W-test
統計、W-試験は単一SNP、SNP-SNPまたはSNP環境ペアとすることができるカテゴリ変数のセットのための症例と対照との間の分布差を試験するために設計されています。これは、変数セットの分割表から計算されたオッズ比の組み合わせ対数形式を取ります。この検定は、データのより小さなブートストラップされたサンプルから推定された、データセットの適応自由度fを持つカイ2乗分布を継承します。柔軟でデータが修正された確率分布により、Wテストは複雑な遺伝的構造の下で比較的正確なp値を与えることができます。
アプリケーション
理論的には、テストはペアワイズ相互作用に限定されず、データのサンプルサイズがそれをサポートできる場合は、より高次に進むことができます。ペアワイズ交互作用効果に対するWテストのアプリケーションは、5，000人未満の被験者を対象とした一般的なゲノムワイド関連解析（GWAS）データセットでテストされています。ブートストラップされたパラメーターを介してデータがまばらであるために確率分布のバイアスを補正するため、一塩基多型（SNP）のマイナーアレル頻度（MAF）が1％〜5％の場合、低頻度のバリアント環境で持続的なパワーが
ソフトウェア
W-test C ++ソフトウェア、Linuxバージョン、およびRパッケージは、wtestの公式Webサイトから入手できます。
参考文献
Maggie Haitian Wang、Rui Sun（共同筆頭著者）、Junfeng Guo、Haoyi Weng、Jack Lee、Inchi Hu、Pak Sham、Benny Chung-Ying Zee（2016）。ペアワイズエピスタシステストのための高速で強力なWテスト。核酸研究。doi：10.1093 / nar / gkw347
http://www2.ccrb.cuhk.edu.hk/statgene/
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この遺伝学
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