リボノミクス


Ribonomics
リボノミクスは、 RNA 結合タンパク質(RBP)に関連するリボ核酸 ( RNA )の研究です。この用語は、もともとHIVで見つかった新規のリボザイムと RNA モチーフを発見するためにバイオインフォマティクス検索ツールを使用したRobert Cedergrenらによって導入されました。リボノミクスは、ゲノミクスやプロテオミクスと同様、細胞内のタンパク質との結合により RNA のサブセットを同定する大規模かつハイスループットなアプローチです。多くのメッセンジャー RNA (mRNA) は複数のプロセスに関連付けられているため、この技術はさまざまなプロセスの関係を研究するための簡単なメカニズムを提供します。細胞内システム。原核生物は、ポリシストロン性オペロンを介して細胞プロセスに共通の遺伝子を共制御します。真核生物の転写ではタンパク質をコードする mRNA がモノシストロニック方式で生成されるため、多くの遺伝子産物が同時に発現され ( 「遺伝子発現」を参照)、タイミングよく翻訳される必要がRBP はこれらのメッセージを物理的および生化学的に組織化してさまざまな細胞の場所に送り、そこで翻訳、分解、または保存する分子であると考えられます。したがって、RBP に関連する転写物の研究は ]真核生物では協調的な遺伝子制御の機構として重要であると考えられる。この調節の原因となる生化学的プロセスは、RNA の分解の促進または遅延であると考えられます。RNA 半減期への影響に加えて、翻訳速度は RNA とタンパク質の相互作用によっても変化すると考えられています。ショウジョウバエのELAV ファミリー 、酵母のPufファミリー、ヒトの La、Ro、、FMR タンパク質は、RBP の既知の例であり、転写後のタンパク質の多様な種とプロセスを示しています。遺伝子調節が関係しています。

こちらも参照ELAVL1 ELAVL2 ELAVL3
未知の機能の転写

参考文献
^ ブルドー V、フェルベイ G、パジョー M、パカン B、セデルグレン R (1999 年 11月)。「天然配列におけるRNAモチーフの分布」。核酸研究 27 (22): 4457–67。土井:10.1093/nar/27.22.4457。PMC  148730。PMID  10536156。
^ 「ELAVファミリー」. 2019 年8 月 30 日に取得。
^ Gerber AP、Herschlag D、Brown PO 。「酵母における機能的および細胞局所的に関連するmRNAとPufファミリーRNA結合タンパク質との広範な会合」。PLOSバイオル。2 (3):E79。土井:10.1371/journal.pbio.0020079。PMC 368173。PMID 15024427。   
open
^ コスモポウロウ A、ヴラッシ M、スタブラコウディス A、サカレロス C、サカレロス・ダイツィオティス M 。「La/SSB 自己抗原の T 細胞エピトープ: インスリン B ペプチド/HLA-DQ8 複合体との HLA-DQ2/DQ7 の相同性モデリングに基づく予測」。J 計算化学。27 (9): 1033–44。土井:10.1002/jcc.20422。PMID 16639700。S2CID 10167394。    ^ マッケンジー JJ、スマルゴ I、テイラー SA 。「古典的な脆弱X表現型を持つ男性における謎の完全変異」。クリン。ジュネット。70 (1): 39-42。土井: 10.1111/j.1399-0004.2006.00634.x。PMID 16813602。S2CID 38749866。   “