Ribophorin
リボホリンはドーム状の膜貫通糖タンパク質であり、粗面小胞体の膜に存在しますが、平滑小胞体の膜には存在しません。リボホリンには、リボホリン I と II の 2 種類がこれらは、タンパク質複合体オリゴ糖転移酵素 (OST) において、指定された複合体の 2 つの異なるサブユニットとして機能します。リボフォリン I および II は真核細胞にのみ存在します。
リボホリンは、RER のオリゴ糖転移酵素のサブユニットです。
どちらのタイプのリボホリンも、リボソームの粗面小胞体への結合、およびこの相互作用に依存する共翻訳プロセスにおいて重要な役割を果たします。粗面小胞体のリボホリンの含有量は、リボソーム単位の化学量論的数に等しい。したがって、これは、これらのタンパク質が細網内で非常に重要で、豊富に存在し、良好に保存されていることを示唆しています。その結果、これらのタンパク質をコードする遺伝子の欠陥は、先天性疾患や壊滅的な結果を引き起こす可能性がリボフォリン I および II は、それぞれ遺伝子RPN1およびRPN2によってコードされます。
リボホリンは、Triton X-100 などの非イオン性洗剤に可溶です。
コンテンツ
1 構造
1.1 リボフォリンI 1.2 リボホリン II
2 位置
3 関数
4 リボホリンの合成
5 こちらも参照
6 参考文献
7 参考文献
構造
リボホリンには、リボホリン I とリボホリン II の 2 種類がそのため、両方のリボホリンがいくつかの共通の特性を持っているにもかかわらず、それぞれに独自の特性がこのように、リボホリン I はリボホリン II とは異なる構造を持っています。
リボフォリンI
オリゴ糖転移酵素 (OST) のこのサブユニットは、約 607アミノ酸に相当する 1821 対の塩基によって形成されます。その分子量は68550，8ダルトンです。
膜に固定されると、そのアミノ酸の 75% は小胞体の内腔またはその中に存在します。そのシグナル配列はタンパク質が成熟すると除去され、23 個のアミノ酸で形成されており、非常に珍しい負電荷を持っています。成熟タンパク質の残りのアミノ酸 (584 AA) は次のように分布しています。AA 1 から 415 までは小胞体の内腔に位置し、416 から 434 は細胞小器官の膜に固定されています。他のものは細胞質内に
リボホリン II
OST のもう 1 つのサブユニットは、632 アミノ酸に相当する 1896 対の塩基によって形成されます。その分子量は約 69283’4 ダルトンです。リボホリン II では、アミノ酸の 90% が小胞体の膜または内腔に位置しています。リボホリン I と同様にシグナル配列を示しますが、これも 22 個の AA で形成されており、負の電荷を持っています。
残りの分布は次のとおりです。AA 1 ～ 516 は内腔にあり、517 ～ 539 は膜（足場として）にあり、最後の 70 は細胞質にこの場合、グリコシル化されたアスパラギンは番号 84 AA です。リボフォリン II は、多種多様なプロテアーゼに対して完全に耐性が
位置
リボホリンは哺乳類の細胞内でのみ見つかり、粗面小胞体の膜に位置しています。これらは、ER へのタンパク質の移行中にリボソームと相互作用します。
リボホリン I と II はどちらも、大部分のポリペプチド鎖が ER 内腔に向けられた I 型膜トポロジーを持ち、哺乳動物のタンパク質複合体 OST の一部です。この複合体は、新たに合成されるポリペプチドの翻訳と同時に起こるN-グリコシル化に影響を及ぼし、リボホリン（IおよびII）、OST48、およびDad1である4つのRER特異的膜タンパク質によって構成されます。OST複合体を形成するには、タンパク質間に特異的な相互作用が必要です。そのため、リボフォリン I および II のルーメン ドメインは、OST48 のルーメン ドメインと相互作用します。それにもかかわらず、両方のリボホリン間には直接的な相互作用はありません。
リボホリンは膜貫通タンパク質であるため、ER 膜を通過し、そのためタンパク質は細胞質ドメイン、膜貫通ドメイン、および内腔ドメインを持ちます。リボフォリン II の場合、膜貫通ドメインと細胞質ドメインが小胞体上で保持機能を持っています。しかしその一方で、内腔ドメインはリボフォリンIの保持機能を持つドメインです。
リボホリン I は、アミノ酸 416 から 434 までの単一の配列で ER 膜に存在し、150 アミノ酸の細胞質 C 末端と 415 残基からなる管腔 N 末端ドメインを持っています。リボフォチン II は小胞体膜に同様の方法で配置されますが、膜貫通ドメインは残基 517 ～ 539 に位置し、アスパラギン残基 544 および 547 は細胞質に配置され、オリゴ糖付加の推定部位としては Asn84 のみが残されます。細胞質ドメインは最大 70 残基の長さになります。
リボホリンは、ER 膜に優先的に局在化するシグナル配列を持っています。
関数
粗面小胞体の膜貫通型糖タンパク質であるリボホリン I および II は、リボソームの RE 膜への結合に介入し (リボソームの大きなサブユニットである 60S を固定します)、翻訳と同時に移動する際に重要な役割を果たします。新生ポリペプチドの膜への挿入または槽の内腔への移動など、この結合に依存するプロセス。これは、ポリリボソームによって生成されるタンパク質の転座です。
リボフォリン I は通常、間違ったフォールディングを持つタンパク質と相互作用します。そうしないと、このタンパク質はネイティブ状態のタンパク質と相互作用しません。このことは、リボホリン I が間違ったフォールディングを持つタンパク質を認識するシャペロンとして機能している可能性を示唆しています。さらに、このリボホリンは、基質を捕捉して触媒中心に運ぶことによって、オリゴ糖転移酵素（タンパク質のN-グリコシル化の主要な酵素）への前駆体タンパク質の送達を調節できます。そのため、リボホリン I は、これらの考えられる基質を酵素の触媒サブユニットの近くに保つことができます。このようにして、ER での生合成中の N-グリコシル化反応の効率が向上します。しかし、リボホリン I は、明らかに他の基質と同じプロセスで不要であるため、決定された基質の N-グリコシル化を劇的に変化させるだけです。リボホリンが必須ではない場合、これらの前駆体はオリゴ糖転移酵素の触媒中心へのショートカットを持っているか、その存在は複合体中の残りの非触媒サブユニットに依存しています。これは、決定された基質に対するリボフォリン I の特異性を示しています。そのため、このタンパク質はオリゴ糖転移酵素複合体の触媒中心への基質の送達を選択的に制御します。
リボホリン II はまだまったく知られていないタンパク質ですが、このリボホリンは、高マンノースオリゴ糖を、新生ポリペプチド鎖の Asn-X-Ser/Thr コンセンサス モチーフに見られるアスパラギン残基に結合する N-オリゴ糖転移酵素複合体の一部であることが発見されました。さらに、このタンパク質は他のタンパク質の保持シグナルの同定にも関与します。
リボフォリン II については、複合体のこのサブユニットがリボフォリン I ほど研究されていないため、あまり情報がありません。
リボホリンの合成
リボホリンのタンパク質合成は細胞質で行われます。リボホリン I は RPN1 遺伝子によってコードされ、リボホリン II は RPN2 遺伝子によってコードされます。さらに、各遺伝子はリボフォリンの細胞局在を示すシグナル配列をコードしています。ヒトでは、この配列はリボフォリン I の 23 個のアミノ酸によって形成されます。リボホリン II には 22 個のアミノ酸が含まれます。
遺伝子は染色体内の特定の遺伝子座にヒトでは、RPN1 は 3q21.3 (染色体 3 内) に位置し、RPN2 は遺伝子座 20q12-q13.1 (染色体 20 内) にリボホリン I と II は合計で、それぞれ 607 個と 632 個のアミノ酸で構成されています。
こちらも参照
小胞体
参考文献
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