ZNF238


ZNF238
ジンクフィンガータンパク質238(RP58またはZBTB18としても知られています)は、ヒトではZNF238遺伝子によってコードされる転写因子を含むジンクフィンガーです。 ZBTB18 識別子
エイリアス
ZBTB18、C2H2-171、MRD22、RP58、TAZ-1、ZNF238、ジンクフィンガーおよび18を含むBTBドメイン
外部ID
OMIM:608433 MGI:1353609 HomoloGene:21276 GeneCards:ZBTB18
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 1番染色体(ヒト)
バンド 1q44 始める
244,048,939 bp
終わり
244,057,476 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 1番染色体(マウス)
バンド
1 | 1 H4
始める
177,442,351 bp
終わり
177,450,764 bp
RNA発現パターン
その他の参照式データ
遺伝子オントロジー
分子機能
• GO:0001131、GO:0001151、GO:0001130、GO:0001204 DNA結合転写因子活性• 核酸結合• DNA結合• 配列特異的DNA結合• 金属イオン結合• GO:0001948タンパク質結合• GO:0001105転写コアクチベーター活性• GO:0001200、GO:0001133、GO:0001201 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
細胞成分
• 核染色体• 核
生物学的プロセス
• 多細胞生物の発達• 転写の負の調節、DNAテンプレート• 転写の調節、DNAテンプレート• RNAポリメラーゼIIによる転写の負の調節• 骨格筋組織の発達• 転写、DNAテンプレート• RNAポリメラーゼIIによる転写の正の調節• DNA損傷刺激に対する細胞応答
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみ Entrez10472 30928 Ensembl ENSG00000179456 ENSMUSG00000063659 UniProt Q99592 Q9WUK6
RefSeq(mRNA)
NM_001278196 NM_006352 NM_205768
NM_001012330 NM_013915 NM_001355098 NM_001355099 NM_001355100
NM_001355101 NM_001355102 NM_001355103
RefSeq(タンパク質)
NP_001265125 NP_006343 NP_991331
NP_001012330 NP_038943 NP_001342027 NP_001342028 NP_001342029
NP_001342030 NP_001342031 NP_001342032
場所(UCSC)
Chr 1:244.05 – 244.06 Mb
Chr 1:177.44 – 177.45 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/

マウスの表示/

コンテンツ
1 関数
2 相互作用
3 参考文献
4 参考文献
5 外部リンク

関数
ZNF238は、「適切な層形成と皮質成長につながる、秩序だった正しいタイミングの神経新生の促進」において主要な役割を果たす遺伝子です。 ZNF238の喪失は、小頭症、脳梁の無形成、大脳皮質の層の奇形、および小脳形成不全を引き起こすことが観察されています。さらに、その欠如は、Ngn2およびNeurod1の減少(前駆細胞における、および変異ニューロンにおけるその増加)を引き起こし、その結果、前駆細胞が減少し、ニューロンの分化およびグリア細胞の成長が増加する可能性が ZNF238は抑制された遺伝子も調節し、チェックしないままにすると神経膠腫の進行につながる可能性がさらに、ZNF238の欠如は、上皮間葉転換プロセスのアップレギュレーションをもたらします。
腫瘍など髄芽腫、ZNF238の損失がcellularly多様な新生物で、その結果、腫瘍の細胞分割プロセスをdisorganizeことができます。この新しい多様性は、腫瘍の浸潤性を高め、ZNF238が失われる前よりも脳のより多くの領域に増殖をもたらすことが観察されています。
ZNF238などのC2H2タイプのジンクフィンガータンパク質は、転写活性化因子または抑制因子として分子レベルで作用し、クロマチンアセンブリーに関与しています。

相互作用
ZNF238はDNMT3Aと相互作用することが示されています。

参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000179456 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38:Ensemblリリース89:ENSMUSG00000063659 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Becker KG、Lee IJ、Nagle JW、Canning RD、Gado AM、Torres R、Polymeropoulos MH、Massa PT、Biddison WE、Drew PD(1997年11月)。「C2H2-171:脳で優先的に発現される発生的に調節されたPOZドメイン/ジンクフィンガータンパク質を表す新規ヒトcDNA」。発達神経科学の国際ジャーナル。15(7):891–9。土井:10.1016 / S0736-5748(97)00034-8。PMID 9568537。S2CID 37032889。    ^ 青木K、石田R、葛西M(1997年1月)。「トランスリン様タンパク質、TRAXをコードするcDNAの単離と特性化」。FEBSレター。401(2–3):109–12。土井:10.1016 / S0014-5793(96)01444-5。PMID 9013868。S2CID 46704829。    ^ Xiang C、Baubet V、Pal S、Holderbaum L、Tatard V、Jiang P、他 。「RP58 / ZNF238は神経新生促進遺伝子レベルを直接調節し、ニューロンの分化と脳の拡張に必要です」。細胞死と分化。19(4):692–702。土井:10.1038 /cdd.2011.144。PMC 3307985。PMID 22095278。    ^ 「Entrez遺伝子:ZNF238ジンクフィンガータンパク質238」。
^ Fuks F、Burgers WA、Godin N、Kasai M、Kouzarides T。「Dnmt3aはデアセチラーゼに結合し、配列特異的なリプレッサーによって動員されて転写を抑制します」。EMBOジャーナル。20(10):2536–44。土井:10.1093 / emboj /20.10.2536。PMC 125250。PMID 11350943。   

参考文献
Adams MD、Kerlavage AR、Fleischmann RD、Fuldner RA、Bult CJ、Lee NH、Kirkness EF、Weinstock KG、Gocayne JD、White O(1995年9月)。「8300万ヌクレオチドのcDNA配列に基づくヒト遺伝子の多様性と発現パターンの初期評価」。自然(PDF)。377(6547 Suppl):3–174。PMID  7566098。
Becker KG、Nagle JW、Canning RD、Biddison WE、Ozato K、Drew PD(1995年4月)。「ヒトの脳で発現する118の新規C2H2型ジンクフィンガーcDNAの迅速な単離と特性評価」。人間の分子遺伝学。4(4):685–91。土井:10.1093 / hmg /4.4.685。PMID  7633419。
青木K、孟G、鈴木K、高志T、亀岡Y、中原K、石田R、葛西M(1998年10月)。「RP58は凝縮したクロマチンと結合し、配列特異的な転写抑制を仲介します」。Journal of BiologicalChemistry。273(41):26698–704。土井:10.1074 /jbc.273.41.26698。PMID  9756912。
Ahmad KF、Engel CK、PrivéGG(1998年10月)。「PLZFからのBTBドメインの結晶構造」。アメリカ合衆国科学アカデミー紀要。95(21):12123–8。Bibcode:1998PNAS … 9512123F。土井:10.1073 /pnas.95.21.12123。PMC  22795。PMID  9770450。
孟G、稲沢J、石田R、戸倉K、中原K、青木K、葛西M。「ヘテロクロマチンに関連する配列特異的トランスリプレッサーであるRP58をコードする遺伝子の構造解析」。遺伝子。242(1–2):59–64。土井:10.1016 / S0378-1119(99)00477-1。PMID  10721697。
Fuks F、Burgers WA、Godin N、Kasai M、Kouzarides T。「Dnmt3aはデアセチラーゼに結合し、配列特異的なリプレッサーによって動員されて転写を抑制します」。EMBOジャーナル。20(10):2536–44。土井:10.1093 / emboj /20.10.2536。PMC  125250。PMID  11350943。

外部リンク
ZNF238 +タンパク質、+米国国立医学図書館の医学主題見出し(MeSH)のヒト
には、パブリックドメインにある米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。
Stub
  人間の1番染色体上の遺伝子に関するこ