rne-II RNAモチーフ

Rne-II_RNA_motif

「Rne-II RNA モチーフ」  –         
rne -II RNA モチーフは、バイオインフォマティクスを使用して同定された保存されたRNA構造です。ガンマプロテオバクテリアのグループであるシュードモナス科に分類される種でのみ検出されます。rne -II RNA は、リボヌクレアーゼ E (RNase E)をコードする遺伝子の推定5′ 非翻訳領域(5′ UTR)に一貫して位置しています。RNase E 5′ UTR エレメントは、 RNase E 遺伝子の 5′ UTR にも見られる、以前に同定された RNA 構造です。ただし、後者のモチーフは、 腸内細菌、および 2 つのモチーフは明らかに無関係な構造を持っています。それらの違いを考慮して、rne -II RNA はRNase E の基質として作用することでRNase Eタンパク質のレベルを調節するという、RNase E 5′ UTR エレメントと同じ機能的役割を果たすという仮説が立てられました。 RNase E の量が多いと、自身のメッセンジャー RNAを分解します。
rne-II RNA
rne -II RNA
のコンセンサス二次構造
識別子
シンボル
rne-II RNA
ラファム RF01756 その他のデータ
RNAの種類
シス調節要素
ドメイン
シュードモナス科
PDB構造
PDBe

参考文献
^ ワインバーグ Z、ワン JX、ボーグ J、他。。「比較ゲノミクスにより、細菌、古細菌、およびそれらのメタゲノムからの 104 個の構造化 RNA の候補が明らかになりました。 」ゲノムバイオル。11 (3)：R31。土井：10.1186/gb-2010-11-3-r31。PMC  2864571。PMID  20230605。

外部リンク
Rfamのrne-II RNA のページ

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