S-SodF_RNA
s-SodF RNAは、Streptomyces coelicolorで同定された非コードRNA(ncRNA)分子です。それは、その3’UTRからの約90ヌクレオチドの切断によってsodFmRNAから生成されます。しかし、それはの機能には影響しませんsodFのmRNAを、しかし、それは、mRNAと呼ばれる別に作用sodN。s-SodF RNAは、5 ‘末端からリボソーム結合部位までsodNmRNAに相補的な配列を持っています。それはsodNmRNAと対になり、その翻訳をブロックし、sodNmRNAの崩壊を促進します。において、ストレプトミセスsodFおよびsodN遺伝子は、それぞれFeおよびNiを含むFeSODおよびNiSODスーパーオキシドジスムターゼを生成します。それらの発現は、Nurと呼ばれるニッケル特有の毛皮ファミリー調節因子によって逆に調節されています。Niが存在する場合、NurはsodF転写を直接抑制し、間接的にsodNを誘導します。 SodF sRNA SodF低分子RNAの
予測される
二次構造と
配列保存
識別子Rfam F02790
その他のデータ
ドメイン
バクテリア
行く
GO:0017148、GO:0003729、GO:0043488
それで SO:0000370 PDB構造
PDBe
参考文献
^ Kim HM、Shin JH、Cho YB、Roe JH。「sodFmRNAの3’UTRから処理された低分子RNAを介したFurファミリーレギュレーターNurによるFeおよびNi含有SOD遺伝子の逆調節」。核酸研究。42(3):2003–2014。土井:10.1093 / nar / gkt1071。PMC 3919588。PMID 24234448。
^ Kim EJ、Chung HJ、Suh B、Hah YC、Roe JH(1998年4月)。「StreptomycescoelicolorMüllerにおける鉄および亜鉛含有スーパーオキシドジスムターゼをコードするsodF遺伝子の発現と調節」。Journal ofBacteriology。180(8):2014–2020。土井:10.1128 /JB.180.8.2014-2020.1998。PMC 107124。PMID 9555880。 ^ Kim EJ、Chung HJ、Suh B、Hah YC、Roe JH(1998年1月)。「StreptomycescoelicolorMüllerからのニッケル含有スーパーオキシドジスムターゼをコードするsodN遺伝子のニッケルによる転写および転写後調節」。分子微生物学。27(1):187–195。土井:10.1046 /j.1365-2958.1998.00674.x。PMID 9466266。S2CID 19859523。 ^ Ahn BE、Cha J、Lee EJ、Han AR、Thompson CJ、Roe JH。「Furファミリーのニッケル応答性調節因子であるNurは、Streptomycescoelicolorのスーパーオキシドジスムターゼとニッケル輸送を調節します」。分子微生物学。59(6):1848–1858。土井:10.1111 /j.1365-2958.2006.05065.x。PMID 16553888。S2CID 2728024。 ^ YJ、Ahn BE、Han AR、Kim HM、Chung KM、Shin JH、Cho YB、Roe JH、Cha SS。「金属センシングとDNA認識におけるニッケル特異的FurホモログであるNurの専門化の構造的基盤」。核酸研究。37(10):3442–3451。土井:10.1093 / nar / gkp198。PMC 2691836。PMID 19336416。 ^ Chung HJ、Choi JH、Kim EJ、Cho YH、Roe JH(1999年12月)。「StreptomycescoelicolorのNi応答性因子によるFe含有スーパーオキシドジスムターゼの遺伝子の負の調節」。Journal ofBacteriology。181(23):7381–7384。土井:10.1128 /JB.181.23.7381-7384.1999。PMC 103703。PMID 10572144。
この分子または細胞生物学
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