XCL1 – 日本語百科事典辞書

XCL1
ケモカイン（Cモチーフ）リガンド（XCL1）は、リンホタクチンとしても知られるCケモカインファミリーに属する小さなサイトカインです。ケモカインは、炎症反応および免疫反応における機能で知られています。このファミリーCケモカインは、ほとんどのケモカインとは構造と機能が異なります。このファミリーにはケモカインが2つしかないので、他のケモカインと区別されたのは、システインが2つしかないことです。1つのN末端システインと1つの下流のシステイン。これらは両方ともリンホタクチン、アルファおよびベータ形式と呼ばれ、2つの間にのみ見られる特別な特性を主張します。リンホタクチンは、その結合シフトを変化させる可逆的なコンフォメーション変化を経験する可能性が XCL1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
1J8I、1J9O、2HDM、2JP1、2NYZ、2N54
識別子
エイリアス
XCL1、ATAC、LPTN、LTN、SCM-1、SCM-1a、SCM1、SCM1A、SCYC1、XCモチーフケモカインリガンド1
外部ID
OMIM：600250 MGI：104593 HomoloGene：2250 GeneCards：XCL1
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 1番染色体（ヒト）
バンド 1q24.2 始める
168，576，605 bp
終わり
168，582，069 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 1番染色体（マウス）
バンド
1 H2.2 | 1 72.26 cM
始める
164，931，644 bp
終わり
164，935，527 bp
遺伝子オントロジー
分子機能
• ケモカイン受容体結合• サイトカイン活性• タンパク質ホモ二量体化活性• ケモカイン活性• CCRケモカイン受容体結合• GO：0001948タンパク質結合
細胞成分
• 細胞外領域• 細胞外空間
生物学的プロセス
• 形質転換成長因子ベータ刺激に対する細胞応答• インターロイキン-4に対する細胞応答• 隔離されたカルシウムイオンのサイトゾルへの放出• インターフェロンガンマ産生の負の調節• Tヘルパー1細胞サイトカイン産生の正の調節• 単球走化性• インターロイキン10産生• ナチュラルキラー細胞の正の調節走化性• ケモカイン媒介性シグナル伝達経路• CD4陽性、アルファ-ベータT細胞増殖の正の調節• 腫瘍壊死因子に対する細胞応答• 細胞-細胞シグナル• 胸腺細胞遊走の正の調節• ウイルスへの応答• T細胞を介した細胞毒性の正の調節• サイトゾルへの隔離されたカルシウムイオンの放出の正の調節• Tヘルパー1型免疫応答の負の調節• DNA結合転写因子活性の負の調節• 好中球走化性• 走化性• 白血球走化性の正の調節• GO：0032320、GO：0032321、GO：0 032855、GO：0043089、GO：GTPアーゼ活性の0032854正の調節• グランザイムA産生の正の調節• 粘膜組織における免疫グロブリン産生の正の調節• T細胞のサイトカイン産生の負の調節• T細胞のサイトカイン産生の正の調節• に対する細胞応答インターロイキン1 • T細胞走化性の正の調節は、• ナチュラルキラー細胞走化性成熟• 炎症性応答の調節• ERK1およびERK2カスケードの正の調節• 好中球走化性の正の調節• インターフェロンガンマに対する細胞応答を• 免疫応答を• Bの正の調節を細胞走化性• 成長因子ベータ産生形質転換の正の調節• CD4陽性の負の調節、アルファ-ベータT細胞増殖• Tヘルパー2細胞のサイトカイン産生の正の調節• 転写の負の調節、DNAテンプレート• CD8の正の調節を-陽性、アルファ-ベータT細胞増殖• インターロイキンの負の調節 ukin-2産生• Tヘルパー1細胞活性化の負の調節• グランザイムB産生の正の調節• シグナル伝達• 抗菌ペプチドによって媒介される抗菌性体液性免疫応答• シグナル伝達受容体活性の調節• Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路• 炎症反応• リンパ球の走化性
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみ Entrez6375 16963 Ensembl ENSG00000143184 ENSMUSG00000026573 UniProt P47992 P47993
RefSeq（mRNA）NM_002995 NM_008510
RefSeq（タンパク質）NP_002986 NP_032536
場所（UCSC）
Chr 1：168.58 – 168.58 Mb
Chr 1：164.93 – 164.94 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/

マウスの表示/
正常組織では、XCL1は脾臓、胸腺、小腸、末梢血の白血球に高レベルで見られ、肺、前立腺、卵巣には低レベルで見られます。XCL1の分泌は、末梢血リンパ球の細胞内カルシウムの増加に関与しています。 XCL1の細胞源には、活性化された胸腺および末梢血のCD8 + T細胞が含まれます。 NK細胞は、感染の初期に他のケモカインとともにXCL1も分泌します。 XCR1を発現する樹状細胞（DC）はXCL1の主要な標的です。
ヒトでは、XCL1はXCL2と呼ばれる別のケモカインと密接に関連しており、その遺伝子は1番染色体上の同じ遺伝子座にこれらのケモカインは両方とも、多くの遺伝的および機能的類似性を共有しています。ただし、XCL2はヒトでのみ観察され、マウスでは観察されないことが知られています。 XCL1は、XCR1と呼ばれるケモカイン受容体に結合することによって走化性機能を誘導します。 XCL1は、マクロファージ、線維芽細胞、および特定のリンパ球で発現します。
LTNは、10°CのモノマーLTN10と40°CのダイマーLTN40の2つの状態で検出されます。

コンテンツ
1 ゲノミクス
2 構造
3 生物学的意義
4 参考文献

ゲノミクス
XCL1の遺伝子は、情報ボックスに見られるように、細胞遺伝学的バンドq24.2にある1番染色体の長腕に見られます。コード化遺伝子は、タンパク質XCL1をコード化する6，017個のDNA塩基で構成されています。この遺伝子には、3つのエクソンと2つのイントロン、およびいくつかの転写開始部位が含まれています。この遺伝子は、XCL1と呼ばれる114アミノ酸のタンパク質をコードします。これは、第1および第3のシステイン特性を欠いていることを除いて、他のケモカインと類似しています。これは、XCL1が他のケモカインのように2つまたは3つではなく、ジスルフィド結合を作成する1つのシステインのみを含むことを意味します。
XCL1とXCL2の遺伝的差異は非常に小さいです。両方のタンパク質は、1つのジスルフィド結合を含むCモチーフ構造を含む同じファミリーに由来し、ほぼ同一の三次構造を持っています。これらのCケモカインも同じ隣接領域を持っています。これは、RNA転写遺伝子に寄与しないプロモーターおよびタンパク質結合の他の場所を含む遺伝子の領域を意味します。このケモカインファミリーの遺伝子マッピングは、イントロンとエクソンの位置に類似性を示していますが、明確な違いは1つだけです。XCL1は、L7aと呼ばれる大きなリボソームサブユニットをコードする最初のイントロンに1つだけ違いがXCL2では、L7aの領域エンコーディングがカットオフされています。 2つの成熟タンパク質間の他の唯一の遺伝的差異は、7位と8位のアミノ酸の違いです。このアミノ酸の違いは、いくつかの生物学的差異を説明している可能性がこれら2つのケモカインを比較する際のいくつかの問題は、XCL2がマウスで観察されたことがないことです。

構造
XCL1を他のサイトカインと区別する1つの点は、その構造です。ほとんどのケモカインには、N末端を構造のコアに接続する2つのジスルフィド結合がありますが、XCL1には1つしかありません。ジスルフィド結合のこの単純な違いにより、XCL1の全体的な三次構造が他のケモカインから変化します。リンホタクチンタンパク質には、構造Ltn10とLtn40の2つの部分があり、互いに折りたたまれて生物学的に活性になります。このコンフォメーション変化は、ケモカインの結合構造を変化させます。インターフォールディングのこの理解は、リンホタクチン動態を理解するためのより多くの基礎を提供します。

生物学的意義
XCL1とXCR1のペアは、交差提示、抗原の取り込み、および先天性および適応性の細胞毒性免疫の誘導に関与することが知られています。 XCL1の受容体であるXCR1は、コンベンショナル樹状細胞でのみ発現します。 XCL1は、IFN-γを含む他のケモカインとともに、NK細胞および抗原特異的CD8 + T細胞によって分泌されます。このプロセスは、樹状細胞による抗原の交差提示を促進する可能性が
XCL1は、関節リウマチの影響を受ける関節にT細胞を産生することも知られています。それらはRA滑膜リンパ球にも発現しています。

参考文献
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