Ribosomal_S15_leader
S15リボソームタンパク質リーダーは、リボソーム生合成において重要な調節機能を果たします。これらは、リボソームタンパク質S15の濃度を制御するための自己調節機構として使用されました。この構造は、リボソームタンパク質S15 (rpsO)をコードするmRNAの 5′ 非翻訳領域に位置しています。S15 リボソームタンパク質リーダーの複数の異なる構造タイプがさまざまな生物で知られています。
リボソームS15リーダー
S15 の
二次構造と配列保存の 予測
識別子
シンボル S15 ラファム RF00114 その他のデータ
RNAの種類
シス登録; リーダー
ドメイン
細菌
それで SO:0005836 PDB構造 PDBe 大腸菌リボソーム S15 リーダーは、リボソーム S15 タンパク質に見られる2 つの 代替構造を形成できるRNA エレメントです。2 つの交互構造のうち 1 つは一連の 3 つのヘアピンで、もう 1 つは擬似結び目を含みます。 この構造は S15タンパク質の翻訳制御を引き起こします。他の種では最後の 2 つのヘアピンのみが保存されています。
細菌の別の例は、フラボバクテリウムで予測されました。彼の推定上のリボソームリーダーの二次構造は、ほとんどの種でヘアピンで構成されています。ただし、種によってはこのヘアピンが欠けているものもこのような明らかな二次構造の欠如はリボソーム リーダーとしては異例であるため、この候補リボソーム リーダーの予測はあまり確実ではありません。
古細菌における 2 つの例(塩酸菌で 1 つとメタノ微生物で 1 つ) が予測されました。この構造では、S15リボソームタンパク質のrRNA結合部位と S15リボソームタンパク質リーダー結合部位の間の類似性が検出されました。これは、これらの生物のリボソーム リーダーが rRNA の S15 結合部位を模倣することによって機能していることを示唆しています。
古細菌
の S15 リボソームタンパク質リーダーの二次構造と配列の保存を予測。この写真は以前の出版物から改変されたものです。
こちらも参照
リボソームタンパク質のリーダー
参考文献
^ マイヤー MM 。「遺伝子発現のRNA制御におけるrRNA模倣」。微生物スペクトル。6 (2)。土井: 10.1128/microbiolspec.RWR-0006-2017。PMID 29546840。
^ ベナール L、フィリップ C、エールズマン B、エールズマン C、ポルティエ C (1996)。「S15 リボソームタンパク質の発現におけるシュードノットと翻訳制御」。ビオキミー。78 (7): 568–576。土井：10.1016/S0300-9084(96)80003-4。PMC 7131963。PMID 8955900。 ^ エッケルト、I; ワインバーグ、Z （2020 年 5 月 24 日) 「細菌および古細菌における20の新規リボソームリーダー候補の発見」。BMC 微生物学。20 (130): 130.土井: 10.1186/s12866-020-01823-6。PMC 7247131。PMID 32448158。
外部リンク
Rfamのリボソーム S15 リーダーのページ
この分子生物学または細胞生物学の記事は書きかけです。 · “