ZNF837
ZNF837は、ヒトではZNF837遺伝子によってコードされるタンパク質であり、はマイナス鎖方向で19q13.431に位置しています。 ZNF837タンパク質は、C2H2タイプのジンクフィンガータンパク質として特徴付けられます。
コンテンツ
1 相同性と進化
2 人間ZNF837
2.1 遺伝子変異体 2.2 翻訳後 2.3 表現
3 参考文献
相同性と進化
ZNF837ホモログのタンパク質配列のアラインメントに基づく根のない系統樹。
ヒトZNF837は、多くの哺乳類に存在し、より遠くに見られる相同体を持っています。すべての同族体は脊索動物です。すべてにCOG5048ドメインとZf-C2H2_2ドメインの両方が含まれています。これらのドメインが見つかったエリアには、最も高い保護率が含まれています。ヒトでは、5つのZf-H2C2ダブルドメインと2つのCOG5048ドメインが存在します。
タンパク質配列は、これらのホモログ間で急速に進化しています。
ZNF837ホモログは、ホモサピエンスから分岐した日付に対してグラフ化されたヒトタンパク質との類似性パーセントです。また、ZNF837タンパク質の進化の速度を決定するために、ゆっくりと進化するタンパク質であるシトクロムCと、急速に進化するタンパク質であるフィブリノーゲンもグラフ化されています。
ZNF837には、ヒトに多数のパラログがあり、そのすべてがジンクフィンガータンパク質です。
人間ZNF837
ヒトでは、他のエイリアスはなく、その隣接遺伝子はMIR4754、A1BG、およびRPS5です。機能タンパク質となるZNF837mRNAには1921ヌクレオチドが含まれており、そのうち222-1817は3つのエクソンを含むタンパク質に翻訳されています。このタンパク質は、重量が58，078 Da、等電点が9.525の531個のアミノ酸で構成されています。
遺伝子変異体
2つのトランスクリプトバリアントが転写変異体1、長さ2050塩基対は、ナンセンス変異依存mRNA分解のため、非コードです。転写変異体2は、代替のスプライス部位のために機能性タンパク質になります
翻訳後
高度な保存により、T386、T455、S460、Y503に4つのリン酸化部位があると予測されています。内部構造には、アルファヘリックス、ベータシート、および主にランダムコイルの組み合わせが含まれます。
Phyre2によって予測されたZNF837の一部の構造。構造は、シーケンスの37％に対して99.9％の信頼度で一致します。
表現
ZNF837は、膵臓、肝臓、子宮、および筋細胞で観察されています。すべての場合において、濃度は低いです。しかしながら、ZNF837の発現が最も影響を与えるのは、正常な状態と病気の状態を比較した場合です。見ることができる一貫した変化が
参考文献
^ シュトラウスベルク、RL; ファインゴールド、EA; ライチョウ、LH; etal。。「15，000を超える完全長のヒトおよびマウスのcDNA配列の生成と初期分析」。国立科学アカデミーの議事録。99（26）：16899–16903。Bibcode：2002PNAS … 9916899M。土井：10.1073 /pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
^ 「ZNF837ジンクフィンガータンパク質837 -遺伝子-NCBI」。
^ Pieler、T。; Bellefroid、E。（1994）。「ジンクフィンガータンパク質の機能と進化に関する展望-最新情報」。分子生物学レポート。20（1）：1–8。土井：10.1007 / bf00999848。PMID 7531280。 ^ Iuchi、S（2001）。「C2H2ジンクフィンガータンパク質の3つのクラス」。細胞および分子生命科学。58（4）：625–635。土井：10.1007 / pl00000885。PMID 11361095。 ^ 「NCBI保存ドメイン検索」。
^ 「ZNF837タンパク質-タンパク質-NCBI」。
^ 「ZNF837（人間）」。
^ Maquat、Lynne E（2002）。「ナンセンス変異依存mRNA分解」。カレントバイオロジー。12（6）：R196–R197。土井：10.1016 / S0960-9822（02）00747-9。PMID 11909543。 ^ 「ZNF837（人間）」。
^ ブロム、ニコライ; ガンメルトフト、スティーン; Brunak、Søren（1999）。「真核生物のタンパク質リン酸化部位の配列および構造に基づく予測1」。分子生物学ジャーナル。294（5）：1351–1362。土井：10.1006 /jmbi.1999.3310。PMID 10600390。 ^ Guo、Ailan etal。セリン、スレオニン、およびチロシンのリン酸化部位。特許US20110045603A1。2010年4月20日。印刷。
^ ケリー、LA; Sternberg、MJE（2009）。「Webでのタンパク質構造予測：Phyreサーバーを使用したケーススタディ」。ネイチャープロトコル。4（3）：363–371。土井：10.1038 /nprot.2009.2。hdl：10044/1/18157。PMID 19247286。 ^ 「ESTプロファイル-Hs.222236」。”