Ribonuclease_III
リボヌクレアーゼ III (RNase III または RNase C) (BRENDA 3.1.26.3 ) は、 dsRNAを認識し、特定の標的位置で切断して成熟 RNA に変換するリボヌクレアーゼの一種です。これらの酵素は、RNase III ドメインと標識されたリボヌクレアーゼ ドメインを特徴とするエンドリボヌクレアーゼのグループです。これらは細胞内に遍在する化合物であり、RNA前駆体合成、RNA サイレンシング、pnp自己調節機構などの経路で主要な役割を果たしています。
リボヌクレアーゼIIIドメイン
二本鎖RNAと相互作用するリボヌクレアーゼIII構造。
識別子
シンボル RNase_III ファム PF00636 インタープロ IPR000999 プロサイトDOC00448 SCOP2
1jfz / SCOPe / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造:
ファム
構造物/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要 PDB 1o0w B:51-141 2a11 A:41-134 1jfz A:37-1211rc7 A:37-121 1yyw A:37-121 1i4s A:37-121 1rc5 B:37-121 1yyo A: 37-121 1yyk B:37-121 1yz9 A:37-121 2ffl A:333-418 1u61 A:10-111
コンテンツ
1 RNase IIIの種類
2 RNase III ドメインを含むヒトタンパク質
3 こちらも参照
4 参考文献
5 外部リンク
RNase IIIの種類
RNase III スーパーファミリーは、既知の 4 つのクラス 1、2、3、および 4 に分類されます。各クラスは、そのドメイン構造によって定義されます。
クラス 1 RNase III
クラス 1 RNase III 酵素はホモ二量体構造を持ち、その機能は dsRNA を複数のサブユニットに切断することです。これは Mg 2+依存性エンドヌクレアーゼであり、主に細菌およびバクテリオファージに存在します。クラス 1 RNase III はグロメロマイコタン真菌で発見されており、シアノバクテリアからの水平遺伝子伝達の結果であると考えられています。このクラスの RNase III には、大腸菌由来の RNC が通常、クラス I 酵素は単一の RNase III ドメイン (RIIIID) と、それに続く dsRNA 結合ドメイン (dsRBD) を持ちます。これらは、リボソーム RNA (rRNA)、核内低分子 RNA (snRNA)、および核小体低分子 RNA (snoRNA) の前駆体を処理します。クラス 1 RNase III の基本的な dsRNA 切断機能は、それが存在するほとんどの生物で保持されています。しかし、多くの種ではその機能が変化し、異なる生物学的役割や追加の生物学的役割を担うようになりました。
Rnc (UniProtKB P0A7Y0 ) – E.Coli – この RNase III は、dsRNA 上の複数の領域の切断を通じてウイルス転写物および一部の mRNA のプロセシングに関与します。この切断はリボソームタンパク質の存在によって影響を受ける可能性が Mini-III と呼ばれるクラス 1 RNase III のバリアントはホモ二量体酵素であり、RNase III ドメインのみで構成されています。
クラス 2 RNase III
二本鎖 RNA と複合体を形成した出芽酵母由来のクラス 2 リボヌクレアーゼ III (Rnt1p)
クラス II は、N 末端ドメイン (NTD)、RIIID、および dsRBD の存在によって定義されます。クラス II はいくつかの菌種に見られます。これらは、rRNA、snRNA、および snoRNA の前駆体を処理します。
クラス 2 RNase III ドメインを持つ酵母ヌクレアーゼ:
RNT1 (UniProtKB Q02555 ) – S. cerevisiae – この RNase III は、rDNA の転写とプロセシング、末端ループの切断を介した U2 snRNA の 3′ 末端形成、細胞壁ストレス応答と分解、および形態形成チェックポイントの制御に関与しています。遺伝子。
Pac1 (UniProtKB P22192 ) – S. pombe – この RNase III は酵母ゲノムの第 II 染色体上に位置し、過剰発現すると、不妊、交配効率の欠如、異常な有糸分裂細胞周期、および細胞の突然変異抑制に直接関与します。生命体。
クラス 3 RNase III
DGCR8 タンパク質の 2 つの C 末端ヘリックスと複合体を形成したヒト Drosha リボヌクレアーゼ酵素の結晶構造。
クラス 3 RNase III には、マイクロ RNA (miRNA)への前駆体の成熟において機能することが知られている酵素のDroshaファミリーが含まれます。
クラス 4 RNase III
クラス 4 RNase III には、RNA 干渉(RNAi)で機能することが知られている酵素のDicerファミリーが含まれます。クラス 4 III RNase は S-RNase コンポーネントです。これは、バラ科、ナス科、およびオオバコ科の自家不和合性システムの構成要素です。彼らは、さまざまな環境ストレスのシナリオに対処するために採用されます。
ダイサー酵素は、dsRNA 基質を、長さ 21 ～ 27 ヌクレオチドの範囲の個々のサイズの小さな RNA フラグメントに加工します。 Dicer には N 末端ヘリカーゼ/ATPase ドメインがあり、その後に未知の機能の別のドメインが続きます。それはまた、中央に位置するＰＡＺドメインと、１つのｄｓＲＢＤおよび２つのＲＮａｓｅ ＩＩＩ触媒ドメインを含むＣ末端構成とを含む。 Dicer は、TRBP、PACT、Ago2 などの他のタンパク質と相互作用します。 Dicer によって生成される RNA は、RNAi および関連経路を通じて同族遺伝子の特定のサイレンシングのシーケンスのガイドとして機能します。
RNase III ドメインを含むヒトタンパク質
ダイサー1
ドロシャ
こちらも参照
RNCO
参考文献
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には、パブリック ドメインPfamおよびInterProのテキストが組み込まれています: IPR000999
外部リンク
米国国立医学図書館のRNase+III医療主題見出し(MeSH)
EC 3.1.26.3 · “