S-ribosylhomocysteine_lyase
酵素学、S-ribosylhomocysteineリアーゼ(EC 4.4.1.21が)である酵素触媒化学反応を
S-リボシルホモシステインリアーゼ
識別子
EC番号
4.4.1.21
CAS番号
37288-63-4
データベース IntEnz IntEnzビュー
ブレンダ
BRENDAエントリー ExPASy NiceZymeビュー KEGG KEGGエントリー MetaCyc 代謝経路
プリアモス
プロフィール
PDB構造
RCSB PDB PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー
AmiGO / QuickGO索 PMC
記事 PubMed 記事 NCBI タンパク質
S-リボシルホモシステイナーゼ(LuxS)
インフルエンザ菌由来のオートインデューサー2産生タンパク質(ルクス)の結晶構造
識別子
シンボルuxS Pfam F02664
Pfam氏族L0094 InterPro PR003815 SCOP2
1inn / SCOPe / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造:
Pfam
構造/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
S-(5-デオキシ-D-リボス-5-イル)-L-ホモシステイン ⇌ { rightleftharpoons}
L-ホモシステイン+(4S)-4,5-ジヒドロキシペンタン-2,3-ジオン 積 S -adenosyl -Lメチオニンメチオニン(AdoMet)依存性メチル、
S-アデノシル- L-ホモシステインは、最初に加水分解される
S -ribosyl-L-ホモシステインおよびアデニン。
したがって、この酵素は、1つの基質であるS-(5-デオキシ-D-リボス-5-イル)-L-ホモシステインと、2つの生成物であるL-ホモシステインと(4S)-4,5-ジヒドロキシペンタン-2,3-を持っています。 dione。(DPD)はautoinducer-2の前駆体です。
コンテンツ
1 命名法
2 構造と機能
3 臨床的な意義
4 参考文献
5 参考文献
命名法
この酵素はリアーゼのファミリー、特に炭素-硫黄リアーゼのクラスに属しています。この酵素クラスの体系的な名前は、S-(5-デオキシ-D-リボス-5-イル)-L-ホモシステインL-ホモシステインリアーゼ[(4S)-4,5-ジヒドロキシペンタン-2,3-ジオン形成]。一般的に使用されている他の名前には、S-リボシルホモシステイナーゼ、およびLuxSが含まれます。この酵素はメチオニン代謝に関与しています。
構造と機能
LuxSは、ペプチダーゼおよびアミダーゼに見られるものと同様の2つの同一の四面体金属結合部位を含むホモ二量体の鉄依存性金属酵素です。さらに、LuxSは、細菌種の約半分でクオラムセンシングを仲介するオートインデューサーAI-2(オートインデューサー-2)の合成に関与しています。ホウ酸フラノシルジエステルであるAI-2は、細菌によって生成される小さなシグナル伝達分子です。LuxSはS-リボシルホモシステインをホモシステインと4,5-ジヒドロキシ-2,3-ペンタンジオン(DPD)に変換します。その後、DPDは自発的に循環してアクティブなAI-2になります。 AI-2は、毒素産生、バイオフィルム形成、胞子形成、病原性遺伝子発現などの多様な機能を持つニッチ特異的遺伝子をさまざまな形で調節することにより、種間コミュニケーションで作用すると考えられているシグナル伝達分子です。細菌、しばしば人口密度に応じて。AI-2形成経路は、S-アデノシル-L-ホモシステイン(AdoHcy)で始まり、S-アデノシル-L-ホモシステイン/ 5′-メチルチオアデノシンヌクレオシダーゼ(S-アデノシル-L-ホモシステイン/ 5′-メチルチオアデノシンヌクレオシダーゼ(SRH)によってS-リボシル-L-ホモシステイン(SRH)とアデニンに加水分解されます。 SAHNまたはMTAN、EC 3.2.2.9)(8-10)。LuxSはS-リボシル-ホモシステインを切断してL-ホモシステイン(Hcy)と4,5-ジヒドロキシ-2,3-ペンタンジオン(DPD)を形成し、これらは自発的に環化して活性AI-2になります(11-15)。 AI-2に関連する明確な行動は、主に既知のAI-2受容体遺伝子を持つ細菌に限定されていることがわかりました。したがって、一部の細菌がAI-2に応答できることは確かですが、シグナル伝達の目的で常に生成されているかどうかは疑わしいです。
臨床的な意義
LuxSは、肺炎球菌種の鉄摂取に影響を与え、バイオフィルム形成にも影響を与えます。 LuxS変異体D39luxSは、マウスの鼻腔内チャネルで行われた野生型研究と比較して毒性が低下しており、実験により、この変異体もバイオフィルム形成能力を大幅に低下させていることが示されています。
参考文献
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参考文献
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には、パブリックドメインのPfamおよび
InterProからのテキストが組み込まれています: PR003815
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