T-A_hol_family
推定3-4 TMSトランスグリコ関連ホリン(TAホル)ファミリー(TC#1.E.43は)7つのホリンスーパーファミリーの一つに属していないホリンのグループであると考えられています。ホモログには、長さが80〜140アミノアシル残基(aas)で、3〜4回膜貫通セグメント(TMS)を示す数千の多様なファージおよび細菌タンパク質が含まれます。これらのタンパク質は、サイズとトポロジーがホリン様であり、NCBIタンパク質データベースでは「トランスグリコシラーゼ関連」、「推定ホリン」、「ファージ様膜貫通タンパク質」、「YeaQタンパク質」などと指定されています。 2016年の初めの時点で、それらは機能的に特徴付けられていないままです。それらは、両方を含む広範囲の細菌および古細菌の門に由来しますグラム陰性菌とグラム陽性菌。これらのタンパク質は、保存ドメインデータベースのRDDファミリー(TC#9.B.45)に関連しています。 TA Holファミリーに属するタンパク質の代表的なリストは、トランスポーター分類データベースに
も参照してください
ホリン
ライシン
トランスポーター分類データベース
参考文献
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参考文献
^ Reddy、Bhaskara L。; サイアージュニア、ミルトンH.(2013-11-01)。「細菌のホリンファミリーおよびスーパーファミリーのトポロジー的および系統発生的分析」。Biochimica et Biophysica Acta(BBA)-生体膜。1828(11):2654–2671。土井:10.1016 /j.bbamem.2013.07.004。PMC 3788059。PMID 23856191。 ^ “1.E.43推定3-4TMSトランスグリコシラーゼ関連ホリン(TA Hol)ファミリー”。TCDB 。
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