RmYN02
RmYN02はコウモリ由来の重症急性呼吸器症候群関連コロナウイルス株です。これは、2019年5月から10月の間に中国雲南省孟拉県の現場で収集されたコウモリの糞の中から発見された。これは、 COVID-19を引き起こすウイルス株であるSARS-CoV-2に 2 番目に近い既知の親戚であり、完全なウイルス ゲノムのスケールで 93.3% のヌクレオチド同一性を共有します。RmYN02には、SARS-CoV-2 と同様に、スパイクタンパク質の S1/S2 切断部位に挿入が含まれており、このような挿入事象が自然に発生する可能性があることが示唆されています。 RmYN02 ウイルスの分類(ランクなし):
ウイルス
レルム:
リボビリア
王国： Orthornavirae 門:
ピスビリコタ
クラス：
ピソニビリテテス
注文：
ニドビラレス
家族：
コロナウイルス科
属:
ベータコロナウイルス
亜属：
サルベコウイルス
種：
重症急性呼吸器症候群関連のコロナウイルス
歪み：
RmYN02
コンテンツ
1 遺伝学
2 発見
3 こちらも参照
4 参考文献
遺伝学
SARS-CoV-2 と 93.3% のゲノムを共有します。RmYN02 は 1ab において SARS-CoV-2 と 97.2% 同一でした。RmYN02 は、S 遺伝子の SARS-CoV-2 とヌクレオチドで 71.8%、アミノ酸で 97.4% 同一でしたが、RaTG13 と SARS-CoV-2 の間ではアミノ酸の同一性が 97.4% でした。すべての遺伝データは、Weifeng Shi氏と彼のチームによって発見されました。
発見
RmYN02は、2019年5月から7月にかけて雲南省で西双版納熱帯植物園のアリス・C・ヒューズ教授によって収集され、山東医科大学のウェイフェン・シー氏によって配列決定された。中国雲南省孟拉県、西双版納熱帯植物園から近い距離にゲノム自体は 11 個のサンプルのプールから組み立てられました。
SARS-CoV-2 および関連コロナウイルスの全ゲノム配列に基づく系統樹は次のとおりです:
SARS‑CoV‑2関連のコロナウイルス(コウモリ) Rc-o319、SARS-CoV-2 に対して 81%、Rhinolophus cornutus、岩手、日本
バットSL-ZXC21、SARS-CoV-2、Rhinolophus pusillus、舟山、浙江省に対して 88%
コウモリSL-ZC45、SARS-CoV-2、Rhinolophus pusillusに対して 88% 、浙江省舟山市
センザンコウSARSr-CoV-GX、SARS-CoV-2 に対して 85.3%、ジャバニカ、東南アジアから密輸
センザンコウ SARSr-CoV-GD、SARS-CoV-2 に対して 90.1%、ジャバニカ、東南アジアから密輸
コウモリ RshSTT182、SARS-CoV-2 に対して 92.6%、Rhinolophus shameli、Steung Treng、カンボジア
Bat RshSTT200、SARS-CoV-2 に対して 92.6%、Rhinolophus シャメリ、ストゥン・トレン、カンボジア(Bat) RacCS203、SARS-CoV-2、Rhinolophus acuminatus、チャチューンサオ、タイに対して 91.5% (コウモリ) RmYN02、SARS-CoV-2 に対して 93.3%、Rhinolophus malayanus、Mengla、雲南省(コウモリ) RpYN06 、SARS-CoV-2、 Rhinolophus pusillus、西双版納、雲南省に対して 94.4% (Bat) RaTG13、SARS-CoV-2 に対して 96.1%、Rhinolophus affinis、莫江、雲南(コウモリ) BANAL-52、SARS-CoV-2 に対して 96.8%、Rhinolophus malayanus、ビエンチャン、ラオス
SARS-CoV-2
SARS-CoV-1、SARS-CoV-2 に対して 79%
こちらも参照
コウモリ SARS 様コロナウイルス RsSHC014
コウモリ SARS 様コロナウイルス WIV1
参考文献
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