Categories: 未分類

ZC3HC1

ZC3HC1
ALKの核相互作用パートナー(NIPA) 、また、ジンクフィンガーC3HC型タンパク質1(ZC3HC1)として知られているが、あるタンパク質、ヒトにおけるによってコードされていることをZC3HC1の 遺伝子に染色体7。 核の 細胞内位置でのみ発現しますが、多くの組織や細胞型で遍在的に発現しています。 NIPAは、有糸分裂への侵入の調節に関与するskp1キュリン Fボックス(SCF)型ユビキチンE3リガーゼ(SCFNIPA)複合タンパク質です。 ZC3HC1遺伝子には、冠状動脈疾患のリスク増加に関連する27のSNPの1つも含まれています。 ZC3HC1 識別子
エイリアス
ZC3HC1、NIPA、HSPC216、1を含むジンクフィンガーC3HCタイプ
外部ID
MGI:1916023 HomoloGene:32315 GeneCards:ZC3HC1
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 7番染色体(ヒト)
バンド 7q32.2 始める
130,018,287 bp
終わり
130,051,451 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 6番染色体(マウス)
バンド
6 | 6 A3.3
始める
30,366,380 bp
終わり
30,391,028 bp
遺伝子オントロジー
分子機能
• 亜鉛イオン結合• GO:0001948タンパク質結合• タンパク質キナーゼ結合• 金属イオン結合
細胞成分
• 核膜• 核
生物学的プロセス
• 細胞周期• リガンドの非存在下での外因性アポトーシスシグナル伝達経路の負の調節• タンパク質のユビキチン化• 細胞分裂
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみ Entrez51530 232679 Ensembl ENSG00000091732 ENSMUSG00000039130 UniProt Q86WB0 Q80YV2
RefSeq(mRNA)
NM_001282190 NM_001282191 NM_016478 NM_001363701 NM_172735 NM_001311086 RefSeq(タンパク質)
NP_001269119 NP_001269120 NP_057562 NP_001350630 NP_001298015 NP_766323 場所(UCSC)
Chr 7:130.02 – 130.05 Mb
Chr 6:30.37 – 30.39 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/

マウスの表示/

コンテンツ
1 構造
1.1 遺伝子 1.2 タンパク質
2 関数
3 モデル生物
4 臨床的関連性
4.1 臨床マーカー
5 参考文献
6 参考文献

構造

遺伝子
ZC3HC1の遺伝子は、バンド7q32.2に7番染色体上に存在し、14個の含むエキソンを。

タンパク質
NIPAは60kDaのE3リガーゼで、1つのC3HCタイプのジンクフィンガーと1つのFボックスのような領域が含まれています。 さらに、C末端の50残基領域(アミノ酸352-402)は核移行シグナル(NLS配列)として機能し、96残基領域(アミノ酸306-402)は)は、ホスホチロシン結合ドメインとして機能するます。 NIPAは核SCFNIPA複合体の1つの成分であり、3つのセリン残基Ser-354、Ser-359、およびSer-395でのNIPAのリン酸化は、複合体全体を不活性化することが実証されています。

関数
NIPAはヒト組織で広く発現しており、心臓、骨格筋、精巣で最も多く発現しています。これは、SCF型ユビキチン E3リガーゼを定義するヒトF-boxタンパク質であり、その形成は、NIPAの細胞周期依存性リン酸化によって調節されます。有糸分裂への侵入に不可欠なサイクリンB1は、間期のSCFNIPAの標的となります。NIPAのリン酸化はG2期に起こり、SCFコアからNIPAが解離し、適切なG2 / M移行に重要であることが証明されています。 SCFNIPA複合体によって駆動される核サイクリンB1の振動するユビキチン化は、有糸分裂開始のタイミングに寄与します。 NIPAはアポトーシスを遅らせることも報告されており、この抗アポトーシス機能にはNIPAの局在化が必要です。

モデル生物
Zc3hc1ノックアウトマウスの表現型
特性
表現型
ホモ接合体の生存率
異常な
劣性致死研究
普通
ホモ接合性の出産
異常な 体重 異常 不安 異常
神経学的評価 異常 握力 普通
ホットプレート
普通
異形学
異常
間接熱量測定
異常
ブドウ糖負荷試験
普通
聴性脳幹反応
普通 DEXA 異常
X線撮影 異常 体温 普通
目の形態
普通
臨床化学
普通
血液学
異常
末梢血リンパ球
異常
心臓の重量
普通
サルモネラ感染症
通常
シトロバクター感染症
通常
からのすべてのテストと分析
ZC3HC1機能の研究にはモデル生物が使用されています。Zc3hc1 tm1a(KOMP)Wtsi と呼ばれる条件付きノックアウトマウス系統は、国際ノックアウトマウスコンソーシアムプログラムの一部として生成されました。これは、関心のある科学者に病気の動物モデルを生成して配布するハイスループット突然変異誘発プロジェクトです。
オスとメスの動物は、欠失の影響を決定するために標準化された表現型スクリーニングを受けました。 変異マウスで22の試験が実施され、11の重大な異常が観察された。離乳時に同定されたホモ接合 変異マウスは予想よりも少なかった。突然変異体は低受胎であるように見え、オープンフィールドでの垂直活動が減少し、除脂肪体重が減少し、肋骨数が減少し、成熟B細胞数が減少しました。男性はまた、体重の減少、異常な姿勢、および非定型の間接熱量測定データを持っていました。女性はまた、異常に短い鼻と非定型の血液学パラメーターを持っていました。

臨床的関連性
ヒトでは、NIPAはゲノムワイド関連解析(GWAS)研究によって心血管疾患に関与しています。具体的には、ZC3HC1に位置する一塩基多型(SNP)は、冠状動脈疾患を予測することが示されています。 この予測は、冠状動脈疾患の現在の治療の主要な標的である高コレステロール値、高血圧、肥満、喫煙、糖尿病などの心血管疾患の従来の危険因子とは無関係であるように思われる。したがって、この遺伝子の機能を研究することで、新しい治療法の開発につながる冠状動脈疾患に寄与する新しい経路を特定できる可能性が

臨床マーカー
冠状動脈疾患に関連する遺伝子座7q32.2では、単一のSNP(rs11556924)のみが冠状動脈疾患のリスクに関連しており、強い連鎖不平衡に他の変異はありません。ZC3HC1遺伝子のrs11556924SNPは、NIPAのアミノ酸残基363でアルギニン-ヒスチジン多型をもたらします。さらに、rs11556924は、関節リウマチ患者の頸動脈内膜中膜の厚さの変化および心房細動のリスクの変化とも関連している。
さらに、ZC3HC1遺伝子を含む27の遺伝子座の組み合わせに基づく多遺伝子座遺伝子リスクスコア研究により、偶発的および再発性の冠状動脈疾患イベントの両方のリスクが高い個人、およびスタチン療法による臨床的利益の向上が特定されました。この研究は、コミュニティコホート研究(マルモダイエットおよび癌研究)と、一次予防コホート(JUPITERおよびASCOT)および二次予防コホート(CAREおよびPROVE IT-TIMI 22)の4つの追加のランダム化比較試験に基づいていました。

参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000091732 – Ensembl、2017年5月
^ GRCm38:Ensemblリリース89:ENSMUSG00000039130 – Ensembl、2017年5月
^ 「HumanPubMedリファレンス:」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Zhang QH、Ye M、Wu XY、Ren SX、Zhao M、Zhao CJ、Fu G、Shen Y、Fan HY、Lu G、Zhong M、Xu XR、Han ZG、Zhang JW、Tao J、Huang QH、Zhou J、Hu GX、Gu J、Chen SJ、Chen Z。「CD34 +造血幹/前駆細胞で発現された300のこれまで定義されていない遺伝子のオープンリーディングフレームを用いたcDNAのクローニングと機能分析」。ゲノム研究。10(10):1546–60。土井:10.1101 /gr.140200。PMC 310934。PMID 11042152。
  
^ “Entrez Gene:ZC3HC1ジンクフィンガー、1″を含むC3HCタイプ。
^ 「BioGPS-あなたの遺伝子ポータルシステム」。biogps.org 。取得した2016年10月11日を。
^ Bassermann F、von Klitzing C、MünchS、Bai RY、Kawaguchi H、Morris SW、Peschel C、Duyster J。「NIPAは、有糸分裂の開始を調節するSCFタイプの哺乳類E3リガーゼを定義しています」。セル。122(1):45–57。土井:10.1016 /j.cell.2005.04.034。PMID 16009132。S2CID 16122567。
  
^ Bassermann F、von Klitzing C、Illert AL、MünchS、Morris SW、Pagano M、Peschel C、Duyster J。「G2 / MでのALK(NIPA)の核相互作用パートナーのマルチサイトリン酸化にはサイクリンB1 / Cdk1が関与します」。Journal of BiologicalChemistry。282(22):15965–72。土井:10.1074 /jbc.M610819200。PMID 17389604。
^ Mega JL、Stitziel NO、Smith JG、Chasman DI、Caulfield MJ、Devlin JJ、Nordio F、Hyde CL、Cannon CP、Sacks FM、Poulter NR、Sever PS、Ridker PM、Braunwald E、Melander O、Kathiresan S 、Sabatine MS。「遺伝的リスク、冠状動脈性心臓病のイベント、およびスタチン療法の臨床的利益:一次および二次予防試験の分析」。ランセット。385(9984):2264–71。土井:10.1016 / S0140-6736(14)61730-X。PMC 4608367。PMID 25748612。
  
^ Ouyang T、Bai RY、Bassermann F、von Klitzing C、Klumpen S、Miething C、Morris SW、Peschel C、Duyster J。「未分化リンパ腫キナーゼ(NIPA)の核相互作用パートナーの同定と特性評価」。Journal of BiologicalChemistry。278(32):30028–36。土井:10.1074 /jbc.M300883200。PMID 12748172。
^ Kunnas T、Nikkari ST。「ジンクフィンガー、1(ZC3HC1)rs11556924を含む遺伝子変異体とフィンランド人集団における高血圧との関連、TAMRISK研究」。医学。94(32):e1221。土井:10.1097 /MD.0000000000001221。PMC 4616712。PMID 26266351。
  
^ 「ZC3HC1-ALKの核相互作用パートナー-ホモサピエンス(ヒト)-ZC3HC1遺伝子およびタンパク質」。www.uniprot.org 。取得した2016年10月11日を。
^ Bassermann F、Peschel C、Duyster J。「有糸分裂の侵入:振動する破壊の問題」。細胞周期。4(11):1515–7。土井:10.4161 /cc.4.11.2192。PMID 16258267。
^ 「Zc3hc1の体重データ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「Zc3hc1の不安データ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「Zc3hc1の神経学的評価データ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「Zc3hc1の異形データ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「Zc3hc1の間接熱量測定データ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「Zc3hc1のDEXAデータ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「Zc3hc1のX線撮影データ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「Zc3hc1の血液学データ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「Zc3hc1の末梢血リンパ球データ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「Zc3hc1のサルモネラ感染データ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「Zc3hc1のシトロバクター感染データ」。ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ Gerdin AK(2010)。「サンガーマウス遺伝学プログラム:ノックアウトマウスのハイスループット特性評価」。ActaOphthalmologica。88:925–7。土井:10.1111 /j.1755-3768.2010.4142.x。S2CID 85911512。
^ マウスリソースポータル、ウェルカムトラストサンガーインスティテュート。
^ 「国際ノックアウトマウスコンソーシアム」。
^ 「マウスゲノム情報」。
^ Skarnes WC、Rosen B、West AP、Koutsourakis M、Bushell W、Iyer V、Mujica AO、Thomas M、Harrow J、Cox T、Jackson D、Severin J、Biggs P、Fu J、Nefedov M、de Jong PJ、スチュワートAF、ブラッドリーA。「マウス遺伝子機能のゲノムワイド研究のための条件付きノックアウトリソース」。自然。474(7351):337–42。土井:10.1038 / nature10163。PMC 3572410。PMID 21677750。
  
^ ドルギンE。「マウスライブラリがノックアウトに設定されました」。自然。474(7351):262–3。土井:10.1038 / 474262a。PMID 21677718。
^ Collins FS、Rossant J、Wurst W。「あらゆる理由でマウス」。セル。128(1):9–13。土井:10.1016 /j.cell.2006.12.018。PMID 17218247。S2CID 18872015。
  
^ van der Weyden L、White JK、Adams DJ、Logan DW(2011)。「マウス遺伝学ツールキット:機能とメカニズムを明らかにする」。ゲノム生物学。12(6):224 DOI:10.1186 / GB-2011-12-6-224。PMC 3218837。PMID 21722353。
  
^ Jones PD、Kaiser MA、Ghaderi Najafabadi M、McVey DG、Beveridge AJ、Schofield CL、Samani NJ、Webb TR。「1(ZC3HC1)を含むジンクフィンガーC3HCタイプの冠状動脈疾患関連コーディングバリアントは細胞周期調節に影響を与える」。Journal of BiologicalChemistry。291(31):16318–27。土井:10.1074 /jbc.M116.734020。PMC 4965579。PMID 27226629。
  
^ Jones PD、Kaiser MA、Ghaderi Najafabadi M、McVey DG、Beveridge AJ、Schofield CL、Samani NJ、Webb TR。「1(ZC3HC1)を含むジンクフィンガーC3HCタイプの冠状動脈疾患関連コーディングバリアントは細胞周期調節に影響を与える」。Journal of BiologicalChemistry。291(31):16318–27。土井:10.1074 /jbc.M116.734020。PMC 4965579。PMID 27226629。
  
^ Bassermann F、von Klitzing C、MünchS、他。。「NIPAは、有糸分裂の開始を調節するSCFタイプの哺乳類E3リガーゼを定義しています」。セル。122(1):45–57。土井:10.1016 /j.cell.2005.04.034。PMID 16009132。S2CID 16122567。
  
^ López-MejíasR、ジャンルF、García-BermúdezM、Corrales A、González-JuanateyC、Llorca J、Miranda-Filloy JA、Rueda-Gotor J、Blanco R、CastañedaS、MartínJ、González-GayMA(2013 -01-01)。「ZC3HC1rs11556924多型は、関節リウマチ患者の頸動脈内膜中膜の厚さの増加に関連しています」。関節炎の研究と治療。15(5):R152。土井:10.1186 / ar4335。PMC 3978706。PMID 24286297。
  
^ 山瀬悠、加藤晃、堀部晃、上山晃、藤巻毅、小栗晃、新井晃、渡辺晋、室原毅、山田悠。「遺伝的変異と心房細動との関連」。生物医学レポート。4(2):178–182。土井:10.3892 /br.2015.551。PMC 4734142。PMID 26893834。
  

参考文献
Dias Neto E、Correa RG、Verjovski-Almeida S、Briones MR、Nagai MA、da Silva W、Zago MA、Bordin S、Costa FF、Goldman GH、Carvalho AF、Matsukuma A、Baia GS、Simpson DH、Brunstein A、de Oliveira PS、Bucher P、Jongeneel CV、O’Hare MJ、Soares F、Brentani RR、Reis LF、de Souza SJ、Simpson AJ。「ORF発現配列タグを用いたヒトトランスクリプトームのショットガンシーケンシング」。アメリカ合衆国科学アカデミー紀要。97(7):3491–6。土井:10.1073 /pnas.97.7.3491。PMC  16267。PMID  10737800。
Hartley JL、Temple GF、Brasch MA。「invitro部位特異的組換えを使用したDNAクローニング」。ゲノム研究。10(11):1788–95。土井:10.1101 /gr.143000。PMC  310948。PMID  11076863。
Ouyang T、Bai RY、Bassermann F、von Klitzing C、Klumpen S、Miething C、Morris SW、Peschel C、Duyster J。「未分化リンパ腫キナーゼ(NIPA)の核相互作用パートナーの同定と特性評価」。Journal of BiologicalChemistry。278(32):30028–36。土井:10.1074 /jbc.M300883200。PMID  12748172。
Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、Schleeger S、Mehrle A、Bechtel S、Sauermann M、Korf U、Pepperkok R、SültmannH、Poustka A。「ORFeomeから生物学へ:機能ゲノミクスパイプライン」。ゲノム研究。14(10B):2136–44。土井:10.1101 /gr.2576704。PMC  528930。PMID  15489336。
Bassermann F、von Klitzing C、MünchS、Bai RY、Kawaguchi H、Morris SW、Peschel C、Duyster J。「NIPAは、有糸分裂の開始を調節するSCFタイプの哺乳類E3リガーゼを定義しています」。セル。122(1):45–57。土井:10.1016 /j.cell.2005.04.034。PMID  16009132。S2CID  16122567。
Ambrogio C、Voena C、Manazza AD、Piva R、Riera L、Barberis L、Costa C、Tarone G、Defilippi P、Hirsch E、Boeri Erba E、Mohammed S、Jensen ON、Palestro G、Inghirami G、Chiarle R(12月2005)。「p130Casは未分化リンパ腫キナーゼの形質転換特性を仲介します」。血。106(12):3907–16。土井:10.1182 / blood-2005-03-1204。PMC  1895100。PMID  16105984。
Mehrle A、Rosenfelder H、Schupp I、del Val C、Arlt D、Hahne F、Bechtel S、Simpson J、Hofmann O、Hide W、Glatting KH、Huber W、Pepperkok R、Poustka A、Wiemann S。「2006年のLIFEdbデータベース」。核酸研究。34(データベースの問題):D415–8。土井:10.1093 / nar / gkj139。PMC  1347501。PMID  16381901。
Beausoleil SA、VillénJ、Gerber SA、Rush J、Gygi SP。「高スループットのタンパク質リン酸化分析と部位局在化のための確率ベースのアプローチ」。ネイチャーバイオテクノロジー。24(10):1285–92。土井:10.1038 / nbt1240。PMID  16964243。S2CID  14294292。
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M。「シグナル伝達ネットワークにおけるグローバル、インビボ、および部位特異的リン酸化ダイナミクス」。セル。127(3):635–48。土井:10.1016 /j.cell.2006.09.026。PMID  17081983。S2CID  7827573。

admin

Share
Published by
admin

Recent Posts

Zwischenwasser

Zwischenwasser …

2週間 ago

Zăvoi

Zăvoi その他の使用法につ…

2週間 ago

ZygmuntAleksanderWnęk

Zygmunt_Aleksan…

2週間 ago

ズリック

Zulick Zulickは名…

2週間 ago

スヴァリキノ

Zvarykino スヴァリキ…

2週間 ago

ZuluTrade

ZuluTrade 記事では、…

2週間 ago