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リボキナーゼ

Ribokinase

酵素学では、リボキナーゼ( EC 2.7.1.15 ) は化学反応を触媒する酵素です。
リボキナーゼ
リボキナーゼ二量体、ヒト
識別子
EC番号
2.7.1.15
CAS番号
9026-84-0
データベース
インターンツ
内部ビュー
ブレンダ
ブレンダエントリー
エクスパシー
ナイスザイムビュー
ケッグ
KEGGエントリー
メタサイク
代謝経路
プリアモス
プロフィール
PDB構造
RCSB PDB PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー
AmiGO / QuickGO索 PMC
記事
パブメッド
記事 NCBI タンパク質
ATP +
d-リボース ⇌ ADP +
d-リボース 5-リン酸
したがって、この酵素の2 つの基質はATPとd-リボースであり、その 2 つの生成物はADPとd-リボース 5-リン酸です。
この酵素クラスの系統名はATP:
d -リボース 5-ホスホトランスフェラーゼです。一般に使用される他の名前には、デオキシリボキナーゼ、リボキナーゼ (リン酸化)、およびd-リボキナーゼなどがこの酵素はペントースリン酸経路に関与します。
リボキナーゼ (RK) は、糖キナーゼのホスホフルクトキナーゼ B (PfkB) ファミリーに属します。このファミリーの他のメンバー (RK ファミリーとしても知られています) には、アデノシン キナーゼ (AK)、イノシン-グアノシン キナーゼ、フルクトキナーゼ、および 1-ホスホフルクトキナーゼが含まれます。 PfkB/RK ファミリーのメンバーは 3 つの保存された配列モチーフの存在によって識別され、このファミリーのタンパク質の酵素活性は一般に 5 価のイオンの存在に依存します。 PfkB タンパク質ファミリーの特徴的な特性である保存された NXXE モチーフは、5 価のイオン依存性に関与しています。RK および他のいくつかの PfK ファミリーのタンパク質の構造は、多くの生物から決定されています。 AdK と他の PfkB ファミリーのタンパク質間の配列類似性は低いにもかかわらず、これらのタンパク質は構造レベルでは非常に類似しています。

構造研究
2007 年末の時点で、このクラスの酵素については 7 つの構造が解明されており、PDBアクセッション コードは1GQT、1RK2、1RKA、1RKD、1RKS、1VM7、および2FV7です。

参考文献
^ Park J、Gupta RS 。「アデノシンキナーゼとリボキナーゼ – タンパク質の RK ファミリー」。細胞および分子生命科学。65 (18): 2875–96。土井: 10.1007/s00018-008-8123-1。PMID  18560757。S2CID  11439854。
^ ボーク P、サンダー C、バレンシア A (1993 年 1月)。「異なるタンパク質折り畳みにおける同様の酵素機能の収束進化:シュガーキナーゼのヘキソキナーゼ、リボキナーゼ、およびガラクトキナーゼファミリー」タンパク質科学。2 (1): 31-40。土井:10.1002/pro.5560020104。PMC 2142297。PMID 8382990。    ^ スパイチャラ J、ダッタ NS、高林 K、ダッタ M、フォックス IH、グリビン T、ミッチェル BS (1996 年 2月)。「ヒトアデノシンキナーゼcDNAのクローニング:微生物のリボキナーゼおよびフルクトキナーゼとの配列類似性」。アメリカ合衆国国立科学アカデミーの議事録。93 (3): 1232–7。Bibcode : 1996PNAS…93.1232S。土井: 10.1073/pnas.93.3.1232。PMC 40062。PMID 8577746。    ^ 少佐 MC、シン B、グプタ RS 。「五価イオン依存性は、さまざまな原因からのアデノシンキナーゼの保存された特性です。リン酸イオンとマグネシウムイオンの結合および基質阻害に関係する新規モチーフの同定です。」生化学。41 (12): 4059–69。土井:10.1021/bi0119161。PMID 11900549。   ^ シグレル JA、キャメロン AD、ジョーンズ TA、モウブレイ SL (1998 年 2月)。「1.8Åの分解能で決定されたリボースおよびジヌクレオチドと複合体の大腸菌リボキナーゼの構造: キナーゼ構造の新しいファミリーへの洞察」。構造。6 (2): 183–93。土井:10.1016/s0969-2126(98)00020-3。PMID 9519409。  

参考文献
アグラノフ BW、ブレイディ RO (1956 年 3月)。「子牛肝臓リボキナーゼの精製と性質」 (PDF)。生物化学ジャーナル。219 (1): 221-9。土井:10.1016/S0021-9258(18)65786-2。PMID  13295274。
ギンズバーグ A (1959 年 3月)。「Lactobacillus plantarum 由来のデオキシリボキナーゼ」 (PDF)。生物化学ジャーナル。234 (3): 481-7。土井:10.1016/S0021-9258(18)70230-5。PMID  13641245。 · ポータル:

 生物学
このEC 2.7 酵素”

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