W-box
Wボックスがあるデオキシリボ核酸（DNA）シス調節エレメントのファミリーにより認識される配列、（T）TGAC（C / T）、WRKY転写因子。
植物種全体でのW-boxエレメントの機能と保存は、ゲルシフト実験、ランダム結合部位の選択、酵母ワンハイブリッドスクリーニング、および多くの異なるWRKYタンパク質で実行されるコトランスフェクションアッセイによって示されています。インシリコベースの研究と植物プロモーターの機能研究により、ストレス誘導性プロモーターのWボックスのクラスターが特定されました。WRKYタンパク質のWボックスへの結合は、発芽などの他の植物プロセスとともに、生物的および非生物的ストレス応答の両方の特徴です。複数のWボックスが転写に相乗効果をもたらすことも示されています。
ほとんどすべてのWRKY転写因子はWボックスに優先的に結合し、それらの発見以来、これはそれらがそれらの標的遺伝子のプロモーターに対してどのように特異性を示すかについての疑問を提起しました。 Ciolkowski etal。（2008）は、W-boxコアが必要であるが、隣接する配列も結合部位の優先度を決定する役割を果たしていることを示しました。最近の証拠は、TGACコアがより変性しており、グアニン アデニン シトシン（GAC）コアで構成されており、上流のチミンおよび下流のピリミジン隣接配列が特定のWRKY因子による認識を決定するのに役立つことを示唆しています。 WRKYタンパク質ドメインの塩基性残基も、シスエレメントのリン酸骨格を認識すると考えられています。
最近、山崎ら。NMRにより、WボックスDNAと複合体を形成したシロイヌナズナWRKY4のC末端WRKYドメインの溶液構造を決定しました。彼らは、4本鎖のβシートがβウェッジと呼ばれる構造でDNAの主溝に入り、シートがDNAのらせん状の軸にほぼ垂直であることを発見しました。保存されたWRKYGQKシグネチャーモチーフの予測されるアミノ酸は、WボックスDNAと接触します。
外部リンクと役立つリソース
WRKY転写因子ファミリーのシロイヌナズナ情報リソース
ラシュトンラボ
Somssichラボ
シェンラボ
SomssichのWRKY関連の出版物のリスト
オイルゲムラボ
参考文献
^ ラシュトン、ポール; マクドナルド、H。; ハットリー、AK; ラザロ、CM; Hooley、R（1995）。「DNA結合タンパク質の新しいファミリーのメンバーは、alpha-Amy2遺伝子のプロモーターの保存されたシスエレメントに結合します」。植物分子生物学。29：29：691〜702。土井：10.1007 / bf00041160。PMID 8541496。
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^ Ciolkowski、I。; ワンケD; Birkenbihl RP; SomssichIE。（2008）。「WRKY転写因子のDNA結合選択性に関する研究は、WRKYドメイン機能に構造的な手がかりを与えます」。Plant MolBiol。68：81–92。土井：10.1007 / s11103-008-9353-1。PMC 2493524。PMID 18523729。 ^ Bの ブランド。フィッシャー; ハーター; コールバッハー; ワンケ（2013）。「分子動力学およびinvitro結合アッセイによるWRKY転写因子の進化的に保存されたDNA結合特異性の解明」。核酸研究。41（21）：9764–9778。土井：10.1093 / nar / gkt732。PMC 3834811。PMID 23975197。 ^ 山崎健一; 木川T; 渡辺S; 井上M; 山崎T; 関M; 篠崎K; 横山聡（2012）。「シロイヌナズナWRKY転写因子による配列特異的DNA認識の構造的基盤」。J.Biol。化学。287：7683–91。土井：10.1074 /jbc.M111.279844。PMC 3293589。PMID 22219184。
も参照してください
Gボックス I-box Tボックス
Zボックス