YKT6


YKT6
シナプトブレビンホモログYKT6は、ヒトではYKT6遺伝子によってコードされるタンパク質です。 YKT6 識別子
エイリアス
YKT6、YKT6v-SNAREホモログ
外部ID
OMIM:606209 MGI:1927550 HomoloGene:4778 GeneCards:YKT6
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 7番染色体(ヒト)
バンド 7p13 始める
44,200,959 bp
終わり
44,214,294 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 11番染色体(マウス)
バンド
11 | 11 A1
始める
5,955,693 bp
終わり
5,967,780 bp
RNA発現パターン
その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
• タンパク質-システインS-パルミトイルトランスフェラーゼ活性• トランスフェラーゼ活性• SNAP受容体活性• SNARE結合• カドヘリン結合• GO:0001948タンパク質結合
細胞成分
• 細胞質• 膜の不可欠な構成要素• エンドソーム• ゴルジ装置• 膜• ゴルジ膜• 原形質膜の不可欠な構成要素• 基底樹状突起• 輸送小胞• 神経細胞体• SNARE複合体• 小胞体• ミトコンドリア• 細胞質小胞膜• 小胞体-ゴルジ中間コンパートメント膜• GO:0016023細胞質小胞• 頂端樹状突起• サイトゾル
生物学的プロセス
• 小胞ターゲティング• エキソサイトーシスに関与する小胞ドッキング• ゴルジ小胞媒介輸送への小胞体• 逆行性輸送、ゴルジへのエンドソーム• タンパク質輸送• 小胞融合• 小胞媒介輸送• 膜融合
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez10652 56418 Ensembl ENSG00000106636 ENSMUSG00000002741 UniProt O15498 Q9CQW1 RefSeq(mRNA)NM_006555 NM_001363678 NM_019661
RefSeq(タンパク質)
NP_006546 NP_001350607 NP_006546.1 NP_062635 場所(UCSC)
Chr 7:44.2 – 44.21 Mb
Chr 11:5.96 – 5.97 Mb
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コンテンツ
1 関数
2 相互作用
3 参考文献
4 参考文献

関数
この遺伝子産物は、分泌区画間の小胞輸送に関与するSNARE認識分子の1つです。これは、小胞体-ゴルジ輸送段階で機能する、膜結合型のイソプレニル化タンパク質です。このタンパク質は酵母からヒトまで高度に保存されており、酵母分泌経路における酵母ホモログの喪失を機能的に補完することができます。

相互作用
YKT6は、することが示されている対話でBET1L。

参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000106636 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38:Ensemblリリース89:ENSMUSG00000002741 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Veit M。「ヒトSNAREタンパク質Ykt6は、C末端のシステイン残基でそれ自体のパルミトイル化を仲介します」。生化学ジャーナル。384(Pt 2):233–7。土井:10.1042 / BJ20041474。PMC 1134105。PMID 15479160。    ^ Rossi V、Banfield DK、Vacca M、Dietrich LE、Ungermann C、D’Esposito M、Galli T、Filippini F。「ロンジンとそのロンジンドメイン:規制されたSNAREと多機能SNAREレギュレーター」。生化学の動向。29(12):682–8。土井:10.1016 /j.tibs.2004.10.002。PMID 15544955。   ^ “Entrez Gene:YKT6 YKT6 v-SNAREホモログ(S. cerevisiae)”。
^ Shorter J、Beard MB、Seemann J、Dirac-Svejstrup AB、Warren G。「ゴルギンの連続的なテザリングおよび小胞テザリングタンパク質p115によるSNAREpinアセンブリの触媒作用」。細胞生物学ジャーナル。157(1):45–62。土井:10.1083 /jcb.200112127。PMC 2173270。PMID 11927603。    ^ Xu Y、Martin S、James DE、Hong W。「GS15はシンタキシン5、GS28、およびYkt6とSNARE複合体を形成し、ゴルジ装置の初期槽内のトラフィックに関係しています」(PDF)。細胞の分子生物学。13(10):3493–507。土井:10.1091 /mbc.E02-01-0004。PMC 129961。PMID 12388752。
  

参考文献
丸山K、菅野S(1994年1月)。「オリゴキャッピング:真核生物のmRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドに置き換える簡単な方法」。遺伝子。138(1–2):171–4。土井:10.1016 / 0378-1119(94)90802-8。PMID  8125298。
McNew JA、Sogaard M、Lampen NM、Machida S、Ye RR、Lacomis L、Tempst P、Rothman JE、SöllnerTH(1997年7月)。「Ykt6p、小胞体に不可欠なプレニル化SNARE-ゴルジ輸送」。Journal of BiologicalChemistry。272(28):17776–83。土井:10.1074 /jbc.272.28.17776。PMID  9211930。
鈴木恭子、吉友中川健一、丸山健一、須山晃、菅野智之(1997年10月)。「完全長濃縮および5 ‘末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」。遺伝子。200(1–2):149–56。土井:10.1016 / S0378-1119(97)00411-3。PMID  9373149。
Tochio H、Tsui MM、Banfield DK、Zhang M。「Ykt6pの構造によって明らかにされた非シンタキシンSNAREタンパク質の自己抑制メカニズム」。科学。293(5530):698–702。土井:10.1126 /science.1062950。PMID  11474112。S2CID  13618305。
Honer WG、Falkai P、Bayer TA、Xie J、Hu L、Li HY、Arango V、Mann JJ、Dwork AJ、Trimble WS。「重度の精神疾患における前頭前野のSNAREメカニズムタンパク質の異常」。大脳皮質。12(4):349–56。土井:10.1093 / cercor /12.4.349。PMID  11884350。
Shorter J、Beard MB、Seemann J、Dirac-Svejstrup AB、Warren G。「ゴルギンの連続的なテザリングおよび小胞テザリングタンパク質p115によるSNAREpinアセンブリの触媒作用」。細胞生物学ジャーナル。157(1):45–62。土井:10.1083 /jcb.200112127。PMC  2173270。PMID  11927603。
Xu Y、Martin S、James DE、Hong W。「GS15はシンタキシン5、GS28、およびYkt6とSNARE複合体を形成し、ゴルジ装置の初期槽内のトラフィックに関係しています」 (PDF)。細胞の分子生物学。13(10):3493–507。土井:10.1091 /mbc.E02-01-0004。PMC  129961。PMID  12388752。
Puri N、Kruhlak MJ、Whiteheart SW、Roche PA。「肥満細胞の脱顆粒には、N-エチルマレイミド感受性因子を介したSNARE分解が必要です」。Journal ofImmunology。171(10):5345–52。土井:10.4049 /jimmunol.171.10.5345。PMID  14607937。
Fukasawa M、Varlamov O、Eng WS、SöllnerTH、Rothman JE。「SNAREYkt6の局在と活性は、その調節ドメインとパルミトイル化によって決定されます」。アメリカ合衆国科学アカデミー紀要。101(14):4815–20。土井:10.1073 /pnas.0401183101。PMC  387331。PMID  15044687。
Tai G、Lu L、Wang TL、Tang BL、Goud B、Johannes L、Hong W。「初期/リサイクルエンドソームからトランスゴルジネットワークへの輸送におけるシンタキシン5 / Ykt6 / GS28 / GS15SNARE複合体の参加」。細胞の分子生物学。15(9):4011–22。土井:10.1091 /mbc.E03-12-0876。PMC  515336。PMID  15215310。
木村K、若松A、鈴木Y、太田T、西川T、山下R、山本J、関根M、鶴谷K、若栗H、石井S、杉山T、斉藤K、磯貝Y、入江R、櫛田N、米山T 、大塚R、神田K、横井T、近藤H、若栗M、村川K、石田S、石橋T、高橋藤井A、棚瀬T、永井K、菊池H、中井K、磯貝T、菅野S )。「転写調節の多様化:ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。ゲノム研究。16(1):55–65。土井:10.1101 /gr.4039406。PMC  1356129。PMID  16344560。
奥村AJ、初沢K、田村T、長谷H、佐伯K、奥村F、長尾K、西川M、芳村A、和田I。「細胞内膜系の品質管理における新しいQ-SNARE、D12の関与」。Journal of BiologicalChemistry。281(7):4495–506。土井:10.1074 /jbc.M509715200。PMID  16354670。
大江晃、加藤晃、野口晋。「ヒト乳癌のドセタキセルに対する耐性において、p53変異腫瘍でアップレギュレーションされたCCT5、RGS3、およびYKT6遺伝子の関与の可能性」。乳がんの研究と治療。101(3):305–15。土井:10.1007 / s10549-006-9293-x。PMID  16821082。S2CID  2398124。
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  人間の7番染色体上の遺伝子に関するこ