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sbRNA

SbRNA

sbRNA(ステムバルジRNA)は、Caenorhabditiselegansで最初に発見された非コードRNAのファミリーです。これは、C。エレガンスのcDNAライブラリーの完全なトランスクリプトームスクリーニング中に同定されました。その後の実験では、sbRNAは、膨らみで中断された長いペアのステムを形成する5 ‘および3’の内部モチーフを保存していると特徴づけられました。 sbRNA 線虫sbRNAの保存された二次構造
識別子
シンボル sbRNA その他のデータ
RNAタイプ
遺伝子
ドメイン
カエノラブディティス
PDB構造DBe fam RF01619 RF01623 RF01643 RF01656 RF01663 コンテンツ
1 表現
2 YRNAの相同性
3 も参照してください
4 参考文献
5 参考文献

表現
sbRNAは、開発中にさまざまな発現パターンを示します。それらは、成虫、ダウアー幼虫、およびその後の熱ショックで最も高度に発現されます。系統的ノックアウト用いて分析RNAiは全く見られなかった表現型における2つsbRNAsのノックアウトのためのC.エレガンス、ただしのncRNAに対するRNAiの効率が疑問視されているが。 sbRNAは、剛性を維持するためにタンパク質繊維に免疫グロブリンを含んでいますが、リボソームの機能不全による感染のリスクが
sbRNAは、TATAボックスと近位配列要素(PSE Bボックス)で構成される共通のプロモーター要素を共有しますが、転写に必要なのはこれらの1つだけです。転写物はキャップがなく、ポリウリジル化されているため、RNAポリメラーゼIIIによって転写されると考えられています。

YRNAの相同性
アンsbRNA、CeN134は、脊椎動物に候補ホモログとして報告されたY RNA中王国・ワイド検索。さらなる調査により、保存されたらせん領域と共通のUUAUCループモチーフを持つ相同な二次構造が見つかりました。
したがって、sbRNAの機能は脊椎動物のY RNAの機能と類似している可能性がつまり、Ro- RNA粒子の一部として機能してRNAの品質を制御し、染色体複製に役割を果たします。 sbRNAの削除は、C。elegansの染色体複製を妨げませんが、これは、他のsbRNAが欠落している要素を置換した結果である可能性があります(ヒトY RNAの場合のように)。この理論は、RNAi研究がノックアウトされたsbRNAの表現型を検出できなかった理由も説明しています。

も参照してください
Y RNA

参考文献
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参考文献
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