ZC3H12B – 日本語百科事典辞書

ZC3H12B
CXorf32またはMCPIP2としても知られるZC3H12Bは、ヒトの染色体Xq12にある遺伝子ZC3H12Bによってコードされるタンパク質です。 ZC3H12B 識別子
エイリアス
ZC3H12B、CXorf32、MCPIP2、12Bを含むジンクフィンガーCCCHタイプ
外部ID
OMIM：300889 MGI：2442133 HomoloGene：19395 GeneCards：ZC3H12B
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 X染色体（ヒト）
バンド
Xq11.2-q12
始める
65，366，638 bp
終わり
65，507，887 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 X染色体（マウス）
バンド
X | X C3
始める
95，711，678 bp
終わり
95，932，637 bp
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez340554 547176 Ensembl ENSG00000102053 ENSMUSG00000035045 UniProt Q5HYM0
該当なし
RefSeq（mRNA）NM_001010888 NM_001034907
RefSeq（タンパク質） NP_001010888 該当なし
場所（UCSC）
Chr X：65.37 – 65.51 Mb
Chr X：95.71 – 95.93 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/

マウスの表示/

コンテンツ
1 遺伝子
1.1 プロモーター 2 mRNA 3 タンパク質
3.1 構造的特徴 3.2 翻訳後修飾
4 進化
4.1 パラログ 4.2 オーソログ
5 表現と機能
6 交流
7 臨床的な意義
8 参考文献
9 参考文献

遺伝子
ZC3H12B遺伝子は、19，709塩基対（bp）で構成され、5つのエクソンを含みます。これは、プラス鎖のq12のX染色体上
ZC3H12B軌跡。
ZC3H12Bには、リボヌクレアーゼドメインとCCCHタイプのジンクフィンガードメインが含まれています。リボヌクレアーゼ（RNase）はRNAを分解し、RNA成熟プロセスに関与します。それらはウイルスRNAに対する防御線でもあります（D’Alessio and Riordan1997）。CCCHタイプのジンクフィンガーはmRNAの不安定化に関連しています。CCCHタイプのジンクフィンガーは、PolyAテールを除去せずにmRNAを裏返すことが示されています（Lai and Blackshear2001）。ZC3H12BとそのパラログZC3H12A、ZC3H12C、およびZC3H12Dはすべて、真核生物（InterPro）の細胞周期と成長相転移に関連するCCCHタイプのジンクフィンガードメインを含んでいます。

プロモーター
Genomatix ElDoradoプログラムは、活性化T細胞の核因子およびリボ核タンパク質関連ジンクフィンガータンパク質MOK-2（ZNF239としても知られる）を含む複数の転写因子結合部位を持つZC3H12B遺伝子の上流の601bpプロモーターを予測しました。

ZC3H12Bのプロモーターにおける転写因子結合部位の予測。

mRNA
ZC3H12Bには7273bpのmRNAが含まれています。Aceviewによって予測されるトランスクリプトは1つだけです。折り畳みパターンは予測されていません（Mfold）。ZC3H12Bから切り出されたイントロン用が

ZC3H12BのAceview単一予測mRNAバリアント。

タンパク質
ZC3H12Bは、CCCHタイプのジンクフィンガードメインとリボヌクレアーゼドメインを含む可能性のあるリボヌクレアーゼです。836アミノ酸のタンパク質の予測分子量は94.2kdalです。シグナルペプチドや膜貫通領域は含まれPSORTIIは、核の位置の確率が65.2％であると予測しました。CCCHタイプのジンクフィンガーとリボヌクレアーゼは、おそらくRNA切断、特にRNAヘアピン切断のために核内に位置しています（Boysen and Hearn2008）。

構造的特徴
タンパク質二次構造の混合物であるαヘリックスとβストランド。これまでに同定された2つのドメインは、リボヌクレアーゼとCCCHタイプのジンクフィンガードメインです。
以下に示すのは、ZC3H12Bパラログの保存ドメインであるMcpip1（またはZC3H12A）です。BLAST構造の比較では、82％の同一性一致と24％のクエリカバレッジがあり、予測されるe値は2e-118でした。82％の同一性の一致は、ZC3H12BとMcpip1（ZC3H12A）のジンクフィンガー保存ドメインを比較するのに十分です。これらは両方ともベータストランドとアルファヘリックスで構成されると予測されています。

ジンクフィンガーモチーフを持つMcpip1保存ドメインのCn3Dレンダリング。

翻訳後修飾
Phobiusプログラムは、非細胞質タンパク質の位置を予測しました。NetPhos2.0。ZC3H12Bの63のリン酸化部位を予測しました。これらは概念的な翻訳でマークされています。YinOYang1.2。リン酸化部位と競合している3つの0-ベータ-GlcNAc付着部位を予測しました。0-ベータ-GlcNAcは、おそらく細胞の核および/または細胞質で発生する唯一のタイプのグリコシル化です。リンパ球による抗原活性化と核タンパク質の動的0-B-グリコシル化の間には注目すべき関連性があります（HartおよびAkimoto）。NetNGlycはグリコシル化部位を予測しました。ただし、タンパク質は核である可能性が高く、この形態のグリコシル化を受けないため、これらの部位は除外されました。タンパク質のN末端に予測されるアセチル化部位はありませんでした。ヒトタンパク質の約85％が、タンパク質の合成、安定化、および局在化のためにN末端でアセチル化されているため、これは珍しいことです（Van Damm etal。）。正、負、または混合電荷クラスターは存在しません。疎水性セグメントは検出されませんでした（SAPS SDSC BiologyWorkbench）。MitoProtIIは、ミトコンドリアのエクスポート信号を検出しませんでした。これらの翻訳後テストは、タンパク質が核内に位置し、動的リン酸化と0-ベータ-GlcNAc修飾を受けることを示唆しています。

進化
ZC3H12Bの選択されたドメインは、ほとんどの脊椎動物、節足動物、環形動物で保存されています。ドメインバクテリアや古細菌には保存されたドメインはありません。酵母、植物、または原生生物には、有意に保存されたドメインはありませんでした。

パラログ
同じCCCHタイプのジンクフィンガーファミリーに属するZC3H12Bの3つのパラログがあり、すべてBLAST分析（NCBI）に基づいてZC3H12Bと50％を超える同一性を維持しています。名前種族
NCBIアクセッション番号
長さ（AA）
タンパク質の同一性 ZC3H12B ホモサピエンスNM_001010888.3 836aa 100％ ZC3H12A
ホモサピエンスNM_025079.2 599aa 68％ ZC3H12C
ホモサピエンスNM_033390.1 883aa 53％ ZC3H12D
ホモサピエンスNM_207360.2 527aa
61％

オーソログ
ZC3H12Bは、哺乳類、鳥、昆虫、線虫（BLAST）で保存されています。ヒトにおけるZC3H12Bのオルソログの要約については、以下の表を参照して
種族
種の一般名
発散（MYA）
NCBIアクセッション番号（タンパク質）
長さ（アミノ酸）
タンパク質の同一性
類似性
ホモサピエンス
人間
該当なしNP_001010888.3 836aa 100％ 100％
パンパニスカス
チンパンジー6.3 XP_003816967.1 836aa 99％ 99％
ポンゴアベリイ
オランウータン15.7 XP_002831786.1 836aa 99％ 99％
アカゲザル
アカゲザル29 XP_002806307.1 836aa 99％ 99％ Callithrix jacchus
マーモセット42.6 XP_002762992.2 836aa 98％ 98％
ハツカネズミ
ねずみ92.3 NP_001030079.2 835aa 91％ 94％
イノシシ豚 94.2 XP_003360389.1 836aa 93％ 96％
ヤケイ鶏 296 XP_003641177.1 837aa 77％ 85％
Chrysemys picta bellii
ニシキガメ296 XP_005279572.1 838aa 78％ 86％
メダカ
メダカ400.1 XP_004076599.1 845aa 67％ 77％ Gadus morhua
タイセイヨウダラ400.1 AFK76491.1 842aa 29％ 44％
ダニオ・レリオ
ゼブラフィッシュ400.1 XP_001342172.3 982aa 68％ 77％ Petromyzon marinus
ヤツメウナギ535.7 ABO21295.1 222aa 44％ 58％ Branchiostoma floridae
ナメクジウオ713.2 XP_002598834.1 492aa 66％ 79％
カタユウレイボヤ
カタユウレイボシ722.5 XP_002125834.1 863aa 54％ 66％ Strongylocentrotus purpuratus
紫ウニ742.9 XP_787030.3 974aa 58％ 72％ Aplysiomorpha californica
ウミウシ782.7 XP_005113312.1 1269aa 51％ 69％
ショウジョウバエgrimshawi
ハワイミバエ782.7 XP_001994140.1 548aa 51％ 69％
ガンビエハマダラカ蚊 782.7 XP_321880 637aa 59％ 75％
セイヨウミツバチミツバチ782.7 XP_397264 652aa 58％ 73％ Caenorhabditis elegans
ラウンドワーム（線虫）937.5 NP_491985.4 634aa 46％
64％

表現と機能
正常組織発現プロファイリングのマイクロアレイは、膵臓、前立腺、脳、脊髄、胸腺（GEO）での遺伝子発現の増加を示しました。そのパラログとは異なり、マクロファージ活性化組織では発現されません。これは、炎症反応とのパラロガスな関係を示しています（Liang et al.2008）。ZC3H12Bは、脳、胸腺、精巣組織（EST）で一過性に発現します。

交流
Ingenuity Systemsによる予測された相互作用は、経路内の薬物標的分子および既知の薬物標的を示さなかった。記載されている上位の機能と疾患は、癌、人体傷害と異常、生殖器系疾患でした。いくつかのmiRNA相互作用が予測されました。予測されたmiRNAターゲットはまだZC3H12B配列と一致しておらず、2つの間に相互作用があるかどうかは不明です。Forster Resonance Energy Transfer（FRET）、共免疫沈降、ツーハイブリッドスクリーニング、ハイドロパシー相補性、クラスターマイクロアレイ、ChiPなどのテストは、将来、ZC3H12Bとの新しいタンパク質/クロマチン相互作用をテストするために使用できます。

臨床的な意義
Xq12遺伝子座の欠失は、次のようないくつかの障害をもたらしたアンドロゲン不感性に、感受性前立腺癌、脊髄性筋萎縮症延髄ケネディとの精神遅滞; ただし、これらの疾患とZC3H12B（NCBI）の間に関連性は見つかりませんでした。

参考文献
^ GRCh38：Ensemblリリース89：ENSG00000102053 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38：Ensemblリリース89：ENSMUSG00000035045 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス：」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。

参考文献
Liang J、Wang J、Azfer A、Song W、Tromp G、Kolattukudy PE、Fu M。「新しいCCCH-ジンクフィンガータンパク質ファミリーは、マクロファージの炎症性活性化を調節します」。Journal of BiologicalChemistry。283（10）：6337–46。土井：10.1074 /jbc.m707861200。PMID 18178554。
Van Damme P、Hole K、Pimenta-Marques A、Helsens K、Vandekerckhove J、Martinho RG、Gevaert K、Arnesen T。「NatFはタンパク質のN末端アセチル化の進化的変化に寄与し、正常な染色体分離に重要です」。PLoS遺伝学。7（7）：e1002169。土井：10.1371 /journal.pgen.1002169。PMC 3131286。PMID 21750686。”