Type_IV_collagen_C4_domain
分子生物学では、IV型コラーゲンC4ドメイン（またはIV型コラーゲンNC1ドメイン）は、IV型コラーゲンのC末端に存在する複製ドメインです。各タイプIVコラーゲンには、25アミノ酸の短い7Sドメインと、N末端とC末端にそれぞれ約230アミノ酸の球状の非コラーゲンC4ドメインが隣接する長い三重らせんコラーゲンドメインが含まれています。プロトマーアセンブリでは、3つの鎖のC4ドメインが相互作用して、C4三量体を形成し、三重らせん形成のために鎖を選択して登録します。ネットワークアセンブリでは、2つのプロトマーのC4三量体が相互作用し、C4ヘキサマー構造を形成して、プロトマーを選択して接続します。 C4 1.9-ヒト胎盤コラーゲンivの非コラーゲン性（nc1）ドメインの結晶構造は、新しいタイプの共有結合による安定化を示します-lys架橋
識別子
シンボル4 Pfam F01413
Pfam氏族L0056 InterPro PR001442
頭いい4 PROSITE DOC00031 MEROPS 47 SCOP2 1hra / SCOPe / SUPFAM TCDB 2.A.16
利用可能なタンパク質構造：
Pfam
構造/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
コラーゲンIVのC4ドメインには12個のシステインが含まれており、それらはすべてジスルフィド結合に関与しています。それは主にベータストランドを持つ三次構造に折りたたまれます。コラーゲンIVC4ドメインは、C1-C6、C2-C5、およびC3-C4のペアを含む3つの鎖内ジスルフィド結合によって安定化された2つの同様に折りたたまれたサブドメインで構成されています。各サブドメインは、コンパクトなジスルフィド安定化三角形構造を表しており、そこから指のようなヘアピンループが、同じサブドメインまたは隣接するチェーンの隣接するサブドメインの不完全に形成された6本鎖ベータシートに突き出て、サブドメインをしっかりと固定します。
参考文献
^ Than ME、Henrich S、Huber R、Ries A、Mann K、Kuhn K、Timpl R、Bourenkov GP、Bartunik HD、Bode W。「ヒト胎盤コラーゲンIVの非コラーゲン（NC1）ドメインの1.9-A結晶構造は、新しいタイプの共有結合Met-Lys架橋を介して安定化を示します」。Proc。国立 Acad。科学 アメリカ。99（10）：6607–12。土井：10.1073 /pnas.062183499。PMC 124450。PMID 12011424。
^ Sundaramoorthy M、Meiyappan M、Todd P、Hudson BG。「NC1ドメインの結晶構造。基底膜におけるIV型コラーゲン集合の構造的基礎」。J.Biol。化学。277（34）：31142–53。土井：10.1074 /jbc.M201740200。PMID 11970952。 ^ Vanacore RM、Shanmugasundararaj S、Friedman DB、Bondar O、Hudson BG、Sundaramoorthy M。「コラーゲンIVのalpha1.alpha2ネットワーク。非共有力およびMet-Lys架橋の欠如による非コラーゲンドメイン-1の強化された安定化」。J.Biol。化学。279（43）：47723–30。土井：10.1074 /jbc.M406344200。PMID 15299013。
には、パブリックドメインのPfamと
InterProからのテキストが組み込まれています ： IPR001442