リボスイッチ s0670

Riboswitch_s0670

Riboswitch_s0670は、クロストリディオイデス ディフィシル630の RNA ディープ シーケンシングによって同定されたSAMリボスイッチであると考えられます。 SAM-I-IV バリアント ファミリーのメンバーとの緊密な一致が見つかりましたが、s0670 およびこのアラインメント内のいくつかの配列はどの Rfam ファミリーにも一致しません。下流遺伝子は、S-アデノシルメチオニン シンテターゼ (最も頻繁)、S-リボシルホモシステイン リアーゼ、O-アセチルホモセリン (チオール) リアーゼ、O-アセチルホモセリン スルフヒドリラーゼ、ホモセリン デヒドロゲナーゼのいずれかです。
リボスイッチ_s0670
riboswitch_s0670 の
二次構造と配列保存の 予測
識別子
シンボル
リボスイッチ_s0670
ラファム XXXX その他のデータ
RNAの種類
シス登録; リボスイッチ;
ドメイン
細菌
PDB構造
PDBe

参考文献
^ ソウトゥリーナ OA、モノット M、ブードリー P、ソージェット L、ピション C、シスメイロ O; 他。（2013年）。「ヒト病原体クロストリジウム・ディフィシルにおける調節RNAのゲノムワイドな同定」。PLOS ジュネット。9 (5): e1003493。土井：10.1371/journal.pgen.1003493。PMC  3649979。PMID  23675309。

外部リンク
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