Plakophilin-4
プラコフィリン-4 は、ヒトではPKP4遺伝子によってコードされるタンパク質です。 PKP4 識別子
別名
PKP4、p0071、プラコフィリン 4
外部ID
OMIM : 604276 MGI : 109281 HomoloGene : 2689 GeneCards : PKP4
遺伝子の位置 (ヒト) Ch. 2 番染色体 (ヒト)
バンド 2q24.1 始める
158，456，952 bp
終わり
158，682，879 bp
遺伝子の位置 (マウス) Ch. 2 番染色体 (マウス)
バンド
2|2 C1.1
始める
59，160，850 bp
終わり
59，355，208 bp
RNA発現パターン
ジー
人間
マウス（オルソログ）
トップは次のように表されます
迷走神経の下神経節
内部淡蒼球
脳梁
視床下核
精巣上体頭
扁桃体
被殻
中部前頭回
視床下部
尾状核
トップは次のように表されます
毛様体 虹彩 黒質
海馬本体の領域 I
上行大動脈
運動ニューロン 扁桃体 顎下腺 淡蒼球 帯状回
参照式データの追加
バイオGPS
参照式データの追加
遺伝子オントロジー
分子機能
タンパク質結合
カドヘリン結合細胞成分 細胞質
スピンドルポール 膜 シナプス後密度
細胞間接触ゾーン
細胞間接合
スピンドル
デスモソーム
細胞接合部
中部
スピンドルミッドゾーン
細胞質の核周囲領域
細胞膜の細胞質側
有糸分裂紡錘体
細胞骨格
角化した封筒
原形質膜 核 生物学的プロセス
細胞間シグナル伝達
細胞質分裂の正の制御
GTPase活性の正の制御
細胞接着の調節
細胞接着
細胞間接合アセンブリ 角質化 角質化
細胞と細胞の接着
出典:アミーゴ/ QuickGO
オルソログ 種族 人間
ねずみ
アントレ8502 227937
アンサンブルENSG00000144283 ENSMUSG00000026991
ユニプロットQ99569 Q68FH0
RefSeq (mRNA)
NM_001005476 NM_001304969 NM_001304970 NM_001304971 NM_003628
NM_001377218 NM_001377219 NM_001377220 NM_001377221 NM_001377222 NM_001377223 NM_001377224 NM_001377225 NM_001377226
NM_026361 NM_175464 NM_001362990 NM_001362991 NM_001362992
NM_001362993 NM_001362994 NM_001362995 NM_001362996 NM_001362997 NM_001362998 NM_001362999
RefSeq (タンパク質)
NP_001005476 NP_001291898 NP_001291899 NP_001291900 NP_003619
NP_001364147 NP_001364148 NP_001364149 NP_001364150 NP_001364151 NP_001364152 NP_001364153 NP_001364154 NP_001364155
NP_080637 NP_780673 NP_001349919 NP_001349920 NP_001349921
NP_001349922 NP_001349923 NP_001349924 NP_001349925 NP_001349926 NP_001349927 NP_001349928
所在地 (UCSC)
Chr 2: 158.46 – 158.68 MB
Chr 2: 59.16 – 59.36 MB
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/編集
コンテンツ
1 関数
2 インタラクション
3 参考文献
4 参考文献
関数
アルマジロ様タンパク質は、ショウジョウバエの「アルマジロ」遺伝子産物で最初に定義された一連のアルマジロリピートによって特徴付けられ、通常、長さは 42 ～ 45 アミノ酸です。これらのタンパク質は、リピート数、全体的な配列の類似性、配列全体にわたるリピートの分散に基づいてサブファミリーに分類できます。アルマジロ様タンパク質の p120(ctn)/プラコフィリン サブファミリーのメンバー (CTNND1、CTNND2、PKP1、PKP2、PKP4、ARVCF など)。PKP4 は、デスモソーム プラークおよびその他の癒着プラークの構成要素である可能性があり、結合プラークの組織化およびカドヘリン機能の調節に関与すると考えられています。この遺伝子には複数の転写バリアントが発見されていますが、全長の性質がこれまでに説明されているのはそのうちの 2 つだけです。これら 2 つのバリアントは、異なるアイソフォームをコードします。
インタラクション
PKP4 は以下と相互作用することが示されています。
エルビン、
PDZD2、 、および
PSEN1。
参考文献
^ GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000144283 – Ensembl、2017 年 5 月 ^ GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026991 – Ensembl、2017 年 5 月 ^ “Human PubMed リファレンス:” . 国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ “マウス PubMed リファレンス:” . 国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ パフェンホルツ R、フランケ WW (1997 年 12月）。「プラコグロビン/アルマジロ多重遺伝子ファミリーの神経発現メンバーの同定と局在化」。差別化。61 (5): 293–304。土井：10.1046/j.1432-0436.1997.6150293.x。PMID 9342840。 ^ ハッツフェルト M、ナハツハイム C (1997 年 5月）。「接合プラークに関連する新しいアルマジロファミリーメンバー p0071 のクローニングと特性評価: 密接に関連したタンパク質のサブファミリーの証拠」。Jセルサイエンス。109 (11): 2767–78。土井: 10.1242/jcs.109.11.2767。PMID 8937994。
^ “エントレズ遺伝子: PKP4 プラコフィリン 4” .
^ 井沢一、西沢正、友野裕、大宝一、高橋哲、稲垣正 。「ERBIN は、上皮細胞の細胞間接合部でアルマジロタンパク質である p0071 と会合します。 」遺伝子細胞。7 (5): 475–85。土井：10.1046/j.1365-2443.2002.00533.x。PMID 12047349。S2CID 12598418。 ^ Jaulin-Bastard F、Arsanto JP、Le Bivic A、Navarro C、Vély F、Saito H、Marchetto S、Hatzfeld M、Santoni MJ、Birnbaum D、Borg JP 。「上皮細胞におけるエルビンとカテニン関連タンパク質との相互作用」。Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学。277 (4): 2869–75。土井：10.1074/jbc.M109652200。PMID 11711544。 ^ ローラ RP、ウィット AS、ヘルド HA、ガースナー R、デシェイズ K、ケーラー MF、コシック KS、シドゥ SS、ラスキー LA 。「エルビン PDZ ドメインは、デルタ-カテニンおよび ARVCF のカルボキシル末端に高い親和性と特異性で結合します。 」Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学。277 (15): 12906–14。土井：10.1074/jbc.M200818200。PMID 11821434。 ^ 出口M、飯塚T、畑Y、西村W、平尾K、八尾I、川辺H、高井Y 。「PAPIN。神経プラコフィリン関連アルマジロリピートタンパク質/デルタ-カテニンおよびp0071と相互作用する新規複数PSD-95/Dlg-A/ZO-1タンパク質」。Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学。275 (38): 29875–80。土井：10.1074/jbc.M005384200。PMID 10896674。 ^ 大野 英、平林 哲、飯塚 哲、大西 英、藤田 哲、秦 裕 。「上皮細胞におけるp0071相互作用タンパク質、プラコフィリン関連アルマジロリピートタンパク質相互作用タンパク質(PAPIN)およびERBINの局在化」。がん遺伝子。21 (46): 7042–9。土井：10.1038/sj.onc.1205852。PMID 12370826。 ^ Stahl B、Diehlmann A、Südhof TC (1999 年 4月）。「アルツハイマー病関連プレセニリン 1 とアルマジロタンパク質 p0071 の直接相互作用」。Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学。274 (14): 9141–8。土井：10.1074/jbc.274.14.9141。PMID 10092585。
参考文献
Keil R、Wolf A、Hüttelmaier S、Hatzfeld M （2007)。「細胞接着の制御を超えて：p0071 カテニンによる切断溝における RhoA の局所制御」。細胞周期。6 (2): 122-7。土井: 10.4161/cc.6.2.3741。PMID 17264675。
ボンネ S、ファン ヘンゲル J、ファン ロイ F (1998)。「p120(ctn)/プラコフィリンサブファミリーに属するヒトアルマジロ遺伝子の染色体マッピング」。ゲノミクス。51 (3): 452-4. 土井：10.1006/geno.1998.5398。PMID 9721216。
Levesque G、Yu G、西村 M、Zhang DM、Levesque L、Yu H、Xu D、Liang Y、Rogaeva E、Ikeda M、Duthie M、Murgolo N、Wang L、VanderVere P、Bayne ML、Strader CD、Rommens JM 、フレイザー PE、セント ジョージ-ヒスロップ P (1999)。「プレセニリンは、神経特異的なプラコフィリン関連タンパク質やβ-カテニンを含むアルマジロタンパク質と相互作用します。 」J.ニューロケム。72 (3): 999–1008。土井：10.1046/j.1471-4159.1999.0720999.x。PMID 10037471。S2CID 36124450。
Stahl B、Diehlmann A、Südhof TC (1999)。「アルツハイマー病関連プレセニリン 1 とアルマジロタンパク質 p0071 の直接相互作用」。Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学。274 (14): 9141–8。土井：10.1074/jbc.274.14.9141。PMID 10092585。
出口正樹、飯塚拓也、畑裕子、西村和也、平尾和也、八尾一樹、川辺弘、高井裕也 （2000) 「PAPIN。神経プラコフィリン関連アルマジロリピートタンパク質/デルタ-カテニンおよびp0071と相互作用する新規複数PSD-95/Dlg-A/ZO-1タンパク質」。Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学。275 (38): 29875–80。土井：10.1074/jbc.M005384200。PMID 10896674。
Schröder R、van der Ven PF、Warlo I、Schumann H、Fürst DO、Blümcke I、Schmidt MC、Hatzfeld M （2001)。「アルマジロ多重遺伝子ファミリーのメンバーである p0071 は、ヒトの骨格筋の筋節 I バンドの構成要素です。」J.マッスルレス。細胞。モチル。21 (6): 577–86。土井：10.1023/A:1026587530656。PMID 11206135。S2CID 1342967。
ジョリン・バスタード F、アルサント JP、ル ビビック A、ナバロ C、ヴェリー F、サイトウ H、マルケット S、ハッツフェルド M、サントーニ MJ、バーンバウム D、ボルグ JP （2002)。「上皮細胞におけるエルビンとカテニン関連タンパク質との相互作用」。Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学。277 (4): 2869–75。土井：10.1074/jbc.M109652200。PMID 11711544。
井沢一、西沢正人、友野裕子、大宝和也、高橋哲人、稲垣正樹 （2002) 「ERBIN は、上皮細胞の細胞間接合部でアルマジロタンパク質である p0071 と会合します。 」遺伝子細胞。7 (5): 475–85。土井：10.1046/j.1365-2443.2002.00533.x。PMID 12047349。S2CID 12598418。
大野 弘、平林 哲、飯塚 哲、大西 英、藤田 哲、畑 裕 （2002)。「上皮細胞におけるp0071相互作用タンパク質、プラコフィリン関連アルマジロリピートタンパク質相互作用タンパク質(PAPIN)およびERBINの局在化」。がん遺伝子。21 (46): 7042–9。土井：10.1038/sj.onc.1205852。PMID 12370826。
Calkins CC、Hoepner BL、Law CM、Novak MR、Setzer SV、Hatzfeld M、Kowalczyk AP （2003)。「アルマジロファミリータンパク質 p0071 は、VE カドヘリンおよびデスモプラキン結合タンパク質です。 」Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学。278 (3): 1774 ～ 1783 年。土井：10.1074/jbc.M205693200。PMID 12426320。
サロモン AR、フィカロ SB、ブリル LM、ブリンカー A、フン QT、エリクソン C、ザウアー K、ブロック A、ホーン DM、シュルツ PG、ピーターズ EC （2003)。「質量分析を使用したヒト細胞におけるチロシンリン酸化経路のプロファイリング」。手順 国立 アカド。科学。アメリカ。100 (2): 443–8。Bibcode : 2003PNAS..100..443S。土井：10.1073/pnas.2436191100。PMC 141014。PMID 12522270。
ハッツフェルド M、グリーン KJ、ザウター H （2003)。「デスモソームおよび接着結合に対する p0071 の標的化は、さまざまなタンパク質ドメインによって媒介されます。 」Ｊ．Ｃｅｌｌ Ｓｃｉ．116 (Pt 7): 1219–33。土井：10.1242/jcs.00275。PMID 12615965。
セッツァー SV、カルキンス CC、ガーナー J、サマーズ S、グリーン KJ、コワルチク AP （2004)。「a431 上皮細胞接合部の構築、接着、遊走の調節におけるアルマジロファミリータンパク質の比較分析」。J.インベスト。ダーマトール。123 (3): 426-33。土井: 10.1111/j.0022-202X.2004.23319.x。PMID 15304078。
Zhang Y、Wolf-Yadlin A、Ross PL、Pappin DJ、Rush J、Lauffenburger DA、White FM （2005)。「上皮成長因子受容体シグナル伝達ネットワークにおけるチロシンリン酸化部位の時間分解質量分析により、動的モジュールが明らかになります。 」モル。細胞。プロテオミクス。4 (9): 1240–50。土井: 10.1074/mcp.M500089-MCP200。PMID 15951569。
Tao WA、Wollscheid B、O’Brien R、Eng JK、Li XJ、Bodenmiller B、Watts JD、Hood L、Aeber sold R （2005)。「デンドリマー結合化学とタンデム質量分析を使用した定量的リンプロテオーム分析」。ナット。メソッド。2 (8): 591–8。土井：10.1038/nmeth776。PMID 16094384。S2CID 20475874。
オルセン JV、ブラゴエフ B、グナド F、マセク B、クマール C、モーテンセン P、マン M （2006)。「シグナル伝達ネットワークにおけるグローバル、インビボ、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。セル。127 (3): 635-48。土井：10.1016/j.cell.2006.09.026。PMID 17081983。S2CID 7827573。
ヒト第 2 染色体上の遺伝子に関するは書きかけです。 · “