Sib_RNA
Sib RNAは、関連する非コードRNAのグループを指します。それらは、大腸菌の遺伝子間領域で4つの反復要素として発見された後、元々QUADRNAと名付けられました。家族は、後兄妹（のための名前を変更されたSホルトI ntergenic A 、B、それが反復の数が他に可変であることが発見された場合undant配列）種および他に大腸菌株。ib RNA QUADの
予測される
二次構造と配列保存 識別子
シンボル
クワッド
代替。記号
Sib RNA、QUAD RNARfam F00113
その他のデータ
RNAタイプ
遺伝子; sRNA
ドメイン
バクテリア
それで SO：0000655 PDB構造 PDBe I型毒素-抗毒素系のIbs毒素
識別子
シンボルbs_toxin Pfam F13957
メンブラノーム 391 利用可能なタンパク質構造：
Pfam
構造/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
コンテンツ
1 身元
2 関数
3 も参照してください
4 参考文献
5 参考文献
6 外部リンク
身元
これらの小さなRNAは、ゲノム検索することによって計算同定された大腸菌のための遺伝子間の密接に関連する細菌のゲノムと高い配列同一性（配列保存）（いくつかの領域サルモネラ種およびクレブシエラ・ニューモニエ）。このデータは、マイクロアレイ発現分析および同定された潜在的な新規ncRNAと組み合わされました。目的の新規ncRNAの発現はノーザンブロッティングによって確認されました。
この大規模なスクリーニングでは、これらのncRNAは単に候補43、55、および61と呼ばれていました。これらの3つのncRNAは相同性が高く、ゲノムのリピート領域に由来します。ncRNAの各々はboxC、内50コピー以上における未知の機能の現在の反復エレメントへの短いストレッチ相同含有ゲノムの大腸菌。
関数
Sib RNAは、hok / sokおよびldr-rdl遺伝子と同様のI型毒素-抗毒素系における毒性タンパク質の発現を調節します。は、構成的に発現のSIB転写は調節IBS（I nductionのBの環S tasis）オープンリーディングフレーム酸アミノ小さな18-19をコードする疎水性発現の中程度のレベルで成長を遅くし、過剰発現された場合に毒性であるタンパク質を。IBSの遺伝子とは反対の鎖上でSIBので、完全に相補的であるアンチセンスを有するSIB RNAの結合性IBS mRNAをもたらすdsRNAが分解を媒介しました。
マルチコピープラスミドで同胞が削除された場合、抑制されていないibsタンパク質の毒性のために細胞を維持することができませんでした。IBSタンパク質の毒性メカニズムは完全には理解されていないが、タンパク質の過剰発現の際に膜電位の変化は、とその相互作用を示唆して膜タンパク質または膜挿入がもたらす細胞死。
も参照してください
中毒モジュール
TisB-IstR毒素-抗毒素システム
参考文献
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参考文献
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外部リンク
QUAD RNAのためのページでRFAM