リボヌクレアーゼH – 日本語百科事典辞書

Ribonuclease_H

リボヌクレアーゼ H ( RNase HまたはRNHと略記) は、加水分解機構を介してRNA/ DNA基質内のRNAの切断を触媒する非配列特異的エンドヌクレアーゼ酵素のファミリーです。RNase H ファミリーのメンバーは、細菌から古細菌、真核生物に至るまで、ほぼすべての生物に存在します。
リボヌクレアーゼH
大腸菌RNase HI の結晶構造。
識別子
EC番号
3.1.26.4
CAS番号
9050-76-4
データベース
インターンツ
内部ビュー
ブレンダ
ブレンダエントリー
エクスパシー
ナイスザイムビュー
ケッグ
KEGGエントリー
メタサイク
代謝経路
プリアモス
プロフィール
PDB構造
RCSB PDB PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー
AmiGO / QuickGO索 PMC
記事
パブメッド
記事 NCBI タンパク質
レトロウイルスリボヌクレアーゼH
識別子
EC番号
3.1.26.13
データベース
インターンツ
内部ビュー
ブレンダ
ブレンダエントリー
エクスパシー
ナイスザイムビュー
ケッグ
KEGGエントリー
メタサイク
代謝経路
プリアモス
プロフィール
PDB構造
RCSB PDB PDBe PDBsum索 PMC
記事
パブメッド
記事 NCBI タンパク質
このファミリーは、基質の好みがわずかに異なる、進化的に関連したグループ、広義にはリボヌクレアーゼ H1 および H2 と呼ばれるグループに分けられます。ヒトゲノムはH1 と H2 の両方をコードします。ヒトリボヌクレアーゼ H2 は 3 つのサブユニットで構成されるヘテロ三量体複合体であり、そのいずれかにおける変異は、アイカルディグティエール症候群として知られる希少疾患の遺伝的原因の 1 つです。 3 番目のタイプは、H2 と密接に関連しており、少数の原核生物でのみ見出されますが、H1 と H2 は生命のすべての領域で発生します。さらに、RNase H1 様レトロウイルスリボヌクレアーゼ Hドメインは、 HIVなどのレトロウイルスによってコードされ、ウイルス複製に必要なマルチドメイン逆転写酵素タンパク質に存在します。
真核生物では、リボヌクレアーゼ H1 がミトコンドリアゲノムのDNA 複製に関与しています。H1 と H2 は両方とも、 R ループ構造の処理などのゲノム維持タスクに関与しています。
コンテンツ
1 分類と命名法2 構造 3 関数
3.1 リボヌクレアーゼ H1 3.2 リボヌクレアーゼH2
4 機構
5 人間の生物学では
5.1 病気における役割
6 ウイルスの場合
7 進化
8 アプリケーション
9 歴史
10 参考文献
11 外部リンク

分類と命名法
リボヌクレアーゼ H は、 RNA – DNA二重鎖の RNA 鎖に対して共通の基質特異性を持つエンドヌクレアーゼ酵素のファミリーです。定義により、RNase H は RNA 骨格のホスホジエステル結合を切断し、 3’ヒドロキシル基と5’リン酸基を残します。 RNase H は、レトロウイルスインテグラーゼ、DNAトランスポザーゼ、ホリデイジャンクションレゾルバーゼ、PiwiおよびArgonauteタンパク質、さまざまなエキソヌクレアーゼ、およびスプライソソームタンパク質Prp8などの他のヌクレアーゼおよび核酸処理酵素を含む、進化的に関連したスーパーファミリーのメンバーとして提案されています。
RNase H は、H1 と H2 の 2 つのサブタイプに大別できます。歴史的な理由から、真核生物ではアラビア数字で、原核生物ではローマ数字でそれぞれに指定されています。したがって、大腸菌ＲＮａｓｅＨＩは、ホモ・サピエンスＲＮａｓｅＨ１のホモログである。大腸菌および他の多くの原核生物では、 rnhA遺伝子は HI をコードし、rnhB遺伝子は HII をコードします。HIII と呼ばれる 3 番目の関連クラスは、少数の細菌と古細菌に発生します。それは原核生物の HII 酵素と密接に関連しています。

構造

各サブタイプの代表的なリボヌクレアーゼ H タンパク質の構造の比較。大腸菌タンパク質 (ベージュ、左上)では、4 つの保存された活性部位残基が球として示されています。H. sapiensタンパク質では、H1 サブタイプと H2 サブタイプに共通する構造コアが赤色で示されています。構造は大腸菌、PDB : 2RN2からレンダリングされます。T. マリティマ、PDB : 303F ; B. ステアロサーモフィラス、PDB : 2D0B ; ホモ・サピエンスH1、PDB : 2QK9 ; ホモ・サピエンス、PDB : 3P56。
RNase H の構造は、一般的に、 α ヘリックスの分布に囲まれた5 本鎖のβ シートから構成されます。すべての RNase H は、しばしば DEDD モチーフと呼ばれる、アスパラギン酸残基とグルタミン酸残基で構成される保存された配列モチーフを中心とした活性部位を持っています。これらの残基は、触媒的に必要なマグネシウムイオンと相互作用します。
RNase H2 は H1 より大きく、通常は追加のヘリックスを持っています。酵素のドメイン構成はさまざまです。H1 グループの一部の原核生物とほとんどの真核生物は、「ハイブリッド結合ドメイン」として知られる追加の小さなドメインをN 末端に持っています。これは、RNA:DNA ハイブリッド二本鎖への結合を促進し、場合によっては処理能力の向上をもたらします。 H1 グループのすべてのメンバーと H2 グループの原核生物メンバーは単量体として機能しますが、真核生物の H2 酵素は偏性ヘテロ三量体です。原核生物の HIII 酵素は、より広範な H2 グループのメンバーであり、N 末端TATA ボックス結合ドメインが追加されているほか、ほとんどの構造的特徴を H2 と共有しています。マルチドメイン逆転写酵素タンパク質に存在するレトロウイルス RNase H ドメインは、H1 グループによく似た構造を持っています。
RNase H1 は、構造と酵素活性の関係を調べるために広範囲に研究されています。これらは、タンパク質のフォールディングを研究するためのモデル系としても、特に大腸菌ホモログとして使用されます。 H1 グループ内では、より高い基質結合親和性と、より大きくより基本的な基質結合表面を提供するヘリックスおよび柔軟なループからなる構造要素の存在との間に関係が確認されています。C-ヘリックスは分散した分類分布を持っています。これは大腸菌およびヒト RNase H1 ホモログには存在しますが、HIV RNase H ドメインには存在しませんが、C ヘリックスを持つレトロウイルスドメインの例は存在します。

関数
リボヌクレアーゼ H 酵素は、二本鎖 RNA:DNA ハイブリッドのRNAのホスホジエステル結合を切断し、2 金属イオン触媒機構により切断部位の両端に3’ヒドロキシル基と5’リン酸基を残します。 Mg2+ や Mn2+ などの二価カチオンは、触媒機能に直接関与します。アミノ酸配列の違いに応じて、これらの RNase H は 1 型 RNase H と 2 型 RNase H に分類されます。 1 型 RNase H には、原核生物および真核生物の RNase H1 とレトロウイルスの RNase H が RNase H には、原核生物および真核生物の RNase H2 と細菌の RNase H3 がこれらの RNase H は、ヘテロ三量体の形態で存在する真核生物の RNase H2 を除いて、単量体の形態で存在します。 RNase H1 と H2 は、細胞内で異なる基質優先性と、異なるが重複する機能を持っています。原核生物と下等真核生物ではどちらの酵素も必須ではありませんが、高等真核生物では両方とも必須であると考えられています。 H1 酵素と H2 酵素の両方の活性の組み合わせは、酵素によるR ループの RNA 成分の分解によるゲノム安定性の維持に関連しています。

リボヌクレアーゼ H1
識別子
シンボル RNase H ファム PF00075 ファム・クラン CL0219 インタープロ IPR002156 プロサイト PS50879 利用可能なタンパク質構造:
ファム
構造物/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
リボヌクレアーゼ H1 酵素は、基質内に少なくとも 4 つのリボヌクレオチド含有塩基対を必要とし、デオキシリボヌクレオチドで構成される鎖から単一のリボヌクレオチドを除去することはできません。このため、RNase H1 酵素がDNA 複製中の岡崎フラグメントからのRNA プライマーのプロセシングに関与する可能性は低いと考えられます。 RNase H1 は、研究されている単細胞生物では必須ではありません。大腸菌では、RNase H1ノックアウトにより温度感受性の表現型が与えられ、出芽酵母では、ストレス応答に欠陥が生じます。
哺乳類を含む多くの真核生物では、RNase H1 遺伝子にミトコンドリア標的配列が含まれており、 MTS の存在有無にかかわらずアイソフォームの発現を引き起こします。その結果、RNase H1 はミトコンドリアと核の両方に局在します。ノックアウトマウスモデルでは、RNase H1 ヌル変異体は、ミトコンドリア DNA の複製に欠陥があるため、胚形成中に致死的になります。 RNase H1 の喪失によって誘発されるミトコンドリア DNA 複製の欠陥は、R ループプロセシングの欠陥による可能性が

リボヌクレアーゼH2
識別子
シンボル RNase HII ファム PF01351 ファム・クラン CL0219 インタープロ IPR024567 利用可能なタンパク質構造:
ファム
構造物/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
原核生物では、RNase H2 は単量体タンパク質として酵素的に活性です。真核生物では、これは触媒サブユニット A と構造サブユニット B および C で構成される偏性ヘテロ三量体です。A サブユニットは原核生物の RNase H2 と密接に相同ですが、B および C サブユニットは原核生物では明らかな相同体がなく、保存性が低いです。真核生物の中でも配列レベル。 B サブユニットはH2 複合体とPCNA の間のタンパク質間相互作用を媒介し、H2 を複製焦点に局在化させます。
原核生物と真核生物の両方の H2 酵素は、鎖内の単一のリボヌクレオチドを切断できます。しかし、それらはわずかに異なる切断パターンと基質の好みを持っています。原核生物の酵素は、5’デオキシリボヌクレオチドを持つリボヌクレオチドよりも進行性が低く、連続するリボヌクレオチドをより効率的に加水分解しますが、真核生物の酵素はより進行性であり、両方のタイプの基質を同様の効率で加水分解します。 RNase H2 の基質特異性により、R ループプロセシングに加えて、DNA から誤って取り込まれたリボヌクレオチドを除去するリボヌクレオチド除去修復にも役割が与えられます。 H1 と H2 は両方とも哺乳動物の細胞核に存在しますが、H2 はそこでの RNase H 活性の主要な供給源であり、ゲノムの安定性を維持するために重要です。
一部の原核生物は、原核生物の遺伝子に使用されるローマ数字命名法で RNase HIII と呼ばれる追加の H2 型遺伝子を保有しています。HIII タンパク質は、配列同一性および構造類似性により H2 グループとより密接に関連していますが、H1 によりよく似た基質優先性を持っています。原核生物に広く分布する HI と HII とは異なり、HIII は分類学的分布が散在し、少数の生物のみに見られます。これは古細菌でやや一般的であり、HI と同じ原核生物のゲノムではめったに、またはまったく見つかりません。

機構

HIV-1 RNase H ドメイン
内の 2 つの金属イオンを用いた RNase H 触媒の反応機構
ほぼすべての RNase H の活性部位には、DEDD モチーフとして知られる 4 つの負に荷電したアミノ酸残基が含まれています。多くの場合、HIV-1、ヒト、大腸菌などにはヒスチジンも存在します。
帯電した残基は、触媒作用に必要な 2 つの金属イオンに結合します。生理学的条件下では、これらはマグネシウムイオンですが、マンガンも通常は酵素活性をサポートしますが、カルシウムまたは高濃度の Mg2+ は活性を阻害します。
実験的証拠とコンピューターシミュレーションに基づいて、酵素は保存されたヒスチジンを持つ金属イオンの1つに結合した水分子を活性化します。遷移状態は本質的に会合性であり、プロトン化されたリン酸と脱プロトン化されたアルコキシド脱離基との中間体を形成します。脱離基は、 pKaが高く、プロトン化される可能性が高いグルタミン酸を介してプロトン化されます。このメカニズムは、 RNase TとCas9酵素の RuvC サブユニットに似ており、どちらもヒスチジンと 2 金属イオンのメカニズムを使用します。
切断生成物の放出のメカニズムはまだ未解決です。時間分解結晶学および同様のヌクレアーゼからの実験的証拠は、活性部位に動員される反応における 3 番目のイオンの役割を示しています。

人間の生物学では
ヒトゲノムには、 RNase H をコードする 4 つの遺伝子が含まれています。
RNASEH1、H1 (単量体) サブタイプの例
RNASEH2A、三量体 H2 複合体の触媒サブユニット
RNASEH2B、三量体 H2 複合体の構造サブユニット
RNASEH2C、三量体 H2 複合体の構造サブユニット
さらに、ヒト内因性レトロウイルスのゲノムの統合を反映して、レトロウイルス起源の遺伝物質がゲノム内に頻繁に出現します。このような組み込みイベントにより、RNase H ドメインを含むレトロウイルス逆転写酵素をコードする遺伝子が存在します。例としてはERVK6が長末端反復(LTR) および非長末端反復 (非 LTR)レトロトランスポゾンもゲノム内で一般的であり、多くの場合、複雑な進化の歴史を持つ独自の RNase H ドメインを含みます。

病気における役割

三量体ヒト H2 複合体の構造。青色は触媒 A サブユニット、茶色は構造 B サブユニット、ピンクは構造 C サブユニットを示します。B サブユニットと C サブユニットは活性部位と相互作用しませんが、活性には必要です。活性部位の触媒残基はマゼンタで示されています。黄色で示された位置は、既知の AGS 変異のある位置です。最も一般的な AGS 変異 (サブユニット B の 177 位のアラニンからスレオニンへ) は緑色の球として示されています。これらの変異の多くは、インビトロでの触媒活性を破壊しませんが、複合体を不安定にしたり、細胞内の他のタンパク質とのタンパク質間相互作用を妨害したりします。
小規模な研究では、ヒト RNase H1 の変異が、ミトコンドリア病の共通の特徴である慢性進行性外眼筋麻痺と関連していることがわかっています。
3つの RNase H2 サブユニットのいずれかにおける変異は、アイカルディグティエール症候群(AGS)として知られる稀な遺伝性疾患の原因であることが十分に確立されており、この症候群は幼い頃に神経学的および皮膚学的症状として現れます。 AGS の症状は先天性ウイルス感染症の症状によく似ており、I 型インターフェロンの不適切なアップレギュレーションに関連しています。AGS は、他の遺伝子、 TREX1、SAMHD1、ADAR、およびMDA5 /IFIH1の変異によって引き起こされることもこれらはすべて核酸プロセシングに関与しています。 AGS患者集団における変異分布の特徴付けでは、全AGS変異のうちRNASEH2Aで5%、2Bで36%、2Cで12%が見つかった。 2B の変異は、やや軽度の神経障害と、他の AGS 関連遺伝子型の患者で検出できるインターフェロン誘発性遺伝子上方制御の欠如と関連している。

ウイルスの場合
参照:レトロウイルスリボヌクレアーゼ H

HIV 逆転写酵素ヘテロ二量体の結晶構造 (黄色と緑色)、RNase H ドメインは青色 (マゼンタ球の活性部位) で示されています。オレンジ色の核酸鎖は RNA、赤い鎖は DNA です。
ウイルスの 2 つのグループは、その生活環の一部として逆転写を使用します。1つは一本鎖 RNA でゲノムをコードし、二本鎖 DNA 中間体を介して複製するレトロウイルスです。dsDNA -RT ウイルスは、RNA の「プレゲノム」中間体を介して二本鎖 DNA ゲノムを複製します。病原性の例には、それぞれヒト免疫不全ウイルスとB 型肝炎ウイルスが含まれます。どちらも、 RNase H ドメインを含む大きな多機能逆転写酵素 (RT) タンパク質をコードします。
HIV-1およびマウス白血病ウイルス由来のレトロウイルス RT タンパク質は、このファミリーのメンバーの中で最もよく研究されています。レトロウイルス RT は、ウイルスの一本鎖 RNA ゲノムを二本鎖 DNA に変換する役割を果たします。このプロセスには 3 つのステップが必要です。まず、RNA 依存性 DNA ポリメラーゼ活性によってプラス鎖 RNA テンプレートからマイナス鎖DNA が生成され、RNA:DNA ハイブリッド中間体が生成されます。次に、RNA 鎖が破壊されます。第三に、DNA 依存性の DNA ポリメラーゼ活性によりプラス鎖 DNA が合成され、最終生成物として二本鎖 DNA が生成されます。このプロセスの 2 番目のステップは、RT タンパク質のC 末端に位置する RNase H ドメインによって実行されます。
RNase H は 3 種類の切断作用を実行します。プラス鎖 RNA ゲノムの非特異的分解、マイナス鎖tRNAプライマーの特異的除去、プラス鎖プリンリッチポリプリントラクト (PPT) プライマーの除去です。 RNase H はプラス鎖のプライミングに役割を果たしますが、新しいプライマー配列を合成する従来の方法では役割を果たしません。むしろ、RNase H は、RNase H 切断に耐性のある「プライマー」を PPT から作成します。PPT 以外のすべての塩基を除去することにより、PPT はその長い末端反復の U3 領域の終わりのマーカーとして使用されます。
RNase H 活性はウイルスの増殖に必要であるため、このドメインは、 HIV/AIDSやレトロウイルスによって引き起こされるその他の症状の治療に使用される抗レトロウイルス薬開発の薬物標的と考えられています。いくつかの異なる化学型のレトロウイルス RNase H の阻害剤が同定されており、その多くは活性部位のカチオンのキレート化に基づく作用機序を持っています。 RT のポリメラーゼ機能を特異的に阻害する逆転写酵素阻害剤は臨床で広く使用されていますが、RNase H 機能の阻害剤は使用されこれは、HIV によってコードされている唯一の酵素機能で、臨床使用されている薬剤の標的になっていないものです。

進化
RNase H は広く分布しており、生命のあらゆる領域に存在します。このファミリーはヌクレアーゼ酵素のより大きなスーパーファミリーに属しており、進化的に古いものであると考えられています。原核生物のゲノムには複数の RNase H 遺伝子が存在することがよくありますが、HI、HII、および HIII 遺伝子の出現と全体的な系統関係との間にはほとんど相関関係がなく、水平遺伝子伝達が遺伝子の分布の確立に役割を果たしている可能性があることを示唆しています。この酵素たち。RNase HI と HIII が同じ原核生物のゲノムに現れることはほとんどありません。生物のゲノムに複数の RNase H 遺伝子が含まれる場合、それらの遺伝子の活性レベルに大きな違いが生じることがこれらの観察は、RNase H 遺伝子間の機能的重複を最小限に抑える進化パターンを反映していると示唆されています。 RNase HIII は原核生物に特有であり、分類学的分布が分散しており、細菌と古細菌の両方に見られます。それはかなり早い段階で HII から分岐したと考えられています。
真核生物におけるRNase H2の進化の軌跡、特に真核生物のホモログが偏性ヘテロ三量体になるメカニズムは不明である。B サブユニットと C サブユニットには、原核生物には明らかな相同体がありません。

アプリケーション
RNase H は二本鎖 RNA:DNA ハイブリッドの RNA のみを特異的に分解するため、分子生物学の実験用試薬として一般的に使用されています。大腸菌RNase HIおよびHIIの精製調製物は市販されています。RNase HI は、逆転写による第一鎖相補 DNA (cDNA) 合成後の RNA テンプレートを破壊するためによく使用されます。また、DNA の短い相補的セグメントの存在下で特定の RNA 配列を切断するために使用することもできます。表面プラズモン共鳴などの高感度技術を検出に使用できます。 RNase HII は、岡崎フラグメントの RNA プライマー成分を分解したり、リボヌクレオチドを含む位置に一本鎖ニックを導入したりするために使用できます。 RNase H依存性PCRまたはrhPCRとして知られるホットスタートPCRの変種は、超好熱性古細菌Pyrococcus abyssi由来の熱安定性RNase HIIを使用することが記載されている。注目すべきことに、試薬として一般的に使用されるリボヌクレアーゼ阻害タンパク質は、HI または HII の活性の阻害には効果がありません。

歴史
リボヌクレアーゼ H は、1969 年に研究者らが子ウシ胸腺でRNA:DNA ハイブリッドエンドヌクレアーゼ活性を発見し、そのハイブリッド特異性を示すために「リボヌクレアーゼH 」という名前を付けたとき、ピーターハウゼンの研究室で初めて発見されました。 RNase H 活性はその後、ウイルス逆転写の初期研究中に大腸菌およびRNA ゲノムを持つオンコウイルスのサンプルで発見されました。後に、子ウシ胸腺抽出物には RNase H 活性を持つ複数のタンパク質が含まれており、大腸菌には 2 つの RNase H 遺伝子が含まれていることが明らかになった。当初、現在真核生物でRNase H2として知られている酵素はH1と呼ばれ、またその逆も同様であったが、比較分析を容易にするために真核生物の酵素の名前は大腸菌のものと一致するように変更され、現代の命名法となった。原核生物の酵素はローマ数字で示され、真核生物の酵素はアラビア数字で示されます。 1999 年に報告された原核生物の RNase HIII は、同定された最後の RNase H サブタイプでした。
真核生物の RNase H2 を特徴付けることは、その存在量が少ないこともあり、歴史的には困難でした。酵素の精製における慎重な努力により、大腸菌RNase H2 とは異なり、真核生物の酵素には複数のサブユニットがあることが示唆されました。大腸菌タンパク質のS. cerevisiaeホモログ(つまり、H2A サブユニット) は、酵母ゲノムの配列が決定されたときにバイオインフォマティクスによって容易に同定できましたが、対応するタンパク質は単独では酵素活性を持たないことが判明しました。。最終的に、酵母の B サブユニットと C サブユニットが共精製によって単離され、酵素活性に必要であることが判明しました。しかし、酵母の B サブユニットと C サブユニットは、他の生物の相同体との配列同一性が非常に低く、対応するヒトタンパク質は、3 つすべての変異がアイカルディ・グティエール症候群の原因であることが判明した後でのみ最終的に同定された。

参考文献
^ PDB : 1JL1 ; ゴードケン ER、マーキー S 。「リボヌクレアーゼ HI の熱安定化変異体の自然状態のエネルギー学」。分子生物学ジャーナル。314 (4): 863–71。土井：10.1006/jmbi.2001.5184。PMID 11734003。
^ チェリテッリ SM、クラウチ RJ 。「リボヌクレアーゼ H: 真核生物の酵素」。FEBS ジャーナル。276 (6): 1494–505。土井: 10.1111/j.1742-4658.2009.06908.x。PMC 2746905。PMID 19228196。

^ クロウ YJ、リーチ A、ヘイワード BE、ガーナー A、パーマー R、グリフィス E、他。。「リボヌクレアーゼ H2 サブユニットをコードする遺伝子の変異は、アイカルディ・グティエール症候群を引き起こし、先天性ウイルス脳感染症を模倣します。」自然遺伝学。38 (8): 910–6。土井：10.1038/ng1842。PMID 16845400。S2CID 8076225。

^ フィギエル M、ノボトニー M 。「RNase H3-基質複合体の結晶構造は、RNA/DNA ハイブリッド認識の並行進化を明らかにする」。核酸研究。42 (14): 9285–94。土井：10.1093/nar/gku615。PMC 4132731。PMID 25016521。

^ デイビス JF、ホトムスカ Z、ホトムスキー Z、ジョーダン SR、マシューズ DA (1991 年 4月）。「HIV-1逆転写酵素のリボヌクレアーゼHドメインの結晶構造」。科学。252 (5002): 88–95。Bibcode : 1991Sci…252…88D。土井：10.1126/science.1707186。PMID 1707186。
^ Hansen J、Schulze T、Mellert W、Moelling K (1988 年 1月）。「モノクローナル抗体による HIV 特異的 RNase H の同定と特性評価」。EMBO ジャーナル。7 (1): 239–43。土井：10.1002/j.1460-2075.1988.tb02805.x。PMC 454263。PMID 2452083。

^ 田所 T、金谷 S 。「リボヌクレアーゼ H: 原核生物酵素の分子多様性、基質結合ドメイン、および触媒機構」。FEBS ジャーナル。276 (6): 1482–93。土井: 10.1111/j.1742-4658.2009.06907.x。PMID 19228197。S2CID 29008571。

^ マジョレク KA、ドゥニン＝ホルカヴィッツ S、ステチェキェヴィチ K、ムシェフスカ A、ノボトニー M、ジナルスキー K、ブイニツキ JM 。「RNase H 様スーパーファミリー: 新しいメンバー、比較構造分析および進化的分類」。核酸研究。42 (7): 4160–79。土井：10.1093/nar/gkt1414。PMC 3985635。PMID 24464998。

^ ライス P、クレイギー R、デイビス DR (1996 年 2月）。「レトロウイルスインテグラーゼとその同類」。構造生物学における現在の見解。6 (1): 76-83。土井: 10.1016/s0959-440x(96)80098-4。PMID 8696976。
^ シュミット TJ、クラーク JE、ノッツ TA 。「リボヌクレアーゼ H の熱的および機械的多状態フォールディング」。化学物理学ジャーナル。131 (23): 235101。書誌コード: 2009JChPh.131w5101S。土井: 10.1063/1.3270167。PMID 20025349。
^ ノボトニー M、チェリテッリ SM、ギルランド R、ガイダマコフ SA、クラウチ RJ、ヤン W 。「HBDによるRNA/DNAハイブリッドの特異的認識とヒトRNase H1活性の増強」。EMBO ジャーナル。27 (7): 1172–81。土井：10.1038/emboj.2008.44。PMC 2323259。PMID 18337749。

^ チェッコーニ C、シャンク EA、ブスタマンテ C、マルキー S 。「単一タンパク質分子の三状態フォールディングの直接観察」。科学。309 (5743): 2057–60。Bibcode : 2005Sci…309.2057C。土井: 10.1126/science.1116702。PMID 16179479。S2CID 43823877。

^ ホーリアン J、マーキー S (1999 年 3月）。「中温性リボヌクレアーゼ H と好熱性リボヌクレアーゼ H の熱力学的比較」。生化学。38 (12): 3831–6。土井：10.1021/bi982684h。PMID 10090773。
^ Raschke TM、Marqusee S (1997 年 4月）。「リボヌクレアーゼ H の動的フォールディング中間体は、天然条件下で検出される酸の溶融小球と部分的に折り畳まれていない分子に似ています。」自然の構造生物学。4 (4): 298–304。土井：10.1038/nsb0497-298。PMID 9095198。S2CID 33673059。

^ シュルツ SJ、シャンプー JJ 。「RNase H 活性: 逆転写における構造、特異性、および機能」。ウイルス研究。134 (1-2): 86-103。土井：10.1016/j.virusres.2007.12.007。PMC 2464458。PMID 18261820。

^ Champoux JJ、Schultz SJ 。「リボヌクレアーゼ H: レトロウイルス逆転写における特性、基質特異性、および役割」。FEBS ジャーナル。276 (6): 1506–16。土井: 10.1111/j.1742-4658.2009.06909.x。PMC 2742777。PMID 19228195。

^ ヤン W、リー JY、ノウォトニー M 。「核酸の生成と破壊: 2 つの Mg2+ イオン触媒作用と基質特異性」。分子細胞。22 (1): 5-13。土井：10.1016/j.molcel.2006.03.013。PMID 16600865。
^ 大谷N、春木M、森川M、金谷S (1999年1月）。「RNase H の分子多様性」。生物科学および生物工学のジャーナル。88 (1): 12-9。土井：10.1016/s1389-1723(99)80168-6。PMID 16232566。
^ Bubeck D、Rejns MA、Graham SC、Astell KR、Jones EY、Jackson AP 。「PCNA は、DNA 複製および修復基質に対する 2 型 RNase H 活性を指示します。」核酸研究。39 (9): 3652–66。土井：10.1093/nar/gkq980。PMC 3089482。PMID 21245041。

^ Figiel M、Chon H、Cerritelli SM、Cybulska M、Crouch RJ、Nowotny M 。「ヒトRNase H2複合体の構造的および生化学的特徴付けにより、基質認識とアイカルディ・グティエール症候群の欠陥の分子基盤が明らかになりました。」生物化学ジャーナル。286 (12): 10540–50。土井：10.1074/jbc.M110.181974。PMC 3060507。PMID 21177858。

^ アモン JD、コシュランド D 。「RNase H は、R ループ誘発 DNA 損傷の効率的な修復を可能にします。」eライフ。5 : e20533。土井：10.7554/eLife.20533。PMC 5215079。PMID 27938663。

^ リマ WF、マレー HM、ダムル SS、ハート CE、フン G、デオヨス CL、他。。「生存可能なRNaseH1ノックアウトマウスは、RNaseH1がRループプロセシング、ミトコンドリアおよび肝機能に必須であることを示した。」核酸研究。44 (11): 5299–312。土井：10.1093/nar/gkw350。PMC 4914116。PMID 27131367。

^ アルチャンドラン A、チェリテッリ S、成松 S、板谷 M、シン DY、島田 Y、クラウチ RJ 。「リボヌクレアーゼ H1 または H2 が存在しないと、ヒドロキシ尿素、カフェイン、メタンスルホン酸エチルに対する出芽酵母の感受性が変化します。DNA 複製と修復における RNase H の役割への影響」。遺伝子から細胞へ。5 (10): 789–802。土井：10.1046/j.1365-2443.2000.00373.x。PMID 11029655。
^ Cerritelli SM、Flolova EG、Feng C、Grinberg A、Love PE、Crouch RJ 。「ミトコンドリア DNA の生成の失敗は、Rnaseh1 ヌルマウスの胎児致死をもたらします。」分子細胞。11 (3): 807–15。土井: 10.1016/s1097-2765(03)00088-1。PMID 12667461。
^ レイエス A、メルキオンダ L、ナスカ A、カララ F、ラマンテア E、ザノリーニ A、他。。「RNASEH1 変異は mtDNA 複製を損ない、成人発症のミトコンドリア脳筋症を引き起こす」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。97 (1): 186–93。土井：10.1016/j.ajhg.2015.05.013。PMC 4572567。PMID 26094573。

^ Hollis T、ニューメキシコ州シャバン（2011-01-01)。ニコルソンAW（編）。リボヌクレアーゼ。核酸と分子生物学。シュプリンガーベルリンハイデルベルク。299 ～317ページ。土井: 10.1007/978-3-642-21078-5_12。ISBN
978-3-642-21077-8。
^ Chon H、Vassilev A、DePamphilis ML、Zhao Y、Zhang J、Burgers PM、他。。「ヒト RNase H2 複合体の活性と特性に対する 2 つのアクセサリーサブユニット、RNASEH2B および RNASEH2C の寄与」。核酸研究。37 (1): 96-110。土井：10.1093/nar/gkn913。PMC 2615623。PMID 19015152。

^ Reijns MA、ジャクソン AP 。「健康と病気におけるリボヌクレアーゼ H2」。生化学会トランザクション。42 (4): 717–25。土井：10.1042/BST20140079。PMID 25109948。
^ Wahba L、Amon JD、Koshland D、Vuica-Ross M 。「RNase H と複数の RNA 生合成因子は協力して、RNA:DNA ハイブリッドがゲノム不安定性を引き起こすのを防ぎます。」分子細胞。44 (6): 978–88。土井：10.1016/j.molcel.2011.10.017。PMC 3271842。PMID 22195970。

^ Kim N、Huang SN、Williams JS、Li YC、Clark AB、Cho JE、他。。「酵母トポイソメラーゼ I による DNA 内のリボヌクレオチドの突然変異誘発性プロセシング」。科学。332 (6037): 1561–4。Bibcode : 2011Sci…332.1561K。土井：10.1126/science.1205016。PMC 3380281。PMID 21700875。

^ Ohtani N、Haruki M、Morikawa M、Crouch RJ、Itaya M、Kanaya S (1999 年 1月）。「枯草菌由来の Mn2+ 依存性 RNase HII および Mg2+ 依存性 RNase HIII をコードする遺伝子の同定: RNase H の 3 つのファミリーへの分類」。生化学。38 (2): 605-18。土井：10.1021/bi982207z。PMID 9888800。
^ こちわH、富田M、金井A 。「重複遺伝子の継承を回避するための原核生物におけるリボヌクレアーゼ H 遺伝子の進化」。BMC進化生物学。7 : 128.土井: 10.1186/1471-2148-7-128。PMC 1950709。PMID 17663799。

^ アラ NR、ニコルソン AW 。「ヒトRNase H1によるRNA・DNAヘテロ二本鎖切断における保存されたヒスチジンの二重機能的役割の証拠」。FEBSジャーナル。279 (24): 4492–500。土井：10.1111/febs.12035。PMC 3515698。PMID 23078533。

^ ロスタ E、ヤン W、ハマー G 。「リボヌクレアーゼ H1 の二金属イオン触媒作用のカルシウム阻害」。アメリカ化学会誌。136 (8): 3137–44。土井：10.1021/ja411408x。PMC 3985467。PMID 24499076。

^ デュール S、ボヒューセヴィッツ O、ベルタ D、スアルディアス R、ピーター C、ジャンブリナ PG、ピーター C、シャオ Y、ロスタ E （2021 年 6 月 16 日)。「DEDDh モチーフにおける保存された残基の役割: HIV-1 RNase H のプロトン移動機構」。ACS触媒作用。11 (13): 7915–7927。土井：10.1021/acscatal.1c01493。S2CID 236285134。
^ ガン J、ショー G、トロペア JE、ウォー DS、コート DL、ジ X 。「リボヌクレアーゼIIIによる二本鎖RNAプロセシングの段階的モデル」。モル微生物。67 (1): 143-54。土井: 10.1111/j.1365-2958.2007.06032.x。PMID 18047582。
^ サマラ NL、ヤン W 。「カチオン輸送はRNA加水分解を促進する」。自然の構造および分子生物学。25 (8): 715–721。土井: 10.1038/s41594-018-0099-4。PMC 6110950。PMID 30076410。

^ レウス K、メイヤー J、ザウター M、シェラー D、ミュラーランツシュ N、ミース E 。「7番染色体上のヒト内因性レトロウイルスHERV-K(HML-2.HOM)(ERVK6)のゲノム構成」。ゲノミクス。72 (3): 314-20。土井：10.1006/geno.2000.6488。PMID 11401447。
^ ウスチアンツェフ K、ブリノフ A、スミシュリャエフ G （2017 年 3 月 14 日)。「卵菌と植物におけるレトロトランスポゾンの収束」。モバイル DNA。8 (1): 4.土井: 10.1186/s13100-017-0087-y。PMC 5348765。PMID 28293305。

^ ウスチアンツェフ K、ノヴィコワ O、ブリノフ A、スミシュリャエフ G 。「LTR レトロトランスポゾンとレトロウイルスにおけるリボヌクレアーゼ h の収束進化」。分子生物学と進化。32 (5): 1197–207。土井: 10.1093/molbev/msv008。PMC 4408406。PMID 25605791。

^ マリク HS （2005)。「レトロ転移因子におけるリボヌクレアーゼ H の進化」。細胞遺伝学およびゲノム研究。110 (1-4): 392-401。土井：10.1159/000084971。PMID 16093691。S2CID 7481781。

^ Figiel M、Chon H、Cerritelli SM、Cybulska M、Crouch RJ、Nowotny M 。「ヒトRNase H2複合体の構造的および生化学的特徴付けにより、基質認識とアイカルディ・グティエール症候群の欠陥の分子基盤が明らかになりました。」生物化学ジャーナル。286 (12): 10540–50。土井：10.1074/jbc.M110.181974。PMC 3060507。PMID 21177858。

^ オルチェージ S、ラピアーナ R、ファッツィ E （2009)。「アイカルディ・グティエール症候群」。英国医学報。89 : 183–201。土井：10.1093/bmb/ldn049。PMID 19129251。
^ クロウ YJ、マネル N 。「アイカルディ・グティエール症候群とI型インターフェロノパシー」。自然のレビュー。免疫学。15 (7): 429–40。土井：10.1038/nri3850。PMID 26052098。S2CID 34259643。

^ Crow YJ、Chase DS、Lowenstein Schmidt J、Szynkiewicz M、Forte GM、Gornall HL、他。。「TREX1、RNASEH2A、RNASEH2B、RNASEH2C、SAMHD1、ADAR、およびIFIH1の変異に関連するヒト疾患表現型の特徴付け」。アメリカ医学遺伝学ジャーナル。パート A。167A (2): 296–312。土井：10.1002/ajmg.a.36887。PMC 4382202。PMID 25604658。

^ ライス G、パトリック T、パーマー R、テイラー CF、エイビー A、アイカルディ J、他。。「アイカルディ・グティエール症候群の臨床的および分子的表現型」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。81 (4): 713–25。土井：10.1086/521373。PMC 2227922。PMID 17846997。

^ Sarafianos SG、Das K、Tantillo C、Clark AD、Ding J、Whitcomb JM、他。。「ポリプリントラクトRNA:DNAと複合体を形成したHIV-1逆転写酵素の結晶構造」。EMBO ジャーナル。20 (6): 1449–61。土井: 10.1093/emboj/20.6.1449。PMC 145536。PMID 11250910。

^ Seeger C、Mason WS 。「B型肝炎ウイルス感染の分子生物学」。ウイルス学。479–480:672–86。土井：10.1016/j.virol.2015.02.031。PMC 4424072。PMID 25759099。

^ モーリング K、ブロッカー F、ケリガン JE （2014-01-01)。「RNase H: 特異性、作用機序、および抗ウイルス標的」。ヴィチェンツィ E、ポリ G (編)。ヒトレトロウイルス。分子生物学の方法。Vol. 1087. ヒューマナプレス。71–84ページ。土井: 10.1007/978-1-62703-670-2_7。ISBN
978-1-62703-669-6。PMID 24158815。
^ 水野 M、安川 K、イノウエ K . 「RNase H 活性の除去によるモロニーマウス白血病ウイルス逆転写酵素の安定化のメカニズムについての洞察」。バイオサイエンス、バイオテクノロジー、生化学。74 (2): 440-2。土井：10.1271/bbb.90777。PMID 20139597。S2CID 28110533。

^ Coté ML、Roth MJ 。「マウス白血病ウイルス逆転写酵素: HIV-1 逆転写酵素との構造比較」。ウイルス研究。134 (1-2): 186-202。土井: 10.1016/j.virusres.2008.01.001。PMC 2443788。PMID 18294720。

^ ノボトニー M、フィギエル M （2013-01-01)。LeGrice S、Gotte M (編)。ヒト免疫不全ウイルス逆転写酵素。スプリンガーニューヨーク。53–75ページ。土井: 10.1007/978-1-4614-7291-9_3。ISBN
978-1-4614-7290-2。
^ Beilhartz GL、Götte M 。「HIV-1 リボヌクレアーゼ H: 構造、触媒機構および阻害剤」。ウイルス。2 (4):900-26。土井: 10.3390/v2040900。PMC 3185654。PMID 21994660。

^ Klarmann GJ、Hawkins ME、Le Grice SF （2002)。「レトロウイルスのリボヌクレアーゼ H の複雑さを明らかにすることで、治療標的としての可能性が明らかになります。」エイズに関するレビュー。4 (4): 183–94。PMID 12555693。
^ トラモンターノ E、ディサント R （2010). 「HIV-1 RT 関連 RNase H 機能阻害剤: 医薬品開発の最近の進歩」。現在の医薬品化学。17 (26): 2837–53。土井：10.2174/092986710792065045。PMID 20858167。
^ Cao L、Song W、De Clercq E、Zhan P、Liu X 。「小分子HIV-1 RNase H阻害剤の研究における最近の進歩」。現在の医薬品化学。21 (17): 1956 ～ 1967 年。土井：10.2174/0929867321666140120121158。PMID 24438523。
^ Ma BG、Chen L、Ji HF、Chen ZH、Yang FR、Wang L、他。。「非常に古いタンパク質の特徴」。生化学および生物物理学研究コミュニケーション。366 (3): 607-11. 土井：10.1016/j.bbrc.2007.12.014。PMID 18073136。
^ ブリンデフォーク B、デサイー BH、イェイツ C、オレンゴ C、ヴェルナー F、プール AM 。「TBPドメインスーパーファミリーの進化史」。核酸研究。41 (5): 2832–45。土井：10.1093/nar/gkt045。PMC 3597702。PMID 23376926。

^ ニコルズ NM、ユエ D （2001-01-01)。リボヌクレアーゼ。分子生物学における現在のプロトコル。Vol. 第 3 章。John Wiley & Sons， Inc.、ユニット 3.13 ページ。土井：10.1002/0471142727.mb0313s84。ISBN
978-0-471-14272-0。PMID 18972385。S2CID 221604377。
^ Loo JF、Wang SS、Peng F、He JA、He L、Guo YC、他。。「RNase H を使用して、A 型インフルエンザウイルス H1N1 感染患者の喉ぬぐい液から MicroRNA 29a-3p を検出する非 PCR SPR プラットフォーム」。アナリスト。140 (13): 4566–75。Bibcode : 2015Ana…140.4566L。土井: 10.1039/C5AN00679A。PMID 26000345。S2CID 28974459。

^ グッドリッチ TT、リー HJ、コーン RM 。「RNAマイクロアレイの酵素増幅SPRイメージング測定によるゲノムDNAの直接検出」。アメリカ化学会誌。126 (13): 4086–7。CiteSeerX 10.1.1.475.1922。土井：10.1021/ja039823p。PMID 15053580。

^ ドボシー JR、ローズ SD、ベルツ KR、ラップ SM、パワーズ KM、ベルケ MA、ウォルダー JA 。「RNase H 依存性 PCR (rhPCR): ブロックされた切断可能プライマーを使用した特異性の向上と一塩基多型検出」。BMCバイオテクノロジー。11 : 80.土井: 10.1186/1472-6750-11-80。PMC 3224242。PMID 21831278。

^ スタイン H、ハウゼン P (1969 年 10月）。「DNA-RNA ハイブリッドの RNA 部分を分解するウシ胸腺由来の酵素: DNA 依存性 RNA ポリメラーゼへの影響」。科学。166 (3903): 393–5。Bibcode : 1969Sci…166..393S。土井：10.1126/science.166.3903.393。PMID 5812039。S2CID 43683241。

^ ハウゼン P、スタイン H (1970 年 6月）。「リボヌクレアーゼ H。DNA-RNA ハイブリッドの RNA 部分を分解する酵素」。欧州生化学ジャーナル。14 (2): 278–83。土井：10.1111/j.1432-1033.1970.tb00287.x。PMID 5506170。
^ ミラー HI、リッグス AD、ギル GN (1973 年 4月）。「大腸菌におけるリボヌクレアーゼ H (ハイブリッド)。同定と特性評価」。生物化学ジャーナル。248 (7): 2621–4。土井：10.1016/S0021-9258(19)44152-5。PMID 4572736。
^ メーリング K、ボローネージ DP、バウアー H、ビューゼン W、プラスマン HW、ハウゼン P (1971 年 12月）。「ウイルス逆転写酵素とRNA-DNAハイブリッドのRNA部分を分解する酵素との関連」。自然。234 (51): 240-3。土井：10.1038/newbio234240a0。PMID 4331605。
^ Grandgenett DP、Gerard GF、Green M (1972 年 12月）。「リボヌクレアーゼ H: リボ核酸腫瘍ウイルスのビリオンに遍在する活性」。ウイルス学ジャーナル。10 (6): 1136–42。土井: 10.1128/jvi.10.6.1136-1142.1972。PMC 356594。PMID 4118867。

^ ビューゼン W、ハウゼン P (1975 年 3月）。「子ウシ胸腺における独特のリボヌクレアーゼ H 活性」。欧州生化学ジャーナル。52 (1): 179-90。土井: 10.1111/j.1432-1033.1975.tb03985.x。PMID 51794。
^ カナヤ S、クラウチ RJ (1983 年 1月）。「大腸菌リボヌクレアーゼHをコードする遺伝子のDNA配列」。生物化学ジャーナル。258 (2): 1276–81。土井：10.1016/S0021-9258(18)33189-2。PMID 6296074。
^ 板谷M (1990年11月）. 「rnhB 遺伝子によってコードされる大腸菌 K-12 の 2 番目の RNase H (RNase HII) の単離と特性評価」。アメリカ合衆国国立科学アカデミーの議事録。87 (21): 8587–91。Bibcode : 1990PNAS…87.8587I。土井：10.1073/pnas.87.21.8587。PMC 55002。PMID 2172991。

^ Crouch RJ、Arudchandran A、Cerritelli SM （2001-01-01)。「出芽酵母のRNase H1: 方法と命名法」。酵素学の方法。341 : 395–413. 土井: 10.1016/s0076-6879(01)41166-9。ISBN
978-0-12-182242-2。PMID 11582793。
^ フランク P、ブラウンショファー＝ライター C、ヴィンタースベルガー U、グリム R、ビューゼン W (1998 年 10月）。「原核生物のRNase HIIのホモログであるヒトRNase HIの大サブユニットをコードするcDNAのクローニング」。アメリカ合衆国国立科学アカデミーの議事録。95 (22): 12872–7。Bibcode : 1998PNAS…9512872F。土井：10.1073/pnas.95.22.12872。PMC 23637。PMID 9789007。

^ Frank P、Braunshofer-Reiter C、Wintersberger U (1998 年 1月）。「酵母のRNase H(35)は哺乳類のRNase HIに相当し、原核生物のRNase HIIと進化的に関連しています。」FEBS レター。421 (1): 23-6。土井: 10.1016/s0014-5793(97)01528-7。PMID 9462832。
^ チョン HS、バックランド PS、チェン HC、カラバノフ AA、クラウチ RJ （2004-01-01)。「出芽酵母のRNase H2は3つのタンパク質の複合体です。」核酸研究。32 (2): 407-14。土井：10.1093/nar/gkh209。PMC 373335。PMID 14734815。

外部リンク
GeneReviews/NCBI/NIH/UW のアイカルディ・グティエール症候群に関するエントリー
米国国立医学図書館のRNase+H医療主題見出し(MeSH) · ポータル:

生物学”