトPAX7遺伝子のゲノム構成と全コード領域」. ゲノミクス。45 (1): 168–74. doi : 10.1006/geno.1997.4915 . PMID  9339373。
Magnaghi P、Roberts C、Lorain S、Lipinski M、Scambler PJ (1998 年 9月)。「Saccharomyces cerevisiae 転写コリプレッサーの哺乳動物相同体である HIRA は、Pax3 と相互作用します」 . 自然遺伝学。20 (1): 74–7. ドイ:10.1038/1739。PMID  9731536。S2CID  19736941 .
Margue CM、Bernasconi M、Barr FG、Schäfer BW 。「ペアボックス転写因子PAX3およびPAX3/FKHRによる抗アポトーシスタンパク質BCL-XLの転写調節」 . がん遺伝子。19 (25): 2921–9. ドイ: 10.1038/sj.onc.1203607 . PMID  10871843。
コンドラショフ AV、ポスペロフ VA (2002)。「[プロモーターとエンハンサーの複合体間の相互作用の in vitro モデリング]」。ツィトロギア。43 (8): 764–71. PMID  11601392。
ソレンセン PH、リンチ JC、クアルマン SJ、ティラボスコ R、リム JF、マウラー HM、ブリッジ JA、クリスト WM、トリッシュ TJ、バー FG 。「PAX3-FKHR および PAX7-FKHR 遺伝子融合は、肺胞横紋筋肉腫の予後指標である: 小児腫瘍学グループからの報告」. 臨床腫瘍学のジャーナル。20 (11): 2672–9. ドイ: 10.1200/JCO.2002.03.137 . PMID  12039929。
Syagailo YV、Okladnova O、Reimer E、Grässle M、Mössner R、Gattenlöhner S、Marx A、Meyer J、Lesch KP 。「人間のPAX7 5’に隣接する調節領域の構造的および機能的特徴付け」。ジーン。294 (1–2): 259–68. ドイ:10.1016/S0378-1119(02)00798-9 . PMID  12234688。
Tiffin N、Williams RD、Shipley J、Pritchard-Jones K 。「胚性横紋筋肉腫におけるPAX7の発現は、筋サテライト細胞の起源を示唆している」 . ブリティッシュ ジャーナル オブ キャンサー。89 (2): 327–32. ドイ: 10.1038/sj.bjc.6601040 . PMC  2394255 . PMID  12865925。
Tomescu O、Xia SJ、Strezlecki D、Bennicelli JL、Ginsberg J、Pawel B、Barr FG 。「誘導可能な短期および安定した長期の細胞培養システムは、PAX3-FKHR 融合癌タンパク質が CXCR4、PAX3、および PAX7 の発現を調節することを明らかにします」 . 実験室調査。84 (8): 1060–70. ドイ: 10.1038/labinvest.3700125 . PMID  15184910。
Vorobyov E、Horst J 。「PAX7 の 2 つのタンパク質アイソフォームの発現は、競合する切断ポリアデニル化とスプライシングによって制御されます」. ジーン。342 (1): 107–12. ドイ: 10.1016/j.gene.2004.07.030 . PMID  15527970。

外部リンク
米国国立医学図書館の医学主題見出し(MeSH)のPAX7+タンパク質、+ヒト
UCSC Genome BrowserにおけるPAX7ヒト遺伝子の位置。
UCSC Genome BrowserのPAX7ヒト遺伝子の詳細。
には、パブリック ドメインにある米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。 ·