PAXBP1
GC リッチ配列 DNA 結合因子ホモログは、ヒトではPAXBP1遺伝子によってコードされるタンパク質です。 PAXBP1 識別子
エイリアス
PAXBP1、BM020、C21orf66、FSAP105、GCFC、GCFC1、PAX3、PAX7 結合タンパク質 1
外部 ID
OMIM : 617621 MGI : 1914617 ホモ遺伝子: 9604 GeneCards : PAXBP1
遺伝子の位置 (ヒト) Chr. 染色体 21 (人間)
バンド 21q22.11 始める
32,733,899 bp
終わり
32,771,792 bp
遺伝子位置 (マウス) Chr. 染色体 16 (マウス)
バンド
16|16 C3.3
始める
90,810,925 bp
終わり
90,841,431 bp
RNA発現パターン
ブジー
人間
マウス(オルソログ)
トップ表現
腓腹神経
精子
右子宮管
アキレス腱 脛骨 脳梁
空腸粘膜
神経節隆起
胚上皮
膵臓の体
トップ表現
小脳皮質
小脳虫部 胸腺 真皮
網膜色素上皮
精子細胞
輸精管
上前頭回
腹壁
大腿骨体
より多くの参照発現データ
バイオGPS
より多くの参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
RNA ポリメラーゼ II シス調節領域の配列特異的 DNA 結合
転写因子結合
DNA結合転写因子活性
DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的
DNA結合
細胞成分 核 サイトゾル
生物学的プロセス
RNAポリメラーゼIIによる転写の正の調節
骨格筋サテライト細胞増殖の調節
転写調節、DNAテンプレート
筋肉器官の発達
筋芽細胞増殖の正の調節
ヒストンメチル化の正の調節
転写、DNAテンプレート
RNAポリメラーゼIIによる転写の負の調節
ソース:アミーゴ/ QuickGO
オルソログ 種族 人間
ねずみ
エントレズ94104 67367
アンサンブルENSG00000159086 ENSG00000263141 ENSMUSG00000022974
ユニプロットQ9Y5B6 P58501
RefSeq (mRNA)
NM_013329 NM_016631 NM_058191 NM_145328 NM_026110 RefSeq (タンパク質)NP_037461 NP_057715 NP_080386
場所 (UCSC)
Chr 21: 32.73 – 32.77 Mb
Chr 16: 90.81 – 90.84 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/
転写リプレッサーとの類似性は、この遺伝子のタンパク質産物が転写の調節に関与していることを示唆しています。この遺伝子の選択的スプライシングにより、異なるアイソフォームをコードする 3 つの転写バリアントが生じます。追加の転写バリアントが記載されていますが、それらの全長配列は決定され
参考文献
^次の場所にジャンプ:a b c ENSG00000263141 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000159086、ENSG00000263141-Ensembl、2017 年 5 月 ^次の場所にジャンプ:a b c GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022974-Ensembl、2017 年 5 月 ^ 「ヒト PubMed リファレンス:」 . 国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」 . 国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J 、Hu GX、Gu J、Chen SJ、Chen Z 。「CD34+ 造血幹/前駆細胞で発現する 300 の以前に定義されていない遺伝子のオープン リーディング フレームを使用した cDNA のクローニングと機能解析」 . ゲノム解像度。10 (10): 1546–60. ドイ: 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152。
^ Reymond A、Friedli M、Henrichsen CN、Chapot F、Deutsch S、Ucla C、Rossier C、Lyle R、Guipponi M、Antonarakis SE 。「PRED とオープン リーディング フレームから cDNA 分離まで: ヒト染色体 21 転写マップの再検討」. ゲノミクス。78 (1–2): 46–54. doi : 10.1006/geno.2001.6640 . PMID 11707072。
^次の場所にジャンプ:a b
「Entrez 遺伝子: C21orf66 染色体 21 オープン リーディング フレーム 66」 .
外部リンク
UCSC Genome BrowserのヒトPAXBP1ゲノムの位置とPAXBP1遺伝子の詳細ページ。
参考文献
Slavov D, 服部正樹, 榊Y, et al. (2000)。「遺伝子同定の基準とゲノム構成の特徴: ヒト 21 番染色体からの 6.5 Mb の DNA 配列の分析」. ジーン。247 (1–2): 215–32. ドイ:10.1016/S0378-1119(00)00089-5 . PMID 10773462。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他。(2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウスの cDNA 配列の生成と初期分析」 . 議事録 国立 アカデミー。科学。米国。99 (26): 16899–903. ビブコード: 2002PNAS…9916899M . ドイ: 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932。
太田 徹、鈴木 陽一、西川 徹、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特徴付け」 . ナット。ジュネ。36 (1): 40–5. ドイ: 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、他。(2004)。「HeLa 細胞核リンタンパク質の大規模特性評価」 . 議事録 国立 アカデミー。科学。米国。101 (33): 12130–5. ビブコード: 2004PNAS..10112130B . ドイ: 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935。
木村浩一、若松明、鈴木義明 他 (2006)。「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模な同定と特徴付け」 . ゲノム解像度。16 (1): 55–65. ドイ: 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560。
Hu YH、Warnatz HJ、Vanhecke D、他 (2006)。「細胞アレイに基づく細胞内局在スクリーニングは、ヒト染色体 21 タンパク質の新しい機能的特徴を明らかにする」 . BMCゲノミクス。7 : 155. doi : 10.1186/1471-2164-7-155 . PMC 1526728 . PMID 16780588。
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、他 (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおけるグローバル、in vivo、および部位特異的リン酸化ダイナミクス」 . セル。127 (3): 635–48. ドイ: 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983。S2CID 7827573 .
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