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sbcCRNAモチーフ

SbcC_RNA_motif

SBCC RNAモチーフが保存されているRNAのた構造バイオインフォマティクスによって発見されました。 SBCCのモチーフは、2018年のように、だけで検出されたメタゲノム配列、およびこれらのRNAは不明である含まれている生物のアイデンティティ。
sbcCモチーフRNAは、オペロンに組織化されているように見える遺伝子の上流に存在します。一般的に、これらのオペロンにはsbcC遺伝子が含まれており、その機能的役割はDNA修復に関連しています。sbcC遺伝子は、ATPaseとして機能するタンパク質をコードします。sbcCモチーフRNAの上流の位置は、シス調節エレメントとしての機能を示唆している可能性がただし、sbcCモチーフRNAは、実際には、共転写される可能性のある多くの遺伝子の真ん中に位置しています。そのような遺伝的配置はファージに典型的ですゲノム。したがって、どの遺伝子もファージと明確な関係を示していませんが、sbcCモチーフRNAがファージの一部として低分子RNAとして機能している可能性も

参考文献
^ Weinberg Z、LünseCE、Corbino KA、Ames TD、Nelson JW、Roth A、Perkins KR、Sherlock ME、Breaker RR。「遺伝子間領域の特定のサブセットの比較分析による224の候補構造化RNAの検出」。核酸解像度。45(18):10811–10823。土井:10.1093 / nar / gkx699。PMC  5737381。PMID  28977401。

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