Y-STR
「Y-STR」
16 Y-STRの2008年現在のSTRレート範囲
STRサイト
突然変異率（x 10 -3）
LB-96％CI
‘割合’
UB-96％CI
ノート DYS19 1.5 2.4 3.5 9658の23 DYS385 1.4 2.1 3.0 3.0
1 4896年の31DYS389I 0.95 1.8
3.0 3.0 7862の14 DYS389II 1.8 2.8 4.2 7849の22 DYS3901.4 2.3 3.5 9140の21 DYS391 2.0
3.0 3.0 4.5 9089の28 DYS392 0.18 0.55 1.3 9053の5
DYS393 0.36 0.89 1.8 7842の7 DYS437 0.60 1.5
3.1 4672の7 DYS438 0.051 0.43 1.5 4709の2 DYS439
3.8 5.7 8.4 4686の27 DYS448 0.19 1.6 5.7
1258年の2DYS456 1.8 4.8 10
1258年の6DYS458 2.8 6.4 12
1258年の8DYS635 1.6 3.8 7.4 2131の8
GATA H4.10.71 2.2 5.1 2294の5
表1から。Sanchez-Dizetal 。2008. 17STRのNの一部は頻度が非常に低いことに注意してください
A Y-STRは、ある短いタンデム反復で（STR）Y染色体。Y-STRは、法医学、父性、および系図DNA検査でよく使用されます。Y-STRは、特に男性のY染色体から取得されます。これらのY-STRは、常染色体STRよりも弱い分析を提供します。これは、Y染色体が男性にのみ見られ、父親からのみ受け継がれ、父親の系統のY染色体が実質的に同一になるためです。これにより、Y-STRサンプル間の区別が大幅に少なくなります。常染色体STRは、接合子の作成プロセス中に染色体のペア間でランダムに一致するため、はるかに強力な分析力を提供します。
コンテンツ
1 命名法
1.1 DYS
2 Y-STR分析
3 STRとフォレンジック
4 データベース
5 も参照してください
6 参考文献
7 外部リンク
7.1 ダイアグラム 7.2 概況報告書 7.3 データベース 7.4 チュートリアル
命名法
Y-STRには、HUGO遺伝子命名委員会（HGNC）によって名前が割り当てられます。
一部のテスト会社では、STRマーカーの記述方法に異なる形式がたとえば、マーカーDYS455は、DYS455、DYS 455、DYS＃455、またはDYS＃455と書くことができます。HUGOおよびNISTによって受け入れられている科学標準はDYS455です。
DYS
DYSは、人間の常染色体STRテストで使用される専門用語のバリエーションであり、2番目の文字は通常染色体番号用に予約されています（例：D8S1179）。
D = DNA Y = Y染色体S =（固有の）セグメント
Y-STR分析
DNAには、個人に応じて可変回数繰り返される塩基の短い繰り返し配列（TATTなど）の複数のコピーで構成される領域が「可変数の短いタンデムリピート」と呼ばれるこれらの領域は、STR分析を実行するときに見られるものです。2人が同じ数の反復配列を持つ可能性は非常に低く、分析する領域が多いほどさらに小さくなります。これは、短いタンデムリピート分析の基礎を構成します。ただし、このプロセスの基礎は、ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）です。これにより、法医学者はSTR領域の何百万ものコピーを作成できます。次に、ゲル電気泳動により、「各繰り返し単位がフラグメントに現れる回数が得られます」。これにより、DNAを簡単に比較できます。
STRとフォレンジック
米国では、13の異なる常染色体STR遺伝子座が法医学目的の分析の基礎として使用されています。犯罪現場のDNAが十分で、13の常染色体遺伝子座すべてにアクセスできる場合、2人の無関係な人が同じサンプルに一致する可能性は約10億分の1です。
Y-STR分析のプロファイル確率推定の基礎は、カウント方法です。信頼区間の適用は、データベースのサイズとサンプリングの変動を考慮に入れています。Yハプロタイプ頻度（p）は、p = x / N式を使用して計算されます。ここで、xは、N個のハプロタイプを含むデータベースでハプロタイプが観察された回数に等しくなります。たとえば、ハプロタイプがN = 2000のデータベースで2回観察された場合、そのハプロタイプの頻度は2/2000 = 0.001になります。信頼区間なしでYハプロタイプ頻度を報告することは許容されますが、データベース内のYハプロタイプの観察に関する事実の記述のみを提供します。母集団におけるYハプロタイプの確率の信頼上限は、Clopper and Pearson（1934）によって記述された方法を使用して計算する必要がこれは、Yハプロタイプに見られるゼロまたは他の小さな数を含む、カウントの確率の二項分布を使用します。
データベース
フォレンジックデータベース（個人情報なし、頻度の目的で）：
USY-STRデータベース
Y染色体ハプロタイプ参照データベース
では遺伝子系図、Ysearchは公に提出姓とY-STRの含む最後のスポンサーデータベースにするために使用ハプロタイプを一日での実装前の、2018年5月24日にその運用停止までの一般的なデータ保護規則で、欧州連合（EU）を延長し、以下、その作成者であるFamilyTreeDNAからのサポートが不足している期間。データベースは2003年に設立され、シャットダウン前に219千件のレコード（うち15万2千件の固有のハプロタイプ）に達しました。他の同様のデータベースは以前に姿を消していました。
ハプログループ（Y-SNP）固有のデータ：
ハプロゾン：E-M35系統発生プロジェクト（以前のE3bプロジェクト）
も参照してください
Y-STRマーカーのリスト
タンデムリピート
系統DNA検査
参考文献
^ 「STR分析」 ^ http://www.cstl.nist.gov/biotech/strbase/ystr_fact.htm ^ 「STR分析」 ^ 「ハイテク探偵の新種」 ^ 「STR分析」 ^ 「Y染色体STRタイピングのためのSWGDAM解釈ガイドライン」 ^ Clopper、C。およびPearson、E。二項式の場合に示されている信頼性または基準限界の使用、Biometrika（1934）26：404-413。
^ World Families Network、Ysearch、Mitosearchがほこりをかむ–GDPRに感謝します ^ Ysearch
外部リンク
ダイアグラム
米国国立標準技術研究所（NIST） —Y染色体に沿ったYSTRの位置
概況報告書
米国国立標準技術研究所（NIST） —Y染色体STR遺伝子座と利用可能なファクトシートの要約リスト
米国国立標準技術研究所（NIST） —STRファクトシート
dna.reinyday.com — DYS464
Y-STRマーカー—詳細と統計
データベース
yhrd.org – Y染色体ハプロタイプリファレンスデータベース
usystrdatabase.org — USY -STRデータベース— Applied BiosystemsYFilerデータベース
ysearch.org —Y-DNAデータベース
チュートリアル
Y-DNAショートタンデムリピート（STR）を理解する
Y-STRマーカータイプ
遺伝距離の計算
STRトレーニング資料